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2007 Fiscal Year Annual Research Report

時間分解霜線構造解析・分光法によるカロテノイドの光保護分子メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 18684016
Research InstitutionOsaka City University

Principal Investigator

藤井 律子  Osaka City University, 大学院・理学研究科, 博士研究員 (80351740)

Keywords光物性 / たんぱく質構造・物性 / 光誘起協力現象 / 光合成 / エネルギー散逸
Research Abstract

本年度は,昨年度に引き続いて天然体である紅色光合成細菌Rhodobacter sphaeroides2.4.1の光反応中心(RC)色素蛋白複合体の結晶の大量調製を行うかたわら,カロテノイドを持たない変異株であるRhodobacter sphaeroidesR26.1のRCに,別途抽出・精製したカロテノイドであるスフェロイデンを再構成したRCの結晶化を行った[カロテノイドの純度確認などに用いる高速液体クロマトグラフを購入]。特に再構成RCの結晶生成の歩留まりは非常に悪く,一度に精製する量を増やすと再構成効率が落ちるという問題が浮き上がってきた。クライオプロテクション及びシッティングドロップ型の結晶育成井戸からの結晶のピックアップには,リソグラフの技術を応用して開発された新しいループを採用して作業技術の向上を図った。また,昨年度取得したデータの構造精密化を最初から最後まで自身で行った。この際,上記のRC結晶について分解能1.95〜2.1Åという世界最高の分解能のデータを複数得ることに成功した。これらの詳細な解析及びデータの比較により,これまであまり注目されていなかった,蛋白質のふらつきの多い部分,蛋白質表面に存在する水分子,界面活性剤分子,脂質分子の挙動について様々な知見が得られた。また,カロテノイド部位の電子密度は非常に濃いが,数10分の1Å程度の構造変化を議論するためには2.5Åを切る高分解能の結晶を用いる必要があることがわかり,歩留まりが悪い現在の状況では更なる大量生産を続けなければならないことが明らかになった。また,結晶の一部分の赤外吸収スペクトルを測定することにより,カロテノイドの有無を瞬時に判定できる赤外顕微システムを用いることを検討した[赤外顕微鏡及び観察型顕微ATRを購入]り,結晶を液体窒素温度に保ったままレーザーで励起できるシステムを考案し[液体窒素クライオスタットを購入],結晶そのものの分光学的観測を行える環境を整備中である。

  • Research Products

    (24 results)

All 2008 2007

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (17 results)

  • [Journal Article] Coherent spectroscopy of carotenoid and bacteriochlorophyll2008

    • Author(s)
      M. Sugisaki, M. Fujiwara, K. Yanagi, R. Fujii, R. J. Cogdell, and H. Hashimoto
    • Journal Title

      Photosynthesis.Energy of Sun: 14th International Congress on Photosynthesis Research 2007 (ed.J.F.Allen, et. al., Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg, New York, Tokyo)

      Pages: 259-262

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Electrostatic effect of surfactant molecules on bacteriochlorophyll a and carotenoid binding site in the LH1 complex isolated from Rhodospirillum SI probed by Stark spectroscopy2008

    • Author(s)
      K. Nakagawa, S. Suzuki, R. Fujii, A. Gardiner, R. Cogdell, M. Nango, and H. Hashimoto
    • Journal Title

      Photosynthesis Research 95

      Pages: 345-351

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Probing binding site of bacteriochlorophyll a and carotenoid in the reconstituted LHl complex from Rhodospirillum rubrum Sl by Stark spectroscopy2008

    • Author(s)
      K. Nakagawa, S. Suzuki, R. Fujii, A. Gardiner, R. Cogdell, M. Nango, and H. Hashimoto
    • Journal Title

      Photosynthesis Research 95

      Pages: 339-334

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of hybrid photosynthetic units using peripheral and core antennae from two different species of photosynthetic bacteria: Detection of the energy transfer from bacteriochlorophyll a in LH2 to bacteriochlorophyll b in LHl2008

    • Author(s)
      R. Fujii, S. Shimonaka, N. Uchida, A. T. Gardiner, R. J. Cogdell, M. Sugisaki, and H. Hashimoto
    • Journal Title

      Photosynthesis Research 95

      Pages: 327-337

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Linear and nonlinear optical responses in bacteriochlorophyll a2008

    • Author(s)
      M. Sugisaki, R. Fujii, R. J. Cogdell, and H. Hashimoto
    • Journal Title

      Photosynthesis Research 95

      Pages: 309-316

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Femtosecond time-resolved absorption spectra of photosynthetic membrane from apurple bacterium Blastochloris (Rhodopseudomonas) viridis2007

    • Author(s)
      R. Fujii, N. Wakatake, S. Shimonaka, Q. -D. Chen, M. Sugisaki, A. T. Gardiner, R. J. Cogdell. and H. Hashimoto
    • Journal Title

      Carotenoid Science 11

      Pages: 26-31

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The S_2 excited state and nonlinear optical effects in carotenoids investigated by femtosecond fluorescence and absorption spectroscopies2007

    • Author(s)
      M. Yoshizawa, D. Kosumi, M. Komukai, K. Yanagi. R. Fujii, and H. Hashimoto
    • Journal Title

      Carotenoid Science 11

      Pages: 21-25

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 紅色光合成細菌のアンテナ系LH1複合体の構造形成とカロテノイド色素の機能評価2008

    • Author(s)
      中川 勝統、水野 愛弓、中野 翼、福井 直美、出羽 毅久、藤井 律子、橋本 秀樹、南後 守
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      立教大学池袋キャンパス
    • Year and Date
      20080326-30
  • [Presentation] 超高速レーザー分光で見えてきた光合成アンテナ色素蛋白複合体の機能2008

    • Author(s)
      橋本 秀樹・杉崎 満・藤原 正澄、藤井 律子、Cogdell R.J.
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      立教大学 池袋キャンパス
    • Year and Date
      20080323-30
  • [Presentation] Reconstitution of Light-harvesting l complex of photosynthetic bacterium Rhodospirillum rubrum with the LHl subunit-type complex and carotenoids and itscharacterization2007

    • Author(s)
      K. Nakagawa, S. Suzuki, A. Mizuno, R. Fujii, A. T. Gardiner, RJ. Cogdell, H. Hashimoto, M. Nango
    • Organizer
      2nd lnternational Workshop of Photosynthetic Antennae and Coherent Phenomena
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20071214-16
  • [Presentation] β-Conjugated Chain Length Dependence of the dication state of Polar Carotenoid Analogues Measured by Nanosecond Time-Resolved Absorption Spectroscopy2007

    • Author(s)
      Toshiyuki Kusumoto, Ritsuko Fujii, and Hideki Hashimoto
    • Organizer
      2nd International Workshop of Photosynthetic Antennae and Cherent Phenomena
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20071214-16
  • [Presentation] 非共鳴励起によるカロテノイド類の超高速光学応答と多光子励起過程2007

    • Author(s)
      小澄 大輔, 藤原 正澄, 藤井 律子, 橋本 秀樹, 吉澤 雅幸
    • Organizer
      第62回日本物理学会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      20070923-24
  • [Presentation] バクテリオクロロフィルaの超高速光学応答II2007

    • Author(s)
      杉崎 満, 藤井 律子, 橋本 秀樹
    • Organizer
      第62回日本物理学会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      20070921-24
  • [Presentation] 非共鳴励起によるカロテノイド類の超高速光学応答と多光子励起過程2007

    • Author(s)
      小澄 大輔, 藤原 正澄, 藤井 律子, 橋本 秀樹, 吉澤 雅幸
    • Organizer
      第62回目本物理学会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      20070921-24
  • [Presentation] 極性カロテノイド同属体のナノ秒時間分解吸収分光2007

    • Author(s)
      楠本 利行, 藤井 律子, 橋本 秀樹
    • Organizer
      第62回日本物理学会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      20070921-24
  • [Presentation] 紅色光合成細菌のアンテナ系タンパク質/色素複合体(LHI)のタンパク質とカロテノイドとの再構成とその評価2007

    • Author(s)
      中川 勝統, 鈴木 聡, 水野 愛弓, 福井 直美, 中野 翼, 藤井 律子, 出羽 毅久, 橋本 秀樹, 南後 守
    • Organizer
      第21回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      大阪市立大学
    • Year and Date
      20070906-07
  • [Presentation] 極性カロテノイド同属体のナノ秒時間分解吸収分光2007

    • Author(s)
      楠本 利行, 藤井 律子, 橋本 秀樹
    • Organizer
      第21回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      大阪市立大学
    • Year and Date
      20070906-07
  • [Presentation] カロテノイド類における超高速励起状態ダイナミクスの共役長依存性2007

    • Author(s)
      小澄 大輔, 阿部 健太, 藤原 正澄, 藤井 律子, 橋本 秀樹, 吉澤 雅幸
    • Organizer
      第1回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20070900
  • [Presentation] Coherent Spectroscopy in Carotenoid and Bacteriochlorophyll2007

    • Author(s)
      Mitsuru Sugisaki, Masazumi Fujiwara, Kazuhiro Yanagi, Ritsuko Fujii, Richard J. Cogdell, and HidekiHashimoto
    • Organizer
      14th International Congress on Photosynthesis
    • Place of Presentation
      Glasgow, Scotland
    • Year and Date
      20070723-27
  • [Presentation] Probing the carotenoid in its binding site in a Reconstituted LH1 complex fromthe photosynthetic Bacterium Rhodospirillum rubrum with electroabsorption spectroscopy2007

    • Author(s)
      K. Nakagawa, S. Suzuki, R. Fujii, A. T .Gardiner, R. J. Cogdell, H. Hashimoto, M. Nango
    • Organizer
      14th International Congress on Photosynthesis
    • Place of Presentation
      Glasgow, Scotland
    • Year and Date
      20070723-27
  • [Presentation] Sub-20 fs coherent spectroscopy of photosynthetic pigments2007

    • Author(s)
      M. Sugisaki, R. Fujii, R. J. Cogdell and H. Hashimoto
    • Organizer
      Satellite Workshop on Photosynthetic Light-Harvesting Systems
    • Place of Presentation
      Drymen, Scotland
    • Year and Date
      20070719-22
  • [Presentation] Construction of hybrid photosynthetic units using peripheral and core antennae from two different species of photosynthetic bacteria:Detection of the energy transfer from bacteriochlorophyll a in LH2 to bacteriochlorophyll b in LHl2007

    • Author(s)
      R. Fujii, S. shimonaka, N. Uchida, A. T. Gardiner, R. J.Cogdell, M. Sugisaki, and H. Hashimoto
    • Organizer
      Satellite Workshop on Photosynthetic Light-Harvesting Systems
    • Place of Presentation
      Drymen, Scotland
    • Year and Date
      20070719-22
  • [Presentation] Reconstitution of carotenoids into light-harvesting 1 complex of purple bacterium Rhodospirillum rubrum and analysis of electrostatic environment of pigments in the complexes2007

    • Author(s)
      K. Nakagawa, S. Suzuki, R. Fujii, A. T. Gardiner, R. J. Cogdell, H. Hashimoto, M. Nango
    • Organizer
      Satellite Workshop on Photosynthetic Light-Harvesting Systems
    • Place of Presentation
      Drymen, Scotland
    • Year and Date
      20070718-21
  • [Presentation] Vibronic Coherence of Photosynthetic Pigments2007

    • Author(s)
      M. Sugisaki, M. Fujiwara, R. Fujii, K. Nakagawa, M. Nango, R. J. Cogdell, and H. Hashimoto
    • Organizer
      The 15t International Conference on Luminescence and Optical Spectroscopy of Condensed Matter (ICL'08)
    • Place of Presentation
      Lyon, France
    • Year and Date
      20070707-11

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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