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2008 Fiscal Year Annual Research Report

シクリッドの適応放散メカニズム

Research Project

Project/Area Number 18405007
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

岡田 典弘  Tokyo Institute of Technology, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (60132982)

Keywordsシクリッド / 種分化 / 種形成 / 多様化 / 左右性
Research Abstract

本年度はビクトリア湖で野外調査を行い、これらのサンプルの遺伝子解析を行った。
ビクトリア湖の調査ではビクトリア湖と、隣接する直径600m足らずの小さなマリンベ湖、ビクトリア湖に流入するニャシシ川とその河口を重点においた。ニャシシ川はビクトリア湖からわずか数キロメートルしか離れていないにもかかわらず、シクリッドは2種でそのうち1種がビクトリア湖の種の祖先系に近い形態をしていることが推測された。しかもこの種はわずか1種であるが遺伝的多様性はビクトリア湖の多くの種を合わせたほど大きいことがオプシン遺伝子の解析により明らかになってきた。ニャシシ川に生息するもう1種は、系統的にビクトリア湖の種とは異なっていることがSINEを用いた系統解析で明らかになった。先述したようにニャシシ川はビクトリア湖からわずか数キロメートルしか離れていないが、この種はビクトリア湖では全く採集されたことがなかった。そのため、この種はビクトリア湖内に侵入しても適応して定着することができていないことが予測された。これらのことからこれらニャシシ川の2種を比較して解析することにより、湖での適応と種分化に重要な形質と遺伝的背景が明らかになるのではないかと期待される。また、ニャシシ川河口の調査では昨年度に報告したマリンベ湖で発見された新しい種の祖先にあたると考えられる集団が採取された。オプシン遺伝子の解析からもこれらの集団がマリンベ湖の種の祖先になった可能性が高いことが見いだされた。

  • Research Products

    (13 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Retroposon analysis and recent geological data suggest near-simultaneous divergence of the three superorders of mammals.2009

    • Author(s)
      Nishihara H, Maruyama S, Okada N.
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA 106(13)

      Pages: 5235-40

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Extensive analysis of EST sequences reveals that all cichlid species in Lake Victoria share almost identical transcript sets.2009

    • Author(s)
      Kobayashi N, Watanabe M, Horiike T, Kohara Y Okada N.
    • Journal Title

      Gene (In Press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization and evolutionary landscape of AmnSINE1 in Amniota genomes.2009

    • Author(s)
      Hirakawa M, Nishihara H, Kanehisa M, Okada N.
    • Journal Title

      Gene (In Press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chronology of the extant African elephant species and case study of the species identification of the small African elephant with the molecular phylogenetic method.2009

    • Author(s)
      Murata Y, Yonezawa T, Kihara I, Kashiwamura T, Sugihara Y, Nikaido M, Okada N, Endo H, Hasegawa M.
    • Journal Title

      Gene (In Press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The evolution of two partner LINE/SINE families and a full-length chromodomain-containing Ty3/Gypsy LTR element in the first reptilian genome of Anolis carolinensis.2009

    • Author(s)
      Piskurek O, Nishihara H, Okada N.
    • Journal Title

      Gene (In Press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Retroposons of salmonoid fishes (Actinopterygii : Salmonoidei) and their evolution.2009

    • Author(s)
      Matveev V, Okada N
    • Journal Title

      Gene 434(1-2)

      Pages: 16-28

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Speciation through sensory drive in cichlid fish.2008

    • Author(s)
      Seehausen O, Terai Y Magalhaes I. S, Carleton K. L., Mrosso H. D. J, Miyagi R, van der Sluijs I, Schneider M. V, Maan M, Tachida H, Imai H, Okada N.
    • Journal Title

      Nature 2 455(7213)

      Pages: 620-626

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Shaping of the lower jaw bone during growth of Nile tilapia Oreochromis niloticus and a Lake Victoria cichlid Haplochrom is chilotes : A geometric morphometric approach.2008

    • Author(s)
      Fujimura K, Okada N.
    • Journal Title

      Develop. Growth Differ 50(8)

      Pages: 653-663

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Retroposons : Genetic Footprints on the Evolutionary Paths of Life.2008

    • Author(s)
      Nishihara H, Okada N.
    • Journal Title

      Phylogenomics (Methods in Molecular Biology, vol. 422) Chapter13

      Pages: 201-225

  • [Journal Article] Identification of Four Engrailed Genes in the Japanese Lamprey, Lethenteron japonicum.2008

    • Author(s)
      Matsuura M, Nishihara H, Onimaru K, Kokubo N, Kuraku S, Kusakabe R, Okada N, Kuratani S, Tanaka M.
    • Journal Title

      Dev. Dyn (In Press)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] レトロポゾンを指標とした有胎盤類の初期系統進化2008

    • Author(s)
      西原秀典, 丸山茂徳, 岡田典弘
    • Organizer
      第10回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス
    • Year and Date
      2008-08-24
  • [Presentation] シクリッドの進化発生学 : 適応進化した東アフリカ湖産シクリッドの形態進化を調べるための発生学的基盤2008

    • Author(s)
      藤村衡至, 岡田典弘
    • Organizer
      第10回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス
    • Year and Date
      2008-08-22
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.evolution.bio.titech.ac.jp

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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