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2020 Fiscal Year Research-status Report

Interactome analysis to understand the cause of variations in neurodegenerative diseases

Research Project

Project/Area Number 17KT0131
Research InstitutionDoshisha University

Principal Investigator

山中 智行  同志社大学, 研究開発推進機構, 准教授 (00381575)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 下郡 智美  国立研究開発法人理化学研究所, 脳神経科学研究センター, チームリーダー (30391981)
Project Period (FY) 2017-07-18 – 2022-03-31
Keywords神経変性疾患 / プロテオミクス / αシヌクレイン / ALS
Outline of Annual Research Achievements

神経変性疾患で未だ解決されていない問題の一つは、なぜ疾患ごとに特異的な領域が障害されるのかということである。さらに、αシヌクレインのようにタンパク質は同じでも、パーキンソン病、多系統萎縮症やレビー小体型認知症など、異なる疾患で凝集していることも知られ、より複雑性を増加させている。どのようにして、このような病態の特異性・多様性が生じるのか、その分子機序の解明は、疾患の発症予防や治療に重要と考えられるが、まだ多くが不明である。本研究は、オミックス、特にプロテオミクスを基盤とした研究により、この問題解明を目指すものである。本年度は、αシヌクレインの凝集体を蛍光標識し、マウス脳内に注入後にフローサイトメトリーで回収し、その局在部位を質量分析にて検討した所、シナプス画分に濃縮されていることを明らかとした(Kasahara J et al. Neurosci Res. 2020)。また、小胞体膜タンパク質であるVAPBについて、その野生型とALS関連変異体を神経系細胞に発現させ、免疫沈降した後質量分析を行うことにより、変異により小胞体のドメイン特性や小胞体-オルガネラ間の相互作用が減少していることを見出した(Yamanaka T et al. Sci Rep. 2020)。また、第93回日本生化学会のシンポジウムにて口頭発表も行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

フローサイトメトリーや免疫沈降法により、凝集体を含む細胞画分を限局し質量分析解析を行うことができるようになってきた。その結果、これまでのバルクでは見えなかった特異的な凝集体プロテオームを同定することに成功しつつある。

Strategy for Future Research Activity

今後は、マウス脳に構造の異なる凝集体を導入し、細胞内での凝集体の多様性について、生化学的解析を進めるとともに、これら凝集体の分離・精製をさらに進め、網羅的質量解析を行うことにより、凝集体の構造依存的なインタラクトームを解明し、病態多様性との関連性を明らかとする。

Causes of Carryover

これまでに、αシヌクレインの凝集体構造を解析する系を確立し、ヒトの疾患変異によって、異なる凝集体構造を形成すること(BBA 2019, BBRC 2019)、さらに、同解析系がヒト疾患由来のαシヌクレイン凝集体の構造特定にも有用であることを見出してきた(BBRC 2020)。しかし、より信頼性の高い成果を得るため、タグを排除し、イオン交換カラムやゲルろ過で精製したより純度の高いαシヌクレインタンパク質が必要となった。その確立に時間がかかったため、多額の費用がかかる動物実験や網羅的質量分析を次年度に回すことになった。

  • Research Products

    (7 results)

All 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] The University of Texas(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      The University of Texas
  • [Journal Article] Proteomics-Based Approach Identifies Altered ER Domain Properties by ALS-Linked VAPB Mutation2020

    • Author(s)
      Yamanaka Tomoyuki、Nishiyama Risa、Shimogori Tomomi、Nukina Nobuyuki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 7610

    • DOI

      10.1038/s41598-020-64517-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] FACS-array?based cell purification yields a specific transcriptome of striatal medium spiny neurons in a murine Huntington disease model2020

    • Author(s)
      Miyazaki Haruko、Yamanaka Tomoyuki、Oyama Fumitaka、Kino Yoshihiro、Kurosawa Masaru、Yamada-Kurosawa Mizuki、Yamano Risa、Shimogori Tomomi、Hattori Nobutaka、Nukina Nobuyuki
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 295 Pages: 9768~9785

    • DOI

      10.1074/jbc.RA120.012983

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Gene expression profiling in neuronal cells identifies a different type of transcriptome modulated by NF-Y2020

    • Author(s)
      Yamanaka Tomoyuki、Miyazaki Haruko、Tosaki Asako、Maity Sankar N.、Shimogori Tomomi、Hattori Nobutaka、Nukina Nobuyuki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 21714

    • DOI

      10.1038/s41598-020-78682-8

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Proteomic analysis of subcellular compartments containing disseminated alpha-synuclein seeds2020

    • Author(s)
      Kasahara Junya、Imamura Yukio、Hiyama Akiko、Yamanaka Tomoyuki、Miyazaki Haruko、Nukina Nobuyuki
    • Journal Title

      Neuroscience Research

      Volume: 20 Pages: 30494-6

    • DOI

      10.1016/j.neures.2020.11.009

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] オルガネラ係留タンパク質VAPBのALS変異による小胞体プロテオーム変化2020

    • Author(s)
      山中智行、西山里瑳、下郡智美、貫名信行
    • Organizer
      第93回日本生化学会
  • [Remarks] 同志社大学大学院脳科学研究科

    • URL

      https://brainscience.doshisha.ac.jp/

URL: 

Published: 2021-12-27  

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