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2008 Fiscal Year Annual Research Report

外来遺伝子侵入のリスク評価と在来資源の保全管理手法の解明:アサリをモデルとして

Research Project

Project/Area Number 18380114
Research InstitutionTokyo University of Marine Science and Technology

Principal Investigator

北田 修一  Tokyo University of Marine Science and Technology, 海洋科学部・海洋生物資源学科, 教授 (10262338)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岸野 洋久  東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (00141987)
浜崎 活幸  東京海洋大学, 海洋科学部・海洋生物資源学科, 准教授 (90377078)
北門 利英  東京海洋大学, 海洋科学部・海洋生物資源学科, 助教 (40281000)
Keywordsアサリ / 遺伝的集団構造 / 外来種 / 混合率推定 / 種苗放流効果 / 種苗放流の遺伝的影響 / 統計モデル / ベイズ推定
Research Abstract

本研究では,外来遺伝子の侵入が在来集団に及ぼす影響やリスクを適切に評価することにより,在来集団の保全方策を解明することを目指している。
本年度は、中国および北朝鮮から輸入されているRuditapes bruguieri(中国アサリ,仮称)、日本のアサリR.philippinarumおよびヒメアサリR.variegatusついて、昨年までにアイソザイム分析を行った個体と同一標本を用いて、ミトコンドリアDNAのCOXI領域の塩基配列およびマイクロサテライトマーカー4遺伝子座における遺伝子型を決定した。大量標本の分析に先立ち、ミトコンドリアDNAでは、雌雄判別した個体を用いてDoubly uniparental inheritance(DUI)を確認し、F-typeの配列を集団解析に用いることとした。また、外部形態を計測し、多変量解析を行った。
その結果、中国アサリとアサリの遺伝的分化はヒメアサリとアサリの分化に比べ極めて小さいが、両種は明らかに遺伝的に異なる別種または亜種であることが明らかになった。しかし、形態ではこれらを明確に判別することはできないことがわかった。また、日本のアサリ集団内の遺伝的分化は小さく明確な集団構造は見られなかったが、地域によって遺伝的特徴が少しずつ異なっており、遺伝子流動の大きいメタ集団を形成していることが示唆された。
データ解析手法については、放流前の遺伝情報がなくても放流群の混合率を推定できる方法を新たに開発した。また、昨年までに開発した集団間の遺伝的分化の指標であるFstをほぼ不偏推定できる方法について、誰でも簡単に使えるソフトウエアを作成した。これらはウェブ上から無償でダウンロードできるよう現在準備を進めている。

  • Research Products

    (10 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (2 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Genetic effects of the long-term stock enhancement programs2009

    • Author(s)
      Kitada S., H. Shishidou, T. Sugaya, T. Kitakado, K. Hamasaki, H. Kishino
    • Journal Title

      Aquaculture (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 集団間の遺伝的分化の経験ベイズ推定2008

    • Author(s)
      北田修一, 北門利英, 岸野洋久
    • Journal Title

      水産育種 38

      Pages: 41-50

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Allozyme variation of the littleneck clam Ruditapes philippinarum and genetic mixture analysis of foreign clams in Ariake and Shiranui Seas, Kyushu Island, Japan2008

    • Author(s)
      Vargas, K. Y. Asakura, M. Ikeda, N. Taniguchi Y. Obata, K. Hamasaki, K. Tsuchiya, S. Kitada
    • Journal Title

      Fisheries Science 73

      Pages: 533-543

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Population genetic structure and variability of Pacific herring, Clupea pallasii, in the stocking area along the Pacific coast of northern Japan2008

    • Author(s)
      Sugaya, T., M. Sato, E. Yokoyama, Y. Nemoto, T. Fujita, H. Okouchi, K. Hamasaki, S. Kitada
    • Journal Title

      Fisheries Science 74

      Pages: 579-588

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] マイクロサテライトDNA変異から推定した日本沿岸における太平洋ニシンの集団構造2008

    • Author(s)
      根本雄太, 菅谷琢磨, 大河内裕之, 北門利英, 浜崎活幸, 北田修一
    • Journal Title

      水産育種 37

      Pages: 51-59

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] マイクロサテライトDNAによる鹿児島湾のマダイ天然魚と放流魚の遺伝的変異性の評価2008

    • Author(s)
      宍道弘敏, 北田修一, 坂本崇 浜崎活幸
    • Journal Title

      日本水産学会誌 74

      Pages: 183-188

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 水産資源の集団構造解析に対する統計遺伝学的アプローチ2008

    • Author(s)
      北門利英, 北田修一, 岸野洋久
    • Organizer
      科研費シンポジウム「高度情報抽出のための統計理論・方法論とその応用」
    • Place of Presentation
      九州大学
    • Year and Date
      2008-11-21
  • [Presentation] Does Captive Breeding Cause Fitness Decline in Wild Populations? : Case Studies from Japan2008

    • Author(s)
      S. Kitada, Y. Miyakoshi, K. Hamasaki, T. Kitakado, H. Kishino
    • Organizer
      5th World Fisheries Congress
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2008-10-24
  • [Book] 水産資源の増殖と保全2008

    • Author(s)
      北田修一, 帰山雅秀, 浜崎活幸, 谷口順彦[編著]
    • Total Pages
      234
    • Publisher
      成山堂書店
  • [Remarks]

    • URL

      http://www2.kaiyodai.ac.jp/~kitada/index_kitada.html

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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