極限的環境に生育する珪藻種の形態・分子および物質レベルにおける分類学的研究

2006 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 18570082
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Research Institution: Tokyo Gakugei University
• Principal Investigator: 真山 茂樹 東京学芸大学, 教育学部, 助教授 (40199914)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 南雲 保 日本歯科大学, 生命歯学部, 教授 (70120706) ; 出井 雅彦 文京大学, 教育学部, 教授 (60143624)
• Keywords: 珪藻 / 極限環境 / 系統 / 分類 / LCPA / 形態 / Pinnularia / 種分化

Research Abstract

北海道2カ所、東北地方3カ所、関東地方6カ所、中部地方3カ所、九州地方3カ所の強酸性温泉を主とする水域からPinnulariaを採集し単離培養し計21クローンを得た。解析の結果,これらの個体群は,P.acidojaponica, P.valdetolerans,およびP.sp.の3つのクレードに分けられた。この系統関係は,形態的特徴および生育地の別により支持されるものであった。これらのDNA塩基配列を18SrDNA、rbclおよびITS領域において調べ、クローン間の類似性を比較した。最初に登別温泉から採集したP.acidojaponica3クローン間でDNA塩基配列間の相違を調べたところ、調査したどの領域においても相違は全く見られなかった。次に他所産のクローン問で比較をおこなった結果、P.acidojaponicaと同定される14個体群は単系統群の中で緊密な系統関係にあることが示された。これらの個体群間で見られるわずかな形態的差異は,地理的隔離により生じた多様性の表れと考えられた。P.negoroiおよびP.paralange-bertalotiiは,恐山の強酸性水域から報告された種である。これら両種と同地から単離した、P.acidojaponicaの塩基配列を比較した結果,3つのDNA領域で最大1塩基の違いしか見られなかった。また,SEM観察から,前2種が、P.acidojaponicaに特有のshort segmental bandを持つことも明らかになった。さらに、各地点から得た個体群で200以上の殻を用い、数量的形質による分析のための計測を開始した。大涌谷産の、P.acidojaponicaを大量培養し、殻中に含有される物質の抽出を試みた。本種は粘質多糖を細胞外に分泌するため、電気泳動の結果があまり芳しくなかったが、方法の改善により明瞭なバンドを得る見通しが立った。

Research Products

• [Journal Article] Molecular diversity of Alveolates associated with neritic North Atlantic Radiolarians. (2007)
  • Author(s): Dolven, J.K., Lindqvista, C., Alberta, V.A., Bjorklunda, K.R., Yuasa, T., Takahashi, O., Mayama, S.
  • Journal Title: Protist 158 Pages: 65-76
• [Journal Article] Regulated growth of diatom cells on self-assembled monolayers.Journal of Nanobiotechnology (2007)
  • Author(s): Umemura, K., Yamada, T., Maeda, Y., Kobayashi, K., Kuroda, R., Mayama, S.
  • Journal Title: Journal of Nanobiotechnology 5(2) Pages: 1-14
• [Journal Article] Cytoplasmic masses preserved in early Holocene diatoms : a possible taphonomic process and its paleo-ecological implications. (2006)
  • Author(s): Tanimura, Y., Kato, M., Hukusawa, H., Mayama, S., Yokoyama, K.
  • Journal Title: Journal of Phycology 42(2) Pages: 270-279
• [Journal Article] Phylogenetic position of the small solitary phaeodarians (Radiolaria) based on 18S rDNA sequences by single cell PCR analysis. (2006)
  • Author(s): Yuasa, T., Takahashi, O., Dolven, J.K., Mayama, S., Matsuoka, A., Honda, D., Bjorklund, K.R.
  • Journal Title: Marine Micropaleontology 59 Pages: 104-114
• [Book] 小林弘珪藻図鑑 (2006)
  • Author(s): 小林弘, 出井雅彦, 真山茂樹, 南雲保, 長田敬五
  • Total Pages: 531
  • Publisher: 内田老鶴圃