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2007 Fiscal Year Annual Research Report

真空紫外円二色性による蛋白質構造解析の新展開

Research Project

Project/Area Number 18570107
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

月向 邦彦  Hiroshima University, 大学院・理学研究科, 特任教授 (10023467)

Keywords放射光 / 真空紫外円二色性 / タンパク質 / 変性状態 / 二次構造解析 / アミノ酸配列
Research Abstract

広島大学放射光科学研究センターの真空紫外円二色性(VUVCD)分散計を用い,以下の3点について研究した。[1]蛋白質・脂質相互作用系の解析:α_1-acid-glycoprotein (AGP)とリン脂質の相互作用を調べた。AGPはリン脂質との混合によりα-ヘリックスは11%(2本)から50%(7本)に,β-ストランドは40%(11本)から10%(4本)へと変化し,脂質との相互作用により大きな二次構造変化が誘起されることがわかった。さらに,昨年度開発したニューラルネットワーク法により二次構造部位を予測した結果,これらの構造変化は主としてリガンド結合部位で起こっており,構造と機能との関係について重要な知見が得られた。[2]アルコール変性状態の構造解析:6種の蛋白質のVUVCDスペクトルを,種々の濃度のトリフルオロエタノール(TFE)とメタノール(MeOH)水溶液中で170nmまで測定した。すべての蛋白質で70%以上のα-ヘリックが形成されているものの,MeOH中では蛋白質によってはβ-ストランドが20%程度形成されており,アルコール変性は他の変性構造と大きく異なることがわかった。[3]蛋白質・蛋白質系(アミロイド構造)の解析:β_2-microglobulin (β2-m)とその2本の断片ペプチド(#21-31・#21-29)をアミロイド化した後,175nmまでVUVCDスペクトル測定した結果,β-シート構造の形成が観察された。現在,海外研究協力者であるR.W. Woody教授とともに,詳細な二次構造解析を行なっている。
これらの結果は,VUVCD分光法が蛋白質構造解析に対して有用な情報を提供することを示している。

  • Research Products

    (13 results)

All 2008 2007

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (10 results)

  • [Journal Article] Improved sequence-based prediction of protein secondary structures by combining vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy with neural network2008

    • Author(s)
      Koichi Matsuo
    • Journal Title

      Proteins (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Secondary-structure analysis of denatured proteins by vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy2007

    • Author(s)
      Koichi Matsuo
    • Journal Title

      Biophys. J. 92

      Pages: 4088-4096

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Secondary-structure analysis of trifluoroethanol-denatured proteins using a vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy2007

    • Author(s)
      Koichi Matsuo
    • Journal Title

      HiSOR Activity Report 2006

      Pages: 97-98

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] 真空紫外円二色性分光法によるジスルフィド結合除去リゾチームの二次構造解析2008

    • Author(s)
      松尾光一
    • Organizer
      日本化学会第88回春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080326-30
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] 真空紫外CD分光法とニューラルネットワークの併用によるアミノ酸配列レベルでの蛋白質二次構造解析2008

    • Author(s)
      月向邦彦
    • Organizer
      2008年度日本農芸化学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20080326-29
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Secondary-structure analysis of alcohol-denatured proteins by VUV circular dichroism spectroscopy2008

    • Author(s)
      Koichi Matsuo
    • Organizer
      The 12th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Place of Presentation
      Hiroshima
    • Year and Date
      20080313-14
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Secondary-structure analysis of disulfide-deleted lysozyme by VUV circular dichroism spectroscopy2008

    • Author(s)
      Hidenori Watanabe
    • Organizer
      The 12th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Place of Presentation
      Hiroshima
    • Year and Date
      20080313-14
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Overview of VUV circular dichroism spectroscopy at HiSOR2008

    • Author(s)
      K., Gekko, K., Matsuo
    • Organizer
      The 12th Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • Place of Presentation
      Hiroshima
    • Year and Date
      20080313-14
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [Presentation] 真空紫外円二色性分光法を用いたアルコール変性タンパク質の二次構造解析2008

    • Author(s)
      松尾光一
    • Organizer
      第21回日本放射光学会年会
    • Place of Presentation
      滋賀
    • Year and Date
      20080107-09
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] 真空紫外円二色性分光法によるジスルフィド結合除去リゾチームの二次構造解析2007

    • Author(s)
      渡部秀典
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071221-23
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] 真空紫外CD分光法によるアルコール変性タンパク質の二次構造解析2007

    • Author(s)
      松尾光一
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071221-13
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Secondary-structure analysis of native proteins by vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy2007

    • Author(s)
      Kunihiko Gekko
    • Organizer
      The 11th International Conference on Circular Dichroism
    • Place of Presentation
      Groningen, Netherlands
    • Year and Date
      20070902-06
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] Secondary-structure analysis of native and non-native proteins using vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy2007

    • Author(s)
      K., Matsuo, K., Gekko
    • Organizer
      The 15th International Conference on Vacuum Ultraviolet Radiation Physics
    • Place of Presentation
      Berlin, Germany
    • Year and Date
      20070729-0803
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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