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2006 Fiscal Year Annual Research Report

がんの個性の分子診断のための人工機能性核酸

Research Project

Project/Area Number 18014012
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

岡本 晃充  独立行政法人理化学研究所, 岡本独立主幹研究ユニット, 独立主幹研究員 (60314233)

Keywordsがん / 一塩基多型 / 遺伝子解析 / ヌクレオシド / 蛍光
Research Abstract

本研究では、がん遺伝子をターゲットとした簡便変異解析システムを開発することはもちろんのこと、本提案の分子システムが遺伝子多型解析法を一変させるオプティカルデバイスとして作用する日本発の遺伝子解析技術を世界に提供することを目指した。その成果として、(1)本研究の基礎になる塩基識別型蛍光性核酸塩基のライブラリーの作成を強力に押し進め、その結果として、微視的環境によって蛍光が変化する新しい蛍光色素を導入した蛍光性塩基を作成した。これを核酸塩基に導入して新しい塩基識別型蛍光性核酸を得た。この蛍光色素を使うことによって、透過率などの面で検出装置の簡素化できるだけでなく、2波長検出系での遺伝子多型解析システムの開発が期待できる。(2)塩基識別型蛍光性核酸塩基を含む核酸プローブの設計を指針化した。がん関連遺伝子BRCA1での変異やフィラデルフィア染色体遺伝子BCR/ABLなどのタイピングを行うためのプローブを設計し、それらの蛍光応答を確認した。(3)オーダーメイド医療のために必要な塩基識別型蛍光性核酸のアレイを作成した。今回作成した核酸プローブは、溶液中で混ぜるだけで配列を判別できる。私は、核酸プローブをチップ上に固定化し、アレイの作成を試みた。担体上で標的核酸をハイブリダイゼーションさせたときに蛍光強度が減少したものの、蛍光発光は確認された。

  • Research Products

    (6 results)

All 2007 2006

All Journal Article (6 results)

  • [Journal Article] Methylation-Selective Fluorescence Quenching by Osmium Complexation2007

    • Author(s)
      Tanaka, K.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. 15 (4)

      Pages: 1615-1621

  • [Journal Article] DNA hole transport : application to effective photoelectrochemical SNP typing2006

    • Author(s)
      Okamoto, A.
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc. 128 (2)

      Pages: 658-662

  • [Journal Article] Electrochemical Evaluation of Alternating Duplex-Triplex Conversion Effect on the Anthraquinone-Photoinduced Hole Transport through DNA Duplex Immobilized on a Gold Electrode2006

    • Author(s)
      Tanabe, K.
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc. 128 (3)

      Pages: 692-693

  • [Journal Article] Simple SNP typing assay using a base-discriminating fluorescent probe2006

    • Author(s)
      Okamoto, A.
    • Journal Title

      Mol. BioSyst. 2 (2)

      Pages: 122-127

  • [Journal Article] Sequence-selective osmium oxidation of DNA : Efficient distinction between 5-methylcytosine and cytosine2006

    • Author(s)
      Okamoto, A.
    • Journal Title

      Org. Biomol. Chem. 4 (9)

      Pages: 1638-1640

  • [Journal Article] Nile Red nucleoside : Design of a solvatofluorochromic nucleoside as an indicator of micropolarity around DNA2006

    • Author(s)
      Okamoto, A.
    • Journal Title

      J. Org. Chem. 71 (9)

      Pages: 3592-3598

URL: 

Published: 2008-05-08   Modified: 2016-04-21  

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