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2007 Fiscal Year Annual Research Report

ストレス環境下でも翻訳されるmRNAのゲノムスケールでの探索

Research Project

Project/Area Number 18580338
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

加藤 晃  Nara Institute of Science and Technology, バイオサイエンス研究科, 助教 (80283935)

Keywords翻訳制御 / 環境ストレス / シロイヌナズナ / DNAマイクロアレイ / ポリソームプロファイル
Research Abstract

本研究は、ストレス環境下において選択的に翻訳されるmRNAを、マイクロアレイを用いてゲノムスケールで探索し、ストレス間での挙動を比較するとともに、共通性という観点から制御を規定するコンセンサス配列を同定することを目的としている。
1. ポリソームプロファイル解析とDNAマイクロアレイ解析
昨年度決定した塩ストレス条件に基づき、非ストレスおよび塩ストレス条件からポリソーム分画を行い、それぞれポリソームおよび非ポリソーム画分から独立に計4種類のmRNAを調製した。これらをセットで蛍光ラベルし、シロイヌナズナDNAマイクロアレイを用いてアレイ解析を行い、ポリソームと非ポリソーム画分に存在するmRNAの量比を、ストレスを与えたことによる変化という観点から定量し、複数の候補mRNAを得た。
2. 候補mRNAのストレスにおける翻訳状態
複数の候補mRNAについて、ストレス時の翻訳状態を各画分から調製したmRNAを用いたRT-PCRによってモニターしたところ、アレイの結果を完全に反映した。
3. ストレス間での共通性と特殊
昨年度実施した熱ストレスでのアレイ解析の結果と塩ストレスでの結果を比較したところ、全体としての挙動は両ストレス間で非常に類似していたが、一部遺伝子については、ストレス間で挙動が異なった。このことは、ストレス下での翻訳が共通の制御で行われているとともに、ストレス特異的な制御も存在することを示唆している。
今後、in silico解析等を通じて、制御を規定するコンセンサス配列が同定されることが期待される。

  • Research Products

    (6 results)

All 2008 2007

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Improved translation efficiency in chrysanthemum and torenia with a translational enhancer derived from the tobacco alcohol dehydrogenase gene.2008

    • Author(s)
      Aida, R.
    • Journal Title

      Plant Biotechnology 25

      Pages: 69-75

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The 5'-Untranslated Region of the Oryza sativa Alcohol Dehydrogenase Gene Functions as a Translational Enhancer in Monocotyledonous Plant Cells.2008

    • Author(s)
      Sugio, T.
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng. 105

      Pages: 300-302

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Preferential translation mediated by the Hsp81-3 5'-UTR during heat shock involves a ribosome entry at the 5'-end rather than an internal site in Arabidopsis suspension cells.2008

    • Author(s)
      Matsuura, H.
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng. 105

      Pages: 39-47

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] シロイヌナズナ培養細胞の翻訳段階における熱ストレス応答のゲノムワイド解析2008

    • Author(s)
      松浦 秀幸
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2008-03-19
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] シロイヌナズナHsp81-3 5' UTRを介した熱ストレス時の翻訳には、IRESではなくキャップ構造を含む5'端へのリボソームエントリーが重要である2007

    • Author(s)
      松浦 秀幸
    • Organizer
      日本RNA学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2007-07-28
  • [Presentation] Search IRES element of the cellular mRNA in Arabidopsis.2007

    • Author(s)
      Kawamura Kazue
    • Organizer
      6th symposium on Post Transcriptional Regulation of Plant Gene Expression
    • Place of Presentation
      Carry-le-Rouet, France
    • Year and Date
      2007-05-10

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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