2020 Fiscal Year Annual Research Report
Analysis of microbiome and epigenetics for the development of novel biomarker in Gastrointestinal cancers
| Project/Area Number |
17KK0195
|
|---|
| Research Institution | Kumamoto University |
|---|
Principal Investigator |
馬場 祥史 熊本大学, 病院, 特任准教授 (20599708)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2018 – 2020
|
| Keywords | Microbiome / Fusobacterium / 大腸癌 / 食道癌 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
消化器癌におけるMicrobiome(ヒト微生物叢)とエピジェネティック変化(LINE-1≒ゲノム全体のメチル化)の関連を網羅的に解析し、革新的なbiomarkerを開発することが現在実施中の科研費（基課題）の目的である。現在、私たちが構築した500例以上の食道癌データバンクを用いてFusobacteriumという候補microbiomeを同定しえたので、今後は このFusobacteriumが食道癌以外の消化器癌においても意義を有するのかを検討すること が必要である。今回の国際共同研究の目的は、ハーバード大学ダナ・ファーバー癌研究所 Molecular Pathological Epidemiology (MPE) Laboratoryの所有する大規模な前向き疫学コホートのサンプルを用いて、上記A, Bに関して検証することである。申請者は、2019年3月26日に渡米し、9月末までダナ・ファーバー癌研究所で共同研究を行った。ダナ・ファーバー癌研究所のコホートを用いて、大腸癌においてFusobacteriumとautophagyとの関係を示すことができ、共著者として J Pathol誌に発表した。また、大腸癌パラフィン包埋組織を用いたメタボローム解析についても従事し、その結果はMol Cancer Res誌に発表している。さらに、machine learningによる大腸癌組織中の免疫細胞の網羅的解析に関しても従事し、その結果はClin Cancer Res誌に掲載された。腫瘍免疫細胞の中でも腫瘍関連マクロファージの多重蛍光免疫染色による評価に関しても従事し、その研究成果はCancer Immunol Res誌に発表した。現在は、それら習得した研究解析手法を用いて食道癌を中心とした上部消化管癌における腫瘍免疫とLINE-1メチル化の関連解析を進めているところである。
|
