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2009 Fiscal Year Annual Research Report

塩基識別型蛍光核酸塩基の分子設計と画期的な遺伝子検出法の開発

Research Project

Project/Area Number 18201026
Research InstitutionNihon University

Principal Investigator

齋藤 烈  Nihon University, 工学部, 教授 (20026082)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 齋藤 義雄  日本大学, 工学部, 講師 (40385985)
KeywordsDNAチップ / ナノバイオ / ゲノム / 遺伝子診断 / 蛍光分子
Research Abstract

現在市販されているDNAチップでは、発現した遺伝子の有無を判定する事はできるが、誤差が大きく定量することは極めてむずかしく、加えてその遺伝子内の1塩基多形(SNP)を検出するには、かなり高度の技術が必要とされる。我々は、最近独自のコンセプトに基づき、相手塩基を識別して蛍光を発する画期的な蛍光性核酸塩基を開発した。我々が独自に開発した方法は、PCR時に蛍光ラベリングを必要とせず、現在世界を席巻している外国製のDNAチップのもつ欠陥のほとんどを克服した画期的なものであり、更に改良を加えて国内外で今後広く使われる事を目標としている。
画期的なDNAチップにするためには、よりS/N比が高くより長波長で塩基選択的に蛍光を発する分子の開発が必要不可欠である。本研究でこの問題に取り組み、独自のアイデアを取入れてきわめてユニークかつ有望な蛍光性核酸塩基(BDF)の分子デザインに成功した。特に、これまでできなかったチミン塩基を選択的に認識できるBDF塩基をデザイン合成することにはじめて成功している。さらに、アントラセン骨格をもつ新しい発色団を新規に開発し、より超波長で蛍光を高候率で発する核酸塩基の開発を行った。細胞内で遺伝子を検出でき消光剤を全く必要としないモレクキュラービーコンを世界で始めて合成した。従来のものに比べて短いステップで合成できるので、大幅にコストダウンをはかることができる。

  • Research Products

    (5 results)

All 2009 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Ends Free and Self-quenched Molecular Beacons with Pyrene Labeled Pyrrolocitidine in the Middle of the Stem2009

    • Author(s)
      Y.Saito, Y.Sinohara, S.S.Bag, Y.Takeuchi, K.Matsumoto, I.Saito
    • Journal Title

      Terahedron 65

      Pages: 934-938

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fluorescence Switching of Photochromic Vinylpyrene Substituted 2'-Deoxyguanosine2009

    • Author(s)
      Y.Saito, K.Matsumoto, Y.Takeuchi, S.S.Bag, S.Kodate, T.Morn, I.Saito
    • Journal Title

      Tetrahedron Lett 50

      Pages: 1403-1406

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design of Extremely Facile 3'- and 5'- Ends Free Molecular Beacons using C8 Alkylamino Substituted 2'-Deoxyguanosine2009

    • Author(s)
      K.Matsumoto, Y.Shinohara, K.Numajiri, S.Ishioroshi, T.Morii, Y.Saito, I.Saito
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp Ser 53

      Pages: 141-142

  • [Presentation] 両末端フリーの自己消光型モレキュラービーコンの開発2009

    • Author(s)
      齋藤義雄, 篠原雄太, 松本桂彦, 沼尻恭子, 齋藤烈
    • Organizer
      2009年光化学討論会
    • Place of Presentation
      桐生市市民文化会館
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Remarks]

    • URL

      http://ch.ce.nihon-u.ac.jp/%7ei_saito/EngTop.html

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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