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2007 Fiscal Year Annual Research Report

ヘムオキシゲナーゼ反応機構の完全解明

Research Project

Project/Area Number 18370052
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

齋藤 正男  Tohoku University, 多元物質科学研究所, 教授 (70302239)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松井 敏高  東北大学, 多元物質科学研究所, 講師 (90323120)
海野 昌喜  東北大学, 多元物質科学研究所, 助教 (10359549)
Keywords反応機構 / 結晶構造解析 / ヘムオキシゲナーゼ / ヘム代謝 / 酸素活性化
Research Abstract

ヘムオキシゲナーゼ(HO)は、3段階の酸素添加反応によってヘム(鉄-ポルフィリン錯体)を鉄イオン・一酸化炭素(CO)・ビリベルジンに分解する酵素である。HO反応は生理的に重要なだけでなく、その極めて特異な反応のメカニズムにも興味が持たれている。本研究では、ヘム分解の主な律速段階に当たるベルドヘム反応に焦点を絞り、X線結晶構造解析・各種分光測定による完全解明を目的とする。また、HO反応において我々が独自に発見した新規ヘム代謝産物の生成機序の確立をも目標とする。
アルキル過酸化物によるベルドヘム反応を検討し、開環生成物中にアルキル基が取り込まれることを明らかにした。この結果、Fe-OOH中間体がベルドヘム開環の重要な活性種であることが示された。Fe-OOH中間体の構造モデルとして、パーオキソ型ミオグロビン結晶の作成に成功し、その高分解能での構造解析に独自に開発した手法によって成功した。さらに、ベルドヘム-HO複合体の単結晶を作成することにも成功し、現在までに良好なX線回折データを得ている。結晶作成条件・回折実験条件の最適化により、高分解能での構造決定が可能と期待される。
新規ヘム代謝物については、その合成法を確立し、質量分析・NMRなどの測定によって構造を決定した。新規代謝物はビリベルジンと同等の抗酸化活性を有し、酸化ストレスに対する細胞防御に有効なことを示した。また、新規代謝物の生成メカニズムを解明し、通常のヘム分解反応とは大きく異なることを示した。特に酸素濃度依存性には大きな変化が見られ、HOの酸素センサーとしての生理機能に大きな影響を与えることが提案された。

  • Research Products

    (19 results)

All 2008 2007

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (14 results)

  • [Journal Article] Alkyl peroxides reveal the ring opening mechanism of verdoheme catalyzed by heme oxygenase2008

    • Author(s)
      Matsui, et. al.
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society 130

      Pages: 4220-4221

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ligand design for the improvement of stability of metal complex protein hybrids2008

    • Author(s)
      Yokoi, et. al.
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Pages: 229-231

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural Characterization of the Fleeting Ferric Peroxo Species in Myoglobin: Experiment and Theory2007

    • Author(s)
      Unno, et. al.
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society 129

      Pages: 13394-13395

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bachl, a heme-dependent transcription factor, reveals presence of multiple heme binding sites with distinct coordination structure2007

    • Author(s)
      Hira, et. al.
    • Journal Title

      IUBMB Life 59

      Pages: 542-551

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and catalytic mechanism of heme oxygenase2007

    • Author(s)
      Unno, et. al.
    • Journal Title

      Natural Products Reports 24

      Pages: 553-570

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structures of peroxo and hydroperoxo intermediates of heme proteins2008

    • Author(s)
      M. Ikeda-Saito
    • Organizer
      Gordon Research Conference, Metals in Biology
    • Place of Presentation
      Ventura(USA)
    • Year and Date
      20080127-0201
  • [Presentation] Ring Opening Mechanism of Verdoheme Catalyzed by Heme Oxygenase2008

    • Author(s)
      T. Matsui
    • Organizer
      Global COE in Chemistry, Nagoya Special Symposium
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-03-20
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Intermediates structures of heme oxygenase catalysis2008

    • Author(s)
      M. Unno
    • Organizer
      Global COE in Chemistry, Nagoya Special Symposium
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-03-20
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Structure and catalytic mechanism of heme oxygenase2007

    • Author(s)
      M. Ikeda-Saito
    • Organizer
      The 5th International Congress Heme Oxygenases
    • Place of Presentation
      Krakow(Poland)
    • Year and Date
      20070905-09
  • [Presentation] Crystal structures of the hydroperoxo-heme-and alpha-meso-hydroxyheme intermediates in heme oxygenase catalysis2007

    • Author(s)
      M. Unno
    • Organizer
      13th International Conference on Biological Inorganic Chemistry
    • Place of Presentation
      Wien(Austria)
    • Year and Date
      20070715-20
  • [Presentation] Ring opening mechanism of verdoheme catalyzed by heme oxygenase2007

    • Author(s)
      T. Matsui
    • Organizer
      13th lnternational Conference on Biological Inorganic Chemistry
    • Place of Presentation
      Wien(Austria)
    • Year and Date
      20070715-20
  • [Presentation] イオンチャンネル型グルタミン酸受容体GluR5と天然物由来アゴニストの結合様式2007

    • Author(s)
      海野昌喜
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Structural characterization of catalytic intermediates of heme oxygenase2007

    • Author(s)
      M. Ikeda-Saito
    • Organizer
      The 67th Okazaki Conference "Molecular Science and Chemical Biology of Biomolecular Function
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2007-11-11
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Structural Characterization of Peroxo Species in Myoglobin2007

    • Author(s)
      M. Unno
    • Organizer
      The 67th Okazaki Conference "Molecular Science and Chemical Biology of Biomolecular Function
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2007-11-10
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Ring Opening Mechanism of Verdoheme Catalyzed by Heme Oxygenase2007

    • Author(s)
      T. Matsui
    • Organizer
      The 67th Okazaki Conference "Molecular Science and Chemical Biology of Biomolecular Function
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2007-11-10
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] ヘムオキシゲナーゼによるベルドヘム開環の分子機構2007

    • Author(s)
      松井敏高
    • Organizer
      第22回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-09-28
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] 低温下X線照射によるパーオキソ型ミオグロビン捕捉および結晶構造解析2007

    • Author(s)
      海野昌喜
    • Organizer
      第57回錯体化学討論会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2007-09-26
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] タンパク質内水分子による酵素反応制御:ヘムオキシゲナーゼの場合2007

    • Author(s)
      齋藤正男
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-05-24
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] ヘムオキシゲナーゼ反応中間体の構造解析2007

    • Author(s)
      海野昌喜
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-05-24
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より

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Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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