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2008 Fiscal Year Final Research Report

Structural and kinetic studies for the refined reaction mechanism in built-in-cofactor dependent quinone enzymes mediating proton and electron transfers

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 18350085
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

OKAJIMA Toshihide  Osaka University, 産業科学研究所, 准教授 (10247968)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) TANIZAWA Katsuyuki  大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (20133134)
Project Period (FY) 2006 – 2008
Keywords酵素 / 蛋白質 / トンネル効果 / X 線結晶解析 / 補酵素
Research Abstract

ビルトイン型キノン補酵素を含む銅含有アミン酸化酵素およびキノヘモプロテイン・アミン脱水素酵素を対象に、X 線結晶解析による反応中間体の構造解析と溶液中の詳細な速度論解析を組み合わせることによって、その反応メカニズムを解析した。酵素反応を効率的に進行させるために、酵素反応におけるプロトントと電子移動が、補酵素と酵素構造の連携によって、精密に制御されていることがわかった。

  • Research Products

    (16 results)

All 2009 2008 2007 2006

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (7 results) Book (3 results)

  • [Journal Article] 分子内架橋構造をもちトリプトファン残基に由来するキノン補酵素の生合成機構2009

    • Author(s)
      岡島 俊英,谷澤 克行
    • Journal Title

      化学と生物

      Pages: 0

  • [Journal Article] Further insight into the mechanism of stereoselective proton abstraction by bacterial copper amine oxidase2008

    • Author(s)
      M. Taki, K. Tanizawa(8人中6 番目), and T. Okajima(8 番目)
    • Journal Title

      Biochemistry 2008, 47,

      Pages: 7726-7733

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Trapping of a dopaquinone intermediate in the TPQ cofactor biogenesis in a copper-containing amine oxidase from Arthrobacter globiformis.2007

    • Author(s)
      R. H. Moore, T. Okajima (8 人中6番), and K. Tanizawa (7番)
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc. 2007, 129

      Pages: 11524-1134

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] (4)X 線結晶解析と反応速度論的解析に基づく銅アミン酸化酵素の触媒機構2006

    • Author(s)
      岡島俊英,谷澤克行
    • Journal Title

      日本応用酵素協会誌 41

      Pages: 1-7

  • [Journal Article] Involvement of a Putative [Fe-S]-Cluster-binding Protein in the Biosynthesis of Quinohemoprotein Amine Dehydrogenas2006

    • Author(s)
      K. Ono, T. Okajima, M. Tani, S. Kuroda, D. Sun, V. L. Davidson, and K. Tanizawa
    • Journal Title

      J. Biol. Chem., 281

      Pages: 13672-13684.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal Structures of Cytochrome cL and Methanol Dehydrogenase from Hyphomicrobium denitrificans: Structural and Mechanistic Insights into Interactions between the Two Proteins2006

    • Author(s)
      M. Nojiri, D. Hira, K. Yamaguchi, T. Okajima, K. Tanizawa, and S. Suzuki
    • Journal Title

      Biochemistry 45

      Pages: 3481-3492.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Conformational Flexibility of the TPQ Cofactor in Bacterial Copper Amine Oxidase.2009

    • Author(s)
      T. Okajima, S. Nakanishi, and K. Tan
    • Organizer
      12th SANKEN International Symposium /Joint Meeting of The 7th SANKEN Nanotechnology Center Symposium/The 2nd SANKEN MSTeC Symposium/The 1st SANKEN Alliance Symposium
    • Place of Presentation
      Suita, Osaka, JAPAN
    • Year and Date
      2009-01-22
  • [Presentation] 銅含有アミン酸化酵素補酵素生成機構の解明:補酵素前駆体チロシン残基のフレキシビリティを制御するアスパラギン残基の役割2008

    • Author(s)
      元山 暁仁、中西 将太、黒田 俊一、岡島 俊英、谷澤 克行
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] キノヘムプロテイン・アミン脱水素酵素の補酵素生合成機構の解明:αサブユニットに結合したヘム分子の役割2008

    • Author(s)
      米倉 弘倫、岡島 俊英、小野 和利、黒田 俊一、谷澤 克行
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] 速度論および構造解析に基づく酵素触媒反応におけるプロトントンネリング機構の解析2008

    • Author(s)
      村川 武志、岡島 俊英、谷澤 克行、林 秀行
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第
    • URL

      81回日本生化学会大会合同大会

    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] Conformationl Flexibility of the TPQ cofactor in Bacterial Copper Amine Oxidase2008

    • Author(s)
      T. Okajima, S. Nakanishi, T. Murakawa, H. Hayashi, and K. Tanizawa
    • Organizer
      The Second International Interdisciplinary Conference on Vitamins, Coenzymes, and Biofactors
    • Place of Presentation
      Athens, Georgia, USA.
    • Year and Date
      20081026-31
  • [Presentation] Involvement of an iron sulfur protein and a subtilisin-like protease in the biogenesis of quinohemoprotein amine dehydrogenase2008

    • Author(s)
      T. Okajima, K. Ono and K. Tanizawa
    • Organizer
      Japan-Holland Joint Seminar on New Aspects in Enzyme Science and Biotechnology, Fukuoka, Japan
    • Place of Presentation
      Fukuoka, Japan
    • Year and Date
      20080928-30
  • [Presentation] 酵素触媒反応におけるプロトントンネリング:反応速度論と中間体構造に基づく銅含有アミン酸化酵素の触媒機構解析2008

    • Author(s)
      岡島俊英
    • Organizer
      日本農芸化学会2008年度大会、名古屋
    • Year and Date
      200803226-29
  • [Book] Copper Amine Oxidases: Structures, Catalytic Mechanisms and Role in Pathophysiology edited by G. Floris and B. Mondovi, Metal Substitution of Copper Amine Oxidases2009

    • Author(s)
      S. Suzuki, T. Okajima, and K. Tanizawa
  • [Book] Copper Amine Oxidases: Structures, Catalytic Mechanisms and Role in Pathophysiology edited by G. Floris and B. Mondovi, Mechanism of TPQ biogenesis in prokaryotic copper amine oxidase2009

    • Author(s)
      T. Okajima and K. Tanizawa
  • [Book] 酵素ハンドブック第3版(八木 達彦ら編)2008

    • Author(s)
      岡島 俊英、谷澤 克行
    • Publisher
      朝倉書店

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Published: 2010-06-10   Modified: 2016-04-21  

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