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2008 Fiscal Year Annual Research Report

テーラーメード医療実現に向けての統計的基盤技術の開発と研究

Research Project

Project/Area Number 18300095
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

大瀧 慈  Hiroshima University, 原爆放射線医科学研究所, 教授 (20110463)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 越智 義道  大分大学, 工学部, 教授 (60185618)
若木 宏文  広島大学, 理学研究科, 教授 (90210856)
柳原 宏和  広島大学, 理学研究科, 准教授 (70342615)
和泉 志津恵  大分大学, 工学部, 准教授 (70344413)
濱崎 俊光  大阪大学, 大学院・医学系研究科, 准教授 (40379243)
Keywordsアレイデータ / 数理モデル / ゲノムデータ / テーラーメード医療 / 高次元データ
Research Abstract

本年度は、テーラーメード医療の実現のための基盤を構築・整備する目的で以下の研究を実施した.
1.マイクロアレイデータの解析方法の開発に関しては,遺伝子発現状況に‘通常On',‘異常On'および‘Off'の概念を導入し,データの数理構造を詳細に定式化し,その特徴を活かした頑健な解析方法を提案した.さらに,現実の医学データに適用し,従来法の解析方法による結果との比較を行い,その効率や精度が優れていることを検証した.
2.分子疫学研究や社会科学研究のデータ分析をとおして,コホート研究に基づく研究デザインに関する手法の検討を行った.離散データ解析を中心に,正確推測に関する検討や,一般化線形・非線形モデル,EMアルゴリズム,一般化推定方程式等の計算法に関する検討を行った.
3.変化係数を線形なクラスに限定することで一般化推定方程式を利用し推測方法を開発した.
4.高次元・大標本の枠組みでの正準判別変量の個数に関する検定統計量の漸近展開の導出、Wilksのラムダ分布の高次元漸近展開公式と、その誤差限界を導出した。また、統計手法の改良に関しては、マハラノビス距離による判別法の改良を行った。高次元データ解析手法では、主成分を利用した層別化逆回帰法を提案した.また,モデル選択のための情報量規準のリスクに対するバイアスをできるだけ簡単に補正する方法に関して研究を行った.
5.数理モデルに含まれる未知母数の推測の方法として,最適変換の探索に焦点をあて,Box & Cox変換のおよびベキ正規分布を基盤とする方法の研究を行った.

  • Research Products

    (37 results)

All 2009 2008

All Journal Article (12 results) (of which Peer Reviewed: 11 results) Presentation (24 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Prognostic factors and outcome prediction model of severe traumatic brain injury・. The Journal of Trauma, Injury, Infection, and Critical Care2009

    • Author(s)
      Tasaki O, Shiozaki T, Hamasaki T, Kajino K, Nakae H, Tanaka H, Shimazu T, Sugimoto H
    • Journal Title

      The Journal of Trauma, Injury, Infection, and Critical Care 66

      Pages: 304-308

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Glioblastoma treated with postoperative radio-chemotherapy : Prognostic value of apparent diffusion coefficient at MR imaging2009

    • Author(s)
      Yamasaki F, Sugiyama K, Ohtaki M, Takeshima Y, Abe N, Akiyamad Y, Takaba J, Amatya VJ, Saito T, Kajiwara Y, Hanaya R, Kurisu K
    • Journal Title

      European Journal of Radiology (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A cure Weibull gamma-frailty survival model and its application to exploring the prognosis factors of neuroblastoma2009

    • Author(s)
      Dokhi M, Ohtaki M, Hiyama E
    • Journal Title

      Hiroshima J. Med. Sci (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 遺伝子発現状態‘On/Off'仮説に基づいたマイクロアレイデータ解析2009

    • Author(s)
      大瀧慈, 大谷敬子, 檜山桂子, 佐藤健一, 檜山英三
    • Journal Title

      日本統計学会誌 3 8

      Pages: 151-160

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 離散分布の経時測定データにおける線形な変化係数の推測について2009

    • Author(s)
      佐藤健一, 柳原宏和, 加茂憲一
    • Journal Title

      応用統計学 (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Optimal discriminant functions for normal populations2009

    • Author(s)
      Wakaki H, Aoshima M
    • Journal Title

      J. Multivariate Analysis 100

      Pages: 58-69

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An improvement method of sliced inverse regression usingprincipal component analysis2009

    • Author(s)
      Akita T, Tanaka T, Kawanishi D, Wakaki H
    • Journal Title

      Journal of Statistics and Applica tions (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The offspring of A-Bomb survivors : cancer and non-cancermortality and cancer incidence2008

    • Author(s)
      Suyama A, Izumi s, Koyama K, Sakata R, Nishi N, Soda M, Grant E, Shimizu Y, Furukawa K, Cullings HM, Kasagi F, Kodama K
    • Journal Title

      Proceedings of the First International Symposium of Nagasaki University Global COE Program for Radiation Health Risk Control, Springer 1

      Pages: 57-62

  • [Journal Article] Evaluation of clustering base on preprocessing in gene expression data2008

    • Author(s)
      Kim SY, Hamasaki T
    • Journal Title

      International Journal of Biological, Biomedical and Medical Sciences 3

      Pages: 48-53

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Recent mortality from pleural mesothelioma historical patterns of asbestos use, and adoption of bans : a global assessment2008

    • Author(s)
      Nishikawa K, Takahashi K, Karjalainen A, Chi-Pang Wen, Furuya S, Hoshuyama T, Todoroki M, Kiyomoto Y, Wilson D, Higashi T, Ohtaki M, Guowei Pan, Wagner G
    • Journal Title

      Environmental Health Perspectives 116

      Pages: 1675-1680

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effectiveness of screening for neuroblastoma at 6 months of age : a retrospective population-based cohort study2008

    • Author(s)
      Hiyama E, Iehara T, Sugimoto T, Fukuzawa M, Hayashi Y, Sasaki F, Sugiyama M, Kndo S, Yoneda A, Yamaoka H, Tajiri T, Akazawa K, Ohtaki M
    • Journal Title

      The Lancet 371

      Pages: 1173-1180

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Inference on biological mechanismsusing an integrated phenotype prediction model2008

    • Author(s)
      Enomoto Y, Ushijima M, Miyata S, Matsuura M, Ohtaki M
    • Journal Title

      Hiroshima J. Med. Sci 57

      Pages: 7-15

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] コホート内症例対照研究における対照抽出デザイン別検出力の算出方法について2009

    • Author(s)
      和泉志津恵, 藤井良宜
    • Organizer
      平成20年度統計数理研究所・公開研究会「生物統計学における因果推論に関する手法の改善」
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-03-23
  • [Presentation] 離散分布の経時測定データにおける線形な変化係数の推測について2009

    • Author(s)
      佐藤健二柳原宏和, 加茂憲
    • Organizer
      第39回大分統計談話会
    • Place of Presentation
      大分
    • Year and Date
      2009-02-06
  • [Presentation] 多変量一般化リッチ回帰におけるリッチパラメータ選択のためのバイアス補正CL規準2009

    • Author(s)
      永井勇, 柳原宏和, 佐藤健一
    • Organizer
      第39回大分統計談話会
    • Place of Presentation
      大分
    • Year and Date
      2009-02-06
  • [Presentation] How to treat low intensity genes in microarray data analysis : a method for explolation of differentially expressed genesbetween phenotype groups2009

    • Author(s)
      大谷敬子, 大瀧慈, 檜山英三, 檜山桂子, 佐藤健一
    • Organizer
      第39回大分統計談話会
    • Place of Presentation
      大分
    • Year and Date
      2009-02-05
  • [Presentation] ロジスティツク回帰分析での正確推測法における離散性への対応2009

    • Author(s)
      長本州彦, 越智義道
    • Organizer
      第39回大分統計談話会
    • Place of Presentation
      大分
    • Year and Date
      2009-02-05
  • [Presentation] A cure Weibull gamma-frailty survival model and its application to exploring the prognosis factors of neuroblastoma2009

    • Author(s)
      Dokhi M., Ohtaki M., Hiyama E.
    • Organizer
      The 3rd International Kurume Symposium on Biostatistics-Analysis of Longitudinal and Event History Data, and Related Topics
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2009-01-30
  • [Presentation] Power calculation for likelihood ratio tests in the nested case-control design2009

    • Author(s)
      Fujii Y, Izumi S
    • Organizer
      The 3rd International Kurume Symposium on Biostatistics
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2009-01-30
  • [Presentation] An analysis of long-term censored data from a randomized withdrawal study in patients with major depressive disorder2009

    • Author(s)
      Hamasaki. T., Sugimoto, T., Arano, I
    • Organizer
      8th Annual Hawaii Interna-tional Conferenee on Statistics, Mathematics and Related Fields
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2009-01-14
  • [Presentation] Estimation of varying coefficients for a growth curve model2008

    • Author(s)
      佐藤健二柳原宏和
    • Organizer
      2008年度科学研究費シンポジウム「多変量解析における最近の話題」
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] An unbiased Cp criterion for multivariate ridge regression2008

    • Author(s)
      柳原宏和, 佐藤健一
    • Organizer
      2008年度科学研究費シンポジウム「多変量解析における最近の話題」
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] Power calculation for likelihood ratio tests in the simple nested case-control sample analysis.2008

    • Author(s)
      Izumi S, Fujii Y.
    • Organizer
      IASC2008
    • Place of Presentation
      Yokohama
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] Assessing gene-environment interaction in case-only analys is2008

    • Author(s)
      Izumi S, Cologne J.
    • Organizer
      IASC2008
    • Place of Presentation
      Yokohama
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] Mutations of p53 gene in non-small cell lung cancer among atomic-bomb survivors2008

    • Author(s)
      Taga M, Eguchi H, Hamatani K, Ito R, Imai K, Katayama H, Nishi N, Tahara E, Izumi S, Matsumura s, Oue N, Yasui w, Nakachi K.
    • Organizer
      第51回日本放射線影響学会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Year and Date
      2008-11-20
  • [Presentation] Exploration of the genes associated with chemosensitivity andindefinite proliferation of lung cancer cells2008

    • Author(s)
      Hiyama K., Arifin M., Tanimoto K., Otani K., Ohtaki M., Hiyama E., Nishiyama M. *
    • Organizer
      The 13th Congress of the Asian Pacific Society of Respirology
    • Place of Presentation
      Bangkok(Thailand)
    • Year and Date
      2008-11-15
  • [Presentation] コポート内症例対照研究における擬似症例を用いた検出力の推定方法 : 漸近近似法との比較2008

    • Author(s)
      和泉志津恵, 藤井良宜
    • Organizer
      2008年度統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-09-09
  • [Presentation] 繰り返し計算を必要としないスプライン平滑化パラメータの最適化法2008

    • Author(s)
      柳原宏和
    • Organizer
      2008年度統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-09-09
  • [Presentation] 成長曲線モデルにおける変化係数の推定2008

    • Author(s)
      佐藤健二柳原宏和
    • Organizer
      2008年度統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-09-08
  • [Presentation] 多変量一般化リッジ回帰モデルにおけるリッジパラメータの選択法2008

    • Author(s)
      永井勇, 柳原宏和, 佐藤健一
    • Organizer
      2008年度統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-09-08
  • [Presentation] Bias correction of AIC in Poisson regression models2008

    • Author(s)
      加茂憲一, 柳原宏和, 佐薩健
    • Organizer
      2008年度統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-09-08
  • [Presentation] 遺伝子発現の特微量としての2次元の指標に基づく表現型関連遺伝子の探索2008

    • Author(s)
      大谷敬子, 大瀧慈, 檜山英三檜山桂子, 佐藤健一
    • Organizer
      2008年度統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-09-08
  • [Presentation] SNPデータを用いた疾患関連研究における遺伝子型の一致率によるQuality Control2008

    • Author(s)
      安東正貴, 佐藤泰憲, 坂本裕美, 吉田輝彦, 大瀧慈
    • Organizer
      2008年度統計関連学会連合大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-09-08
  • [Presentation] Error bounds for high--dimensional Edge worth expansions forsome tests on covariance matrices2008

    • Author(s)
      Wakaki H
    • Organizer
      International Conference on Multivariate Statistical Modelling &High Dimensional Data Mining
    • Place of Presentation
      Kayseri, Turkey
    • Year and Date
      2008-06-21
  • [Presentation] Further analysis of randomized withdrawal studies : An applic ation of a Cox cure regression to a sertr aline clinical study for patients with major depressive disorder2008

    • Author(s)
      Arano, I., Hamasaki, T., Sugimoto, T.
    • Organizer
      Graybill Conference VII
    • Place of Presentation
      Colorado, USA
    • Year and Date
      2008-06-11
  • [Presentation] 単純なロジックタームモデルに基づく2値表現型関連遺伝子の探索2008

    • Author(s)
      大谷敬子, 大瀧慈, 檜山英三, 檜山桂子, 佐藤健一
    • Organizer
      2008年度日本計量生物学会シンポジウム
    • Place of Presentation
      埼玉
    • Year and Date
      2008-06-06
  • [Book] 計算統計学の方法2008

    • Author(s)
      越智義道
    • Total Pages
      240
    • Publisher
      朝倉書店

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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