2008 Fiscal Year Final Research Report
Analysis of allele-specific expression and its correlation with haplotypes
Project/Area Number |
18310131
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 一般 |
Research Field |
基礎ゲノム科学
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Research Institution | Kyushu University |
Principal Investigator |
TAHIRA Tomoko Kyushu University, 生体防御医学研究所, 助教 (50155230)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
HAYASHI Kenshi 九州大学, 生体防御医学研究所, 特任教授 (00019671)
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Project Period (FY) |
2006 – 2008
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Keywords | ゲノム / 遺伝子発現 / SNP |
Research Abstract |
ゲノム上の発現調節領域に存在する多型はアレル依存的発現をもたらす。これを検出するため2つのアレルに対応するcDNAの量比をSSCP法により定量する方法を確立し、さらに、DNAタイピング用マイクロアレイにより解析する条件を検討した。1次スクリーニングにはマイクロアレイによるゲノムワイド解析を、2次スクリーニングには測定精度のよいSSCP法を利用することが効率的であると結論した。また、転写因子結合配列の挿入欠失多型を含むハプロタイプと発現との強い関連を見出した。
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[Journal Article] Association of polymorphisms in complement component C3 gene with susceptibility to systemic lupus erythematosus2008
Author(s)
Miyagawa, H, Yamai, M, Sakaguchi, D, Kiyohara, C, Tsukamoto, H, Kimoto, Y, Nakamura, T, Lee, J-H, Tsai, C-Y, Chiang, B-L, Nagasawa, K, Harada, M, Tahira, T, Hayashi, K, and Horiuchi, T.
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Journal Title
Rheumatology 47
Pages: 158-164
Peer Reviewed
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[Journal Article] QSNPlite, a software system for quantitative analysis of SNPs based on capillary array SSCP analysis2006
Author(s)
Tahira, T, Okazaki, Y, Miura, K, Yoshinaga, A, Masumoto, K, Higasa, K, Kukita, Y, and Hayashi, K.
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Journal Title
Electrophoresis 27
Pages: 3869-3878
Peer Reviewed
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[Journal Article] Optimization of capillary array electrophoresis single-strand conformation polymorphism analysis for routine molecular diagnostics.2006
Author(s)
Jespersgaard, C, Larsen, LA, Baba, S, Kukita, Y, Tahira, T, Christiansen, M, Vuust, J, Hayashi, K, and Andersen, PS.
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Journal Title
Electrophoresis 27
Pages: 3816-3822
Peer Reviewed
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