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2007 Fiscal Year Annual Research Report

IRE1によるmRNAスプライシング機構の構造の基盤

Research Project

Project/Area Number 18570106
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

児嶋 長次郎  Nara Institute of Science and Technology, バイオサイエンス研究科, 准教授 (50333563)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 三島 正規  首都大学東京, 理工学研究科 (70346310)
Keywords構造生物学 / NMR / シグナル伝達 / タンパク質 / 分子認識
Research Abstract

小胞体膜上のIRE1は、N末側を小胞体内腔にC末側を細胞質に向けたI型膜貫通蛋白質で、内腔側領域で変性蛋白質の蓄積を感知する。活性化したIrelpは小胞体シャペロン遺伝子群の転写活性化因子HAC1のmRNAを特定の部位で切断し、スプライソソーム非依存のスプライシングを行うことでHaclpの翻訳を可能にする。この全く新しいスプライシングは、1)5'側と3'側の切断が独立に起こる、2)tRNAリガーゼが関与する、3)細胞質で行われる、などの特徴を持ち、酵母から高等動物まで広く保存されている情報伝達機構である。本研究では小胞体ストレス応答におけるIREI経路、特にスプライソソーム非依存型スプライシング機構の構造的基盤の解明を目指した。
平成19年度は平成18年度に引き続きIrelp細胞質領域の立体構造解析および立体構造変化の解析を行うとともに、Irelp RNaseドメインとHAC1 mRNAとの相互作用解析、およびこれらの複合体の立体構造解析に取組んだ。また活性に重要な残基の変異体を作成し、立体構造変化の有無やRNase活性を確認した。Irelp RNaseドメインとHAC1 mRNAとの間では安定な複合体が得られなかったため、NMRによる滴定実験を行うことで、RNA配列特異的な認識に関与するアミノ酸残基の同定を試みた。また種々の変異体を用いたRNA結合実験およびRNase活性測定を行い、その配列特異的なRNA切断機構の一端を解明することに成功した。

  • Research Products

    (4 results)

All 2008 2007

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Structural analysis of phototactic transducer protein HtrII linker region from Natronomonas pharaonis2007

    • Author(s)
      K. Hayashi
    • Journal Title

      Biochemistry 46

      Pages: 14380-14390

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enzymatic Characterization of 5-Methlthioribose 1-Phosphate Isomerase from Bacillus subtilis2007

    • Author(s)
      Y. Saito
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 71

      Pages: 2021-2028

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of rice NADPH oxidase by binding of Rac GTPase to its N-terminal extension2007

    • Author(s)
      H. L. Wong
    • Journal Title

      Plant Cell 19

      Pages: 4022-4034

    • Peer Reviewed
  • [Book] 基礎から学ぶ構造生物学2008

    • Author(s)
      児嶋長次郎
    • Total Pages
      216
    • Publisher
      共立出版
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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