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2007 Fiscal Year Annual Research Report

造血器腫瘍の遺伝学的基盤等に関する網羅的ゲノム研究

Research Project

Project/Area Number 18390279
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

小川 誠司  The University of Tokyo, 医学部附属病院, 特任准教授 (60292900)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 熊野 恵城  東京大学, 医学部附属病院, 助教 (90396721)
半下石 明  東京大学, 医学部附属病院, 特任講師 (20344450)
浅井 隆司  東京大学, 医学部附属病院, 助教 (10376436)
Keywords癌 / 遺伝学 / アレル不均衡 / マイクロアレイ / 白血病
Research Abstract

造血器腫瘍の発症には,造血細胞に生じたゲノム,エビゲノムの異常が本質的な役割を担っている。本研究の目的は,先端的なマイクロアレイによる癌ゲノム解析技術を用いて,造血器腫瘍の発症に関わるゲノム,エビゲノムの異常を探索,同定するとともに,大規模SNPタイピングによる遺伝疫学的手法により,その発症に関わるゲノム,遺伝子の多型の同定を行うことである。本年度の研究では,平成18年度までに,Affymetrix社のSNPアレイを用いて解析した,急性白血病および悪性リンパ腫を含む1500例以上の造血器腫瘍検体のゲノムワイドなコピー数データに基づいて,造血器腫瘍の発症に関わる遺伝子変異の探索を行った。400例を超える小児急性リンパ性白血病の解析においては,B細胞の分化に必須と考えられる転写因子PAX5をコードする遺伝子が染色体転座によって種々の遺伝子と融合遺伝子を形成し,これによって形成されるPAX5融合遺伝子産物が正常PAX5の機能をドミナントネガティブに抑制することによってB前駆細胞白血病の発症に関与していることを昨年度明らかにしたが,本年度の解析により,B細胞の分化に関わる7番染色体短腕のIkaros遺伝子が同様にホモ接合性欠失によって不活化されることを見いだした。一方,急性骨髄性白血病および骨髄異形性症候群においては,通常のゲノムコピー数解析では同定不可能な片親性二倍体(UPD)が30〜40%の症例で認められ,これによって従来報告されている癌抑制遺伝子(Runx1やp53)の不活化のみならず,N-ras,FLt3,Jak2などの機能獲得型変異がその標的となってホモ接合となっていることを明らかにした。その他,悪性リンパ腫や成人T細胞性白血病含む種々の腫瘍について,その発症に関わる可能性のある多数の遺伝子群を同定した。

  • Research Products

    (7 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Molecular allelokaryotyping of pediatric acute lymphoblastic leukemias by high-resolution silgle nucleotide polymorphism oligonuclcotide genomic mcroarray2008

    • Author(s)
      Kawamata N, et. al.
    • Journal Title

      Blood 111

      Pages: 776-784

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Method2008

    • Author(s)
      Ogawa S, et. al.
    • Journal Title

      Molecular Biology 369 Comparative Genomics Volume2, Humana Press (Editor Nicholas Bcrgman H)

      Pages: 185-206

  • [Journal Article] Highly sensitive method for genomewide detection of allelic composition in nonpaired, primaly tumor specimens by use of affymetrix single-nucleotide-polymorphism genotyping microarrays2007

    • Author(s)
      Yamamoto G, et. al.
    • Journal Title

      American Journal of Human Genetics 81

      Pages: 114-126

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression profiling of immature thymocytes revealed a novel homeobox gene that regulates double-neative thymocyte development2007

    • Author(s)
      Kawazu M, et. al.
    • Journal Title

      Journal of Immunology 179

      Pages: 5335-5345

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of genome-wide power of genetic association studies based on emirical data from the HapMap project2007

    • Author(s)
      Nannya Y, et. al.
    • Journal Title

      Human Molecular Genetics 16

      Pages: 3494-3505

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] SNP Chip Analysis of Myelodysplastic Sylldromes Disclosed High Frequency of Uhiparelltal Disomy and a Novel Dominant Murion as the Taret of 11q UPD2007

    • Author(s)
      Sanada M, et. al.
    • Organizer
      The 49th Annual Meeting of American Siciety of Hematology
    • Place of Presentation
      米国アトランタ
    • Year and Date
      2007-12-11
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.genome.umin.ac.jp

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Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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