2006 Fiscal Year Annual Research Report
ゲノム全領域関連解析による脳血栓のオーダーメイド予防システムの開発
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18209023
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| Research Institution | Mie University |
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Principal Investigator |
山田 芳司 三重大学, 生命科学研究支援センター, 教授 (90333286)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
市原 佐保子 三重大学, 生命科学研究支援センター, 助手 (20378326)
小島 俊男 独立行政法人理化学研究所, ゲノム化学総合研究センター, チームリーダー (00311340)
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| Keywords | ゲノム / 関連解析 / オーダーメイド予防 / 脳血管障害 / アテローム血栓性脳梗塞 / 脳血栓 / 脳出血 / くも膜下出血 |
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| Research Abstract |
研究参加施設(岐阜県総合医療センター、岐阜県立多治見病院、弘前脳卒中センター)の協力により、600例の脳血管障害(脳梗塞、脳出血、くも膜下出血)のDNAサンプルおよび臨床データを新たに収集した。また、152候補遺伝子202多型の関連解析により、IL6遺伝子多型がアテローム血栓性脳梗塞および脳出血の発症に強く関連し、PKD1-like遺伝子多型とTNF遺伝子多型がくも膜下出血の発症に強く関連することを報告した(Yamada et al.Arterioscler Thromb Vasc Biol 2006)。さらにアテローム血栓性脳梗塞では7個、脳出血では8個、くも膜下出血では9個の多型が発症と有意に関連することを見出した。また、候補遺伝子アプローチとして、新たに50遺伝子98多型の解析を行っており、既に49多型については解析を終了している。さらに、疾患感受性遺伝子探索における包括的なアプローチとして、アテローム血栓性脳梗塞131例、対照135例について、SNPチップ(Gene Chip Mapping 500K Set, Affymetrix)を用いたゲノム全領域関連解析を行った。即ち、ヒトゲノム全領域に配置された524,596個の各SNPの関連解析および各haploblockの関連解析を行い、アテローム血栓性脳梗塞発症に強く関連する(P<10^<-20>)SNPsを抽出し、それらの中から遺伝子のアノテーションのあるSNPsを100個選択した。現在、これらのSNPsについてさらに別の集団で関連解析を行っており、疾患発症に強く関連するSNPsを確定することにより、精度の高いオーダーメイド予防システムを開発する予定である。
本研究は、三重大学医学部および各研究参加施設の倫理委員会の承認を得ており、「ヒトゲノム・遺伝子解析研究に関する倫理指針(平成16年12月28日全部改正、平成17年6月29日一部改正)」を遵守して行っている。
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[Journal Article] Mitochondrial haplogroup A is a genetic risk factor for atherothrombotic cerebral infarction in Japanese females2007
Author(s)
Nishigaki Y, Yamada Y, Fuku N, Matsuo H, Segawa T, Watanabe S, Kato K, Yokoi K, Yamaguchi S, Nozawa Y, Tanaka M
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Journal Title
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[Journal Article] Genetic risk for ischemic and hemorrhagic stroke2006
Author(s)
Yamada Y, Metoki N, Yoshida H, Satoh K, Ichihara S, Kato K, Kameyama T, Yokoi K, Matsuo H, Segawa T, Watanabe S, Nozawa Y
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Journal Title
Arterioscler Thromb Vasc Biol 26
Pages: 1920-1925
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[Journal Article] Genetic risk for atherothrombotic cerebral infarction in individuals stratified by sex or conventional risk factors for atherosclerosis2006
Author(s)
Yamaguchi S, Yamada Y, Metoki N, Yoshida H, Satoh K, Ichihara S, Kato K, Kameyama T, Yokoi K, Matsuo H, Segawa T, Watanabe S, Nozawa Y
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Journal Title
Int J Mol Med 18
Pages: 871-883
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