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2009 Fiscal Year Annual Research Report

分子集団系の自由エネルギー理論計算

Research Project

Project/Area Number 18066020
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

岡崎 進  Nagoya University, 工学研究科, 教授 (70194339)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山田 篤志  名古屋大学, 工学研究科, 助教 (10390676)
Keywords分子動力学法 / 自由エネルギー / 量子ダイナミクス / ミセル / プロトン移動
Research Abstract

零点振動など量子化された振動状態やトンネル移動などの状態間遷移といった反応における核の量子性を取り入れた計算科学的研究を可能とするために、凝縮系における核の量子ダイナミクスに対するシミュレーションの新規手法の開発を量子古典混合近似を基礎に展開し、これを適用いて溶液中のプロトン移動に対する量子反応過程の描像を得るための準備をこれまでに行ってきた。本年度は、水溶液中におけるマロンアルデヒド分子のプロトン移動反応のシミュレーションを実行し、反応に対する量子効果と溶媒効果に対する分子論的な解析を行った。量子古典混合近似に基づく本シミュレーション手法が量子反応動力学に対する量子性と溶媒効果の解析に有効であることが示された。
一方、可溶化分子を含むミセルの水溶液中における熱力学的安定性を評価することを目指し、メタンからオクタンまでのアルカン分子をバルク水溶液からSDSミセルコアヘ移動する際の自由エネルギー変化を分子動力学法によりこれまでに算出してきており、本年度は、可溶化に伴う熱力学的安定性の微視的描像を得るための分子論的解析を行った。特にミセル中のアルカン分子の分布や、可溶化するアルカンの構造について検討を行った。さらに、ミセルと溶質分子の重心間距離を可溶化の反応座標とした自由エネルギープロフィールの計算手法を確立し、プログラムが完成した。まずは水分子とメタンを溶質に選び計算を行った。今後は十分な統計量をとることにより精度のよい自由エネルギープロフィールが得られる予定である。

  • Research Products

    (4 results)

All 2009

All Presentation (4 results)

  • [Presentation] 極性分子のSDSミセルへの可溶化自由エネルギー計算2009

    • Author(s)
      藤本和士、吉井範行、岡崎進
    • Organizer
      第23回分子シミュレーション討論会
    • Place of Presentation
      名古屋市中小企業振興会館
    • Year and Date
      20091130-20091202
  • [Presentation] 溶液中の分子内プロトン移動反応に対する量子古典混合系分子動力学シミュレーション2009

    • Author(s)
      山田篤志、岡崎進
    • Organizer
      第32回溶液化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      新潟コンベンションセンター
    • Year and Date
      20091118-20091120
  • [Presentation] Molecular Dynamics Calculation for Biomembrane2009

    • Author(s)
      Susumu Okazaki
    • Organizer
      Fifty Years of Biophysics Research at Nagoya University
    • Place of Presentation
      Nagoya University
    • Year and Date
      20090312-20090314
  • [Presentation] Mixed Quantum-Classical Molecular Dynamics Simulation of Intramolecular Proton Transfer Reaction in Solution : One-Dimensional Quantization Model Study2009

    • Author(s)
      A.Yamada, S.Okazaki
    • Organizer
      The 69th Okazaki Conference on "New Frontier in Quantum Chemical Dynamics"
    • Place of Presentation
      Okazaki Conference Center
    • Year and Date
      20090221-20090223

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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