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2008 Fiscal Year Annual Research Report

細菌が持つ環境汚染物質分解酵素遺伝子の水平伝播

Research Project

Project/Area Number 18380189
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

津田 雅孝  Tohoku University, 大学院・生命科学研究科, 教授 (90172022)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 永田 裕二  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 准教授 (30237531)
大坪 嘉行  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 助教 (40342761)
Keywords環境浄化 / 環境細菌 / 可動遺伝因子 / 遺伝子水平伝播 / プラスミド / ゲノミックアイランド / 遺伝子資源
Research Abstract

土壌細菌が持つ環境汚染物質分解酵素遺伝子は、プラスミドや接合型トランスポゾン(CTn)等の可動遺伝因子支配が多く、その自己接合伝達能は水平伝播した広範な細菌株の迅速な環境適応と進化に大きく貢献する。本研究では、水平伝播能のある当該可動遺伝因子に関し、その水平伝播の分子機構、水平伝播を制御する各種要因、水平伝播可能な受容菌宿主域の規定要因を解明する。本年度は下記成果を得た。
(1)環境汚染物質分解酵素遺伝子を担うプラスミドと同一接合伝達遺伝子群を有するプラスミドRP4のPseudomonas putida間での接合伝達時で、供与菌と受容菌の染色体支配遺伝子、そしてRP4支配遺伝子の転写様式をマイクロアレイで解析した。染色体支配遺伝子転写の大きな変動はなかったが、RP4支配接合関連遺伝子の転写は供与菌内と受容菌内で大きく異なった。(2)P. putida由来のIncP-7群トルエン分解プラスミドの複製・分配装置を持つミニプラスミドは、多くのPseudomonas属株で安定に保持されたが、P. putida KT2440株では極めて不安定だつた。この現象は、KT2440特異的にコードされる分配関連タンパク質ParIによるプラスミド分配阻害に起因すると示唆された。(3)Sphingobium属細菌MM1株のγ-HCH完全分解能に必要な6つの分解酵素遺伝子は、内在性の3種大型プラスミド上に散在するが、これらプラスミドのドラフト塩基配列の解析から、いずれのプラスミドの複製装置の新規性、そして、1つのプラスミドの接合伝達能、が示唆された。(4)Acidovorax属細菌染色体支配PCB分解酵素遺伝子群を含むCTnの染色体からの特異的切り出し・環状化と標的DNA組込みに関わる遺伝子intの転写量は環状化CTnで上昇し、この上昇が環状化CTnの標的への組込みを効率化させると示唆された。一方、CTnがコードする3つの転写制御因子はCTnの接合伝達効率変動に関与しなかった。

  • Research Products

    (25 results)

All 2009 2008

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (16 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性-難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-2009

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Journal Title

      化学と生物 47

      Pages: 35-42

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pleiotropic roles of iron-responsive transcriptional regulator Fur in Burkholderia multivorans2008

    • Author(s)
      S. Yuhara
    • Journal Title

      Microbiology 154

      Pages: 1763-1774

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Insertion sequence-based cassette PCR : cultivation-independent isolation of γ-hexachlorocyclohcxane-degrading genes from soil DNA2008

    • Author(s)
      G. Fuchu
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biotechnol. 79

      Pages: 627-632

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] GenomeMatcher : A graphical user interface for DNA sequence comparison2008

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo
    • Journal Title

      BMC Miyazaki 9

      Pages: 376-376

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of the traD operon of naphthalene-catabolic plasmid NAH7 : a host-range modifier in conjugative transfer2008

    • Author(s)
      R. Miyazaki
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 190

      Pages: 6281-6289

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Revised nomenclature for transposable genetic elements2008

    • Author(s)
      A. P. Roberts
    • Journal Title

      Plasmid 60

      Pages: 167-173

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 多重染色体性のBurkholderia multivoransのゲノム構造と土壌でのゲノム情報発現2008

    • Author(s)
      津田雅孝
    • Journal Title

      土と微生物 62

      Pages: 93-97

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達に関与する受容菌側因子の解析2009

    • Author(s)
      井上慧
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-30
  • [Presentation] Burkholderia multivorans ATCC 17616の愛媛土壌特異的発現遺伝子の鹿島台土壌における発現誘導性の検討2009

    • Author(s)
      山本泰弘
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-30
  • [Presentation] IncP-7群プラスミドの分配機構による宿主特異性2009

    • Author(s)
      宮腰昌利
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-30
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCHモデル汚染土壌由来のHCH分解菌の単離と解析2009

    • Author(s)
      府中玄樹
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-30
  • [Presentation] 芳香族化合物による土壌の汚染化に対する土壌細菌集団の応答2009

    • Author(s)
      遠藤諒
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-30
  • [Presentation] Sphingomonas sp. MM-1株のgamma-HCH分解関連プラスミドの構造解析2009

    • Author(s)
      田端理朗
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20090327-30
  • [Presentation] 機能性メタゲノム解析により明らかにされた環境中の芳香環分解遺伝子の実態2009

    • Author(s)
      末永光
    • Organizer
      第3回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京・中央大学
    • Year and Date
      20090305-07
  • [Presentation] 自己伝達性プラスミドの接合伝達過程における転写誘導2009

    • Author(s)
      宮腰昌利
    • Organizer
      第3回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京・中央大学
    • Year and Date
      20090305-07
  • [Presentation] GenomeMatcher : 比較ゲノムソフトウエアとその付属機能2009

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Organizer
      第3回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京・中央大学
    • Year and Date
      20090305-07
  • [Presentation] 原核生物由来の可動性遺伝因子の命名法2009

    • Author(s)
      津田雅孝
    • Organizer
      第3回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京・中央大学
    • Year and Date
      20090305-07
  • [Presentation] Characterization of the traD operon in IncP-9 plasmid NAH7 : a host-range modifier in conjugative transfer2008

    • Author(s)
      Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Organizer
      International Plasmid Biology Conference 2008
    • Place of Presentation
      Gdansk, Poland
    • Year and Date
      20080830-0905
  • [Presentation] Characterization of plasmids from gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingomonas sp. MM-12008

    • Author(s)
      M. Tabata
    • Organizer
      International Plasmid Biology Conference 2008
    • Place of Presentation
      Gdansk, Poland
    • Year and Date
      20080830-0905
  • [Presentation] Reconstruction of transcription networks by the conjugative transfer of IncP plasmids2008

    • Author(s)
      M. Miyakoshi
    • Organizer
      International Plasmid Biology Conference 2008
    • Place of Presentation
      Gdansk, Poland
    • Year and Date
      20080830-0905
  • [Presentation] 分子遺伝学的手法による細菌の土壌環境適応戦略の解明2008

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Organizer
      第60回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      仙台・東北学院大学
    • Year and Date
      20080827-29
  • [Presentation] 多重染色体性のBurkholderia multivoransのゲノム構造と土壌でのゲノム情報発現2008

    • Author(s)
      津田雅孝
    • Organizer
      日本土壌微生物学会2008年度大会
    • Place of Presentation
      静岡・静岡大学
    • Year and Date
      20080613-14
  • [Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008

    • Author(s)
      Y. Nagata
    • Organizer
      ISSM satellite symposium "Environmental genomics"
    • Place of Presentation
      東京・中央大学
    • Year and Date
      2008-11-15
  • [Book] DNA Transposable Elements Research2008

    • Author(s)
      M. Sota
    • Total Pages
      23-67
    • Publisher
      Nova Science Publishers, Inc., New York, U. S. A.
  • [Book] 微生物の事典2008

    • Author(s)
      津田雅孝
    • Total Pages
      661-663
    • Publisher
      朝倉書店

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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