Construction of physical maps and sequence analyses of the genome regions including trait loci in soybean

2008 Fiscal Year Self-evaluation Report

• Project/Area Number: 18208001
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Breeding science
• Research Institution: National Institute of Agrobiological Sciences (2007-2009); Chiba University (2006)
• Principal Investigator: HARADA Kyuya National Institute of Agrobiological Sciences, ダイズゲノム研究チーム, チーム長 (70011913)
• Project Period (FY): 2006 – 2009
• Keywords: 植物育種・遺伝 / 植物ゲノム

Research Abstract

これまでのダイズ形質遺伝子座の解析から、根粒着生制御遺伝子、Nodファクター受容体遺伝子、伸育性制御遺伝子、7Sグロブリン欠失性遺伝子、開花期関連QTL、タンパク質関連QTL等の重要な遺伝子座を同定した。本研究はこれらの遺伝子座の精密マッピングを行い、その近傍領域について、BACクローンのコンティグを作製して、そのうち最も重要と考えられる数百kbの塩基配列を決定する。ホモロジーサーチと遺伝子予測プログラムを併用して、遺伝子構造のモデリング、機能注釈を行い、その領域に存在する遺伝子とその機能を推定する。

Research Products

• [Journal Article] A novel manual pooling system for preparing three-dimensional pools of a deep coverage soybean bacterial artificial library (2008)
  • Author(s): Z. Xia, S. Watanabe, Q. Chen, S. Sato, K.Harada
  • Journal Title: Molecular Ecology Resources 9 Pages: 516-524
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Characterization of the soybean genome using EST-derived microsatellite markers (2007)
  • Author(s): H. Hisano, S. Sato, S. Isobe, S. Sasamoto, T. Wada, A. Matsuno, T. Fujishiro, M. Yamada, S. Nakayama, Y. Nakamura, S. Watanabe, K. Harada, S. Tabata
  • Journal Title: DNA Research 14 Pages: 271-281
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Molecular characterization of a β-conglycinin deficient soybean (2006)
  • Author(s): Y. Tsubokura, M. Hajika, K. Harada
  • Journal Title: Euphytica 150 Pages: 249-255
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] QTL analysis of resistance to soybean cyst nematode race 3 in soybean cultivar Toyomusume (2006)
  • Author(s): S.A. Ferdous, S. Watanabe, C. Suzuki-Orihara, Y. Tanaka, M. Kamiya, N. Yamanaka, K.H arada
  • Journal Title: Breeding Science 56 Pages: 155-163
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Molecular markers associated with β-conglycinin deficiency in soybean (2006)
  • Author(s): Y. Tsubokura, M. Hajika, K. Harada
  • Journal Title: Breeding Science 56 Pages: 113-117
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ダイズリソースの現状とその活用 (2009)
  • Author(s): 原田久也
  • Organizer: 日本育種学会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場
  • Year and Date: 2009-03-28
• [Presentation] 7Sグロブリン欠失性遺伝子Scg-1座乗領域の構造解析 (2008)
  • Author(s): 坪倉康隆・羽鹿牧太・金森裕之・片寄裕 一・原田久也
  • Organizer: 種子生理生化学研究会
  • Place of Presentation: マリンヒルホテル小樽
  • Year and Date: 2008-10-23
• [Presentation] ダイズの開花期関連遺伝子座FT3のマップベースクローニング (2008)
  • Author(s): 渡辺啓史・秀島瑠満子・夏 正俊・坪倉康隆・佐藤修正・山中直樹・石本政男・田畑哲之・穴井豊昭・原田久也
  • Organizer: 日本育種学会
  • Place of Presentation: 滋賀県立大学
  • Year and Date: 2008-10-12
• [Presentation] ダイズにおけるゲノム解析基盤の構築とその育種的利用 (2008)
  • Author(s): 原田久也
  • Organizer: 日本育種学会
  • Place of Presentation: 明治大学
  • Year and Date: 2008-03-28
• [Presentation] Fine Mapping toward positional cloning of the FT1 gene for soybean flowering time (2007)
  • Author(s): Xia, Z, S. Watanabe, K. Harada
  • Organizer: 日本育種学会
  • Place of Presentation: 山形大学
  • Year and Date: 2007-09-22
• [Book] 種子の科学とバイオテクノロジー (2009)
  • Author(s): 相田光宏, 原田久也
  • Total Pages: 379
  • Publisher: 学会出版センター