System-level Understanding of Intercellular Interactions

2008 Fiscal Year Self-evaluation Report

• Project/Area Number: 18016031
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: The Institute of Physical and Chemical Research
• Principal Investigator: UEDA, The Institute of Physical and Chemical Research, システムバイオロジー研究チーム, チームリーダー (20373277)
• Project Period (FY): 2006 – 2009
• Keywords: 体内時計 / 細胞間相互作用 / 再構成 / 転写制御 / 位相 / 哺乳類

Research Abstract

動的で複雑な生命現象を理解することは一般的に難しく、その解明のための手法・研究戦略は発展途上の段階である。特に多細胞生物を多細胞生物たらしめている細胞間相互作用を担う動的で複雑なシステムを体系的・効率的に同定・解析していく手法・研究戦略については、まだ確立されているとは言えない。我々は、動的で複雑な細胞間相互作用の一つである哺乳類の概日時計における細胞間相互作用をモデル系とし、インシリコ・インビボにおいて細胞間相互作用の遺伝子ネットワークを設計・再構成することで、予測されうるメカニズムの再構成的証明を行う。これらの解析を通して細胞間相互作用の設計原理を理解するとともに、細胞分化など細胞間相互作用を要とする他の生命現象にも応用可能な研究戦略を提供する。

Research Products

• [Journal Article] Proof-by-Synthesis of the Transcriptional Logic of Mammalian Circadian Clocks (2008)
  • Author(s): Ukai-Tadenuma, M., Kasukawa, T. and Ueda, H.R
  • Journal Title: Nature Cell Biology 10 Pages: 1154-1163
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Melanopsin-dependent photo-perturbation reveals desynchronization underlying the singularity of mammalian circadian clocks (2007)
  • Author(s): Ukai, H., Kobayashi, T.J., Nagano, M., Masumoto, K., Sujino, M., Kondo, T., Yagita K., Shigeyoshi, Y. and Ueda, H.R.
  • Journal Title: Nature Cell Biology 9 Pages: 1327-1334
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Feedback repression is required for mammalian circadian clock function (2006)
  • Author(s): Sato, T.K., Yamada, R.G., Ukai, H., Baggs, J.E., Miraglia, L.J., Kobayashi, T.J., Welsh, D.K., Kay, S.A., Ueda, H.R. and Hogenesch, J.B
  • Journal Title: Nature Genetics 38 Pages: 312-319
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 哺乳類体内時計の制御と設計 (2007)
  • Author(s): 上田泰己
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会(BMB2007)
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 20071200
• [Presentation] Analysis and synthesis of circadian clocks (2006)
  • Author(s): 上田泰己
  • Organizer: 第13回日本時間生物学会学術大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 20061200
• [Presentation] 細胞集団の振る舞いとして理解する概日時計 (2006)
  • Author(s): 上田泰己
  • Organizer: 第40回日本発生生物学会・第59回日本細胞生物学会 合同大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 20060500
• [Book] 体内時計のシンギュラリティ現象の解明(Vol.14, No.1) (2008)
  • Author(s): 上田泰己
  • Total Pages: 2-8(6)