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2008 Fiscal Year Annual Research Report

ホヤ神経系の細胞型を規定する転写制御ネットワークの解明

Research Project

Project/Area Number 18370089
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

日下部 岳広  University of Hyogo, 大学院・生命理学研究科, 准教授 (40280862)

Keywordsゲノム / 遺伝子 / 発生・分化 / 発現制御 / 脳・神経
Research Abstract

1.Ci-POU-IVによる神経細胞特異的遺伝子の発現制御:POUファミリー転写因子の一つCi-POU-IVは表皮神経細胞におけるグルタミン酸作動性マーカーCi-VGLUTの発現に必要である(前年度の成果)。平成20年度は、前年度に作製した各神経サブタイプ特異的にKaedeレポーターを発現するトランスジェニック系統を用いて、Ci-POU-IVはGABA/グリシン作動性細胞やコリン作動性細胞の発生には関与しないことを示す結果を得た。汎ニューロンマーカーを用いた解析から、Ci-POU-IVの機能阻害により表皮ニューロンのCi-VGLUT遺伝子の発現は失われるが、ニューロンとしての属性は維持し、神経細胞への分化は生じている可能性が示唆された。
2.GABA/グリシン作動性神経細胞特異的遺伝子Ci-VGATの発現制御機構: Ci-VGAT上流の種間で保存された非コード領域が、神経索前端部の2対の介在ニューロンでの発現に必要十分であることを明らかにし、この領域と相互作用する転写因子の候補として、Engrailedホモログ(Ci-En)、SoxB1ホモログ(Ci-SoxB1)を同定した。
3.実験結果のデータベース化:ホヤ転写制御データベースDBTGR(http://dbtgr.hgc.jp)の機能拡充を行い、これまでの研究で得られた60以上の神経特異的遺伝子の転写制御領域の構造と機能に関する実験結果のデータベース化を行った(東京大学医科研・中井謙太教授、Nicolas Sierro研究員らの協力による)。オリゴキャッピング法と次世代シーケンサを用いて得られた転写産物の5'端情報や転写制御因子の結合予測情報も統合し、ゲノムワイドな転写制御ネットワークの解析のための機能を強化した。

  • Research Products

    (15 results)

All 2009 2008

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (10 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Cell type and function of neurons in the ascidian nervoussystem2009

    • Author(s)
      Takeo Horie
    • Journal Title

      Development, Growth & Differentiation 51

      Pages: 207-220

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tube formation by complex cellular processes in Ciona intestinalis notochord2009

    • Author(s)
      Bo Dong
    • Journal Title

      Developmental Biology (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pigmented and nonpigmented ocelli in the brain vesicle of the ascidian larva2008

    • Author(s)
      Takeo Horie
    • Journal Title

      Journal of Comparative Neurology 509

      Pages: 88-102

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Gene Regulatory Mechanisms underlying the Determination of Neuronal Identity in the Ascidian Larva2008

    • Author(s)
      Takehiro Kusakabe
    • Organizer
      The 16th CDB Meeting : Cis-sequence Regulation and its Evolution
    • Place of Presentation
      理研CDB(神戸)
    • Year and Date
      20080929-20081001
  • [Presentation] Identification and characterization of a cis-regulatory modulerequired for specific gene expression in a subset of GABA/glycinergic neurons of the Ciona intestinalis larva2008

    • Author(s)
      Koki Nishitsuji
    • Organizer
      Joint meeting of the Societe Francaisede Biologie du Development / Japanese Society of Developmental Biologists
    • Place of Presentation
      GIENS (FRANCE)
    • Year and Date
      20080913-20080917
  • [Presentation] Roles of hedgehog signaling in Ciona intestinalis development : insights from hedgehog and Gli expression and cyclopamine treatment2008

    • Author(s)
      A. F. M. Tariqul Islam
    • Organizer
      日本発生生物学会第4 1回大会
    • Place of Presentation
      徳島県郷土文化会館
    • Year and Date
      20080529-20080530
  • [Presentation] Identification and characterization of a cis-regulatory module required for specific gene expression in a subset of GABA/glycinergic neurons of the Ciona intestinalis larva2008

    • Author(s)
      Koki Nishitsuji
    • Organizer
      日本発生生物学会第41回大会
    • Place of Presentation
      徳島県郷土文化会館
    • Year and Date
      20080528-20080529
  • [Presentation] Ontogeny of glutamatergic, GABA/glycinergic, and cholinergicneurons in the Ciona intestinalis larva2008

    • Author(s)
      森本 熊紀
    • Organizer
      日本発生生物学会第41回大会
    • Place of Presentation
      徳島県郷土文化会館
    • Year and Date
      20080528-20080529
  • [Presentation] Ci-POU-IV, a POU domain transcription factor, is required for development of epidermal glutamatergic neurons in the Cionaintestinalis larva2008

    • Author(s)
      鈴木 貴子
    • Organizer
      日本発生生物学会第41回大会
    • Place of Presentation
      徳島県郷土文化会館
    • Year and Date
      20080528-20080529
  • [Presentation] カタユウレイボヤ神経系特異的遺伝子の転写調節領域の大規模解析2008

    • Author(s)
      西辻光希
    • Organizer
      日本動物学会第79回大会
    • Place of Presentation
      福岡大学七隈キャンパス
    • Year and Date
      2008-09-07
  • [Presentation] ホヤ幼生の神経発生におけるOtxとPax2/5/8の役割2008

    • Author(s)
      日下部岳広
    • Organizer
      第31回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      東京国際フォーラム
    • Year and Date
      2008-09-07
  • [Presentation] Cell lineage analysis of photoreceptor cells by laser ablation and DiI labeling in the Ciona intestinalis larva2008

    • Author(s)
      A. F. M. Tariqul Islam
    • Organizer
      日本動物学会第79回大会
    • Place of Presentation
      福岡大学七隈キャンパス
    • Year and Date
      2008-09-07
  • [Presentation] ホヤにおける視覚サイクル機構2008

    • Author(s)
      瀧本 紀子
    • Organizer
      日本動物学会第79回大会
    • Place of Presentation
      福岡大学七隈キャンパス
    • Year and Date
      2008-09-07
  • [Book] 身近な動物を使った実験1 ホヤ2009

    • Author(s)
      日下部 岳広
    • Total Pages
      1-12
    • Publisher
      三共出版
  • [Book] 動物はなぜ多様な神経系をもっか? : 神経系の比較生物学第10章 ホヤの神経系と行動2009

    • Author(s)
      日下部 岳広
    • Publisher
      共立出版(印刷中)

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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