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2008 Fiscal Year Annual Research Report

時間分解X線構造解析・分光法によるカロテノイドの光保護分子メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 18684016
Research InstitutionOsaka City University

Principal Investigator

藤井 律子  Osaka City University, 大学院・理学研究科, 博士研究員 (80351740)

Keywords光物性 / たんぱく質構造・物性 / 光誘起協力現象 / 光合成 / エネルギー散逸
Research Abstract

前年度までの研究により、カロテノイド部位の電子密度は非常に濃いが、数10分の1A程度のカロテノイドの構造変化を議論するためには2.5Aを切る高分解能の結晶を用いる必要があることが判明したが、これまでは直径250μm〜400μm、長さ1mm程度の大きな六角柱状の結晶でしか高分解能のX線回折像を得る事ができなかった。しかしながら光を用いた均一な励起を行なうためには少なくとも透過する光の波長が存在することが必須となる。本年はこの本質的問題について最終的な検討を行なった。天然体である紅色光合成細菌Rhodobacter sphaeroides 2.4.1の光反応中心色素蛋白複合体の結晶の大量調製を行い、得られた結晶について、(1)様々な形状・大きさ(小ささ)の結晶について大阪市大のX線発生装置(R-AXIS)を用いて分解能を確認すること、(2)実際にX線測定に供する結晶の透過率の波長依存性を調べて透過(励起)可能な波長を決定することに焦点を当てた。R-AXISを用いたプレ測定を繰り返し行なう間に、結晶の選択(結晶の仕込みか照測定までの時間や、実体顕微鏡による観察で結晶に割れ目、すじ、しわ、ゆがみなどが見照れるかどうか)、結晶の前処理(シッティングドロップのウェルからすくい上げるフィッシング操作、クライオプロテクション処理)で疑問を感じた場合にはほとんど高い分解能が得照れないということが明らかになった。これは結晶の大きさにはあまり関わりが無かったため、今回、実体顕微鏡観察でかろうじて光の透過が目視できる程度の大きさの結晶に焦点を絞り、繰り返し測定を行なうことにより、直径120μm〜150Fm、長さ400μm〜1mmの小さい六角柱状結晶についてR-AXISで3A程度の回折像を得ることに成功した。これを用いて近日中に、ビームラインにおいて時間分解測定を行なう予定である。

  • Research Products

    (40 results)

All 2009 2008

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (35 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Probing the Effect of the Binding Site on the Electrostatic Behavior of a Series of Carotenoids Reconstituted into the Light-Harvesting 1 Complex from Purple Photosynthetic Bacterium Rhodospirillum rubrum Detected by Stark Spectroscopy2008

    • Author(s)
      K. Nakagawa S. Suzuki, R. Fujii, A. T. Gardiner, R. J. Cogdell, M. Nango, H. Hashimoto
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B 112

      Pages: 9467-9475

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 再構成LH1複合体中のスピリロキサンチンの電場変調吸収分光のX依存性2008

    • Author(s)
      堀部智子, 中川勝統, 楠本利行, 鈴木聡, 藤井律子, A.T. Gardiner, R.J. Cogdell, 南後守, 橋本秀樹
    • Journal Title

      光物性研究会論文集 19

      Pages: 86-89

  • [Journal Article] 紅色光合成細菌の光反応中心タンパク複合体のFT-IR分光測定2008

    • Author(s)
      柴田江身子, 藤井律子, 橋本秀樹
    • Journal Title

      光物性研究会論文集 19

      Pages: 362-365

  • [Journal Article] Characterization by Stark Spectroscopy of Reconstituted Light-Harvesting 1 Complex of Purple Photosynthetic Bacterium Rhodospirillum rubrum with the Polypeptides, Bacteriochlorophyll a, and Carotenoids2008

    • Author(s)
      K. Nakagawa, A. Mizuno, S.Suzuki, R. Fujii, T. Dewa, A.T. Gardiner, R.J. Cogdell, M. Nango, H. Hashimoto
    • Journal Title

      Carotenoid Science 13

      Pages: 38-45

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 原子間力顕微鏡による光合成色素アンテナ系タンパク複合体を組み込んだ再構成膜のその場観察2009

    • Author(s)
      須貝祐子, 藤井律子, 杉崎満, 南後守, 橋本秀樹
    • Organizer
      日本化学会第89回春年会
    • Place of Presentation
      日本大学船橋キャンパス
    • Year and Date
      20090327-30
  • [Presentation] パルス繰り返しに同期したフェムト秒広帯域検出システムの構築と光合成初期過程への応用2009

    • Author(s)
      殿内規之, 須貝祐子, 藤井律子, 小澄大輔, 吉澤雅幸, 杉崎満, 橋本秀樹
    • Organizer
      日本物理学会第64回年次大会
    • Place of Presentation
      立教学院池袋キャンパス
    • Year and Date
      20090327-30
  • [Presentation] オキナワモズク盤状体由来のフコキサンチン-クロロフィルa/c蛋白質(FCP)の単離2009

    • Author(s)
      喜多麻美子, 藤井律子, 伊波匡彦, 橋本秀樹
    • Organizer
      第50回日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(名古屋市)
    • Year and Date
      20090321-24
  • [Presentation] Femtosecond Time-resolved Absorption Spectroscopy of a Polar Carotenoid Analo gue, 2-(all-trans-retinylidene) Indan-1, 3-dione in Various Solvents2009

    • Author(s)
      T. Kusumoto, D. Kosumi, T. Hashi moto, R. Fujii, M. Sugisaki, and H. Hashimoto
    • Organizer
      Light-Harvesting Processes (LHP 2009)
    • Place of Presentation
      Banz Monestary, Germany
    • Year and Date
      20090310-14
  • [Presentation] a-Conjugation Chain Length Dependence of the Dication State of Polar Carotenoid Analogues Measured by Nanosecond Time-Resolved Absorption Spectroscopy2009

    • Author(s)
      T. Kusumoto, R. Fujii, D. Kosumi and H. Hashimoto
    • Organizer
      Light-Harvesting Processes (LHP 2009)
    • Place of Presentation
      Banz Monestary, Germany
    • Year and Date
      20090310-14
  • [Presentation] Transient Grating Spectroscopy in Rhodobacter Sphaeroides 2.4.12009

    • Author(s)
      Y. Sugai, M. Sugisaki, M. Fujiwara, R. Fujii, R. J. Cogdell, and H. Hashimoto
    • Organizer
      Light-Harvesting Processes (LHP 2009)
    • Place of Presentation
      Banz Monestary, Germany
    • Year and Date
      20090310-14
  • [Presentation] 光合成細菌のアンテナ系LH1複合体のStark分光とカロテノイド分子の構造解析2009

    • Author(s)
      中川勝統, 堀部智子, 酒井俊亮, 中島彩乃, 藤井律子, 橋本秀樹, 南後守
    • Organizer
      平成20年度生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(名古屋市)
    • Year and Date
      2009-03-31
  • [Presentation] 再構成LH1複合体中のスピリロキサンチンの電場変調吸収分光のx依存性2008

    • Author(s)
      堀部智子, 中川勝統, 楠本利行, 鈴木聡, 藤井律子, Alastair T. Gardiner, Richard J. Cogdell, 南後守, 橋本秀樹
    • Organizer
      第19回光物性研究会
    • Place of Presentation
      大阪市立大学(大阪市)
    • Year and Date
      20081205-06
  • [Presentation] 紅色光合成細菌の光反応中心タンパク複合体のFT-IR分光測定2008

    • Author(s)
      柴田江身子, 藤井律子, 橋本秀樹
    • Organizer
      第19回光物性研究会
    • Place of Presentation
      大阪市立大学(大阪市)
    • Year and Date
      20081205-06
  • [Presentation] 光エネルギー変換素子としてのタンパク質/色素超分子複合体の構造形成と機能評価2008

    • Author(s)
      中川勝統, 中野翼, 福井直美, 出羽毅久, 藤井律子, 橋本秀樹, 南後守
    • Organizer
      第57回高分子討論会
    • Place of Presentation
      大阪市立大
    • Year and Date
      20080924-26
  • [Presentation] 紅色光合成細菌Rb. sphaeroides2.4.1における縮退四光波信号2008

    • Author(s)
      杉崎満, 藤原正澄, 藤井律子, 橋本秀樹
    • Organizer
      日本物理学会第64回年次大会
    • Place of Presentation
      岩手大学上田キャンパス(盛岡市)
    • Year and Date
      20080920-23
  • [Presentation] 光合成アンテナ系LHI複合体中のカロテノイド色素のプローブ効果2008

    • Author(s)
      中川勝統, 中野翼, 福井直美, 出羽毅久, 藤井律子, 橋本秀樹, 南後守
    • Organizer
      2008年光化学討論会
    • Place of Presentation
      大阪府立大
    • Year and Date
      20080911-13
  • [Presentation] 光合成細菌のアンテナ系複合体でのカロテノイド分子結合サイトの検討2008

    • Author(s)
      中川勝統, 中野翼, 福井直美, 出羽毅久, 藤井律子, 橋本秀樹, 南後守
    • Organizer
      第18回バイオ・高分子シンポジウム
    • Place of Presentation
      上智大
    • Year and Date
      20080725-26
  • [Presentation] 共役二重結合鎖数の異なるカロテノイドを用いた光合成細菌のアンテナ系LH1複合体の再構成とその評価2008

    • Author(s)
      中川勝統, 福井直美, 中野翼, 堀部智子, 出羽毅久, 藤井律子, 橋本秀樹, 南後守
    • Organizer
      第22回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      ホテルムーンビーチ(沖縄)
    • Year and Date
      20080628-29
  • [Presentation] Rs. rubrumのアンテナ系タンパク質/色素複合体のカロテノイドを含む再構成2008

    • Author(s)
      中野翼, 福井直美, 中川勝統, 出羽毅久, 藤井律子, 橋本秀樹, 南後守
    • Organizer
      第22回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      ホテルムーンビーチ(沖縄)
    • Year and Date
      20080628-29
  • [Presentation] Rb. Sphaeroides由来のアンテナ系タンパク質/色素複合体のカロテノイドを含む再構成2008

    • Author(s)
      福井直美, 中野翼, 中川勝統, 出羽毅久, 藤井律子, 橋本秀樹, 南後守
    • Organizer
      第22回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      ホテルムーンビーチ(沖縄)
    • Year and Date
      20080628-29
  • [Presentation] 紅色光合成細菌Rs. rubrum S1株由来のLH1複合体の電場変調吸収分光測定 : χ依存性の測定2008

    • Author(s)
      堀部智子, 中川勝統, 楠本利行, 鈴木聡, 藤井律子, A.T. Gardiner, R.J. Cogdell, 南後守, 橋本秀樹
    • Organizer
      第22回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      ホテルムーンビーチ(沖縄)
    • Year and Date
      20080628-29
  • [Presentation] Rhodobacter sphaeroides 2.4.1における過渡回折格子信号2008

    • Author(s)
      杉崎満, 藤原正澄, 藤井律子, 中川勝統, 南後守, 橋本秀樹
    • Organizer
      第22回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      ホテルムーンビーチ(沖縄)
    • Year and Date
      20080628-29
  • [Presentation] 異種の光合成細菌由来のアンテナ及びコア複合体をもつ再構成光合成膜の創製2008

    • Author(s)
      藤井律子, 下中奨三, 内田直子, A.T. Gardiner, R.J. Cogdell, 杉崎満, 橋本秀樹
    • Organizer
      第22回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      ホテルムーンビーチ(沖縄)
    • Year and Date
      20080628-29
  • [Presentation] 紅色光合成細菌の光反応中心に結合した15-cisカロテノイドのFT-IR差スペクトル2008

    • Author(s)
      柴田江身子, 藤井律子, 橋本秀樹
    • Organizer
      第22回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      ホテルムーンビーチ(沖縄)
    • Year and Date
      20080628-29
  • [Presentation] Structure of Reaction Centre Carotenoid in Blastochloris viridis2008

    • Author(s)
      A.W. Roszak, A.T. Gardiner, V. Moulisova, A.D. Putranto, R. Fujii, H. Hashimoto, N.W. Isaacs, R.J. Cogdell
    • Organizer
      第22回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      ホテルムーンビーチ(沖縄)
    • Year and Date
      20080628-29
  • [Presentation] Construction of Hybrid Photosynthetic Units using Peripheral and Core Antennae from Two Different Species of Photosynthetic Bacteria : Detection of the Energy Transfer from Bacteriochlorophyll a in LH2 to Bacteriochlorophyll b in LH12008

    • Author(s)
      R. Fujii, S. Shimonaka, N. Uchida, A. T. Gardiner, R. J. Cogdell, M. Sugisaki and H. Hashimoto
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] Probing the Effect of the Binding Site on the Electrostatic Behavior of A Series of Carotenoids Reconstituted into the Light-Harvesting 1 Complex from Purple P hotosynthetic Bacterium Rhodospirillum rubrum Detected by Stark Spectroscopy2008

    • Author(s)
      K. Nakagawa, N. Fukui, T. Nakano, T. Horibe, S. Suzuki, R. Fujii, A.T. Gardiner, R.J. Cogdell, H. Hashimo to and M. Nango
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] Reconstitution of Antenna Light-Harvesting 1 Complexes from the Purple Photosynthetic Bacterium Rhodobacter sphaeroides with LH1-Polypeptides, Bacteriochlorophyll a, and Carotenoids : Carotenoid Specificity2008

    • Author(s)
      N. Fukui, A. Mizuno, T. Nakano, K. Nakagawa, A.T. Gardiner, R. J. Cogdell, R. Fujii, H. Hashimoto, M. Nango
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] Reconstitution of Light-Harvesting 1 Complexes from the Purple Photosynthetic Bacterium Rhodospirillum rubrum with Separately Isolated Polypeptides (LH1-a and LHI-β), Bacteriochlorophyll a, and Carotenoid2008

    • Author(s)
      T. Nakano, N. Fukui, K. Nakagawa, A.T.Gardiner, R.J. Cogdell, R. Fujii, H. Hashimoto, M. Nango
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] Transient Grating Spectroscopy in Rhodobacter sphaeroides 2.4.12008

    • Author(s)
      M. Sugisaki, M. Fujiwara, R. Fujii, K. Nakagawa, M. Nango, R.J. Cogdell, H. Hashimoto
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] Electroabsorption Spectroscopy of Native and Reconstituted LH1 Complexes from Purple Photosynthetic Bacterium Rhodospirillum rubrum2008

    • Author(s)
      T. Horibe, K. Nakagawa, T. Kusumoto, S. Suzuki, R. Fujii, A. T. Gardiner, R.J. Cogdell, M. Nango, H. Hashimoto
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] π-Conjugation Chain Length Dependence of the Dication State of Polar Carotenoid Analogues Measured by Nanosecond Time-Resolved Absorption Spectroscopy2008

    • Author(s)
      T. Kusumoto, R. Fujii, H. Hashimoto
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] Femtosecond Time-Resolved Absorption Spectroscopy of a Polar Carotenoid Anal ogue, 2-(All-Trans-Retinylidene) Indan-1,3-Dione2008

    • Author(s)
      T. Kusumoto, T. Hashimoto, R. Fujii, M. Sugisaki, H. Hashimoto
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] Femtosecond Time-Resolved Absorption Spectra of Photosynthetic Membranes from a Purple Bacterium Blastochloris (Rhodopseudomonas) viridis2008

    • Author(s)
      R. Fujii, N. Wakatake, S. Shimonaka, Q.-D. Chen, M. Sugisaki, A.T. Gardiner, R.J. Cogdell, H. Hashimoto
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] FT-IR Difference Spectrum of a 15-Cis Carotenoid Bound to the Reaction Centre from a Purple Photosynthetic Bacterium Rhodobacter sphaeroides2008

    • Author(s)
      E. Shibata, R. Fujii, H. Hashimoto
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] Structure of the Carotenoid Bound to the Reaction Centre from Blastochloris viri dis, The 15th International Symposium on Carotenoids2008

    • Author(s)
      A.W. Roszak, A.T. Gardiner, V. Moulisova, A.D. Putranto, R. Fujii, H. Hashimoto, N.W. Isaacs, R.J. Cogdell
    • Organizer
      15^<th> International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Hotel Moon Beach, Okinawa, Japan
    • Year and Date
      20080622-27
  • [Presentation] Transient Grating Spectroscopy in Photosynthetic Purple Bacteria Rhodobacter sphaeroides 2.4.12008

    • Author(s)
      M. Sugisaki, M. Fujiwara, R. Fujii, K. Nakagawa, M. Nango, R.J. Cogdell, and H. Hashimoto
    • Organizer
      The 15^<th> International Conference on Luminescence and Optical Spectroscopy of Condensed Matter(ICL08)
    • Place of Presentation
      Lyon, France
    • Year and Date
      20080607-11
  • [Presentation] Femtosecond Time-Resolved Absorption Spectroscopy of a Polar Carotenoid Anal ogue, 2-(All-Trans-Retinylidene) Indan-1, 3-Dione2008

    • Author(s)
      T. Kusumoto, T. Hashimoto, R. Fujii, M. Sugisaki, and H. Hashimoto
    • Organizer
      The 15^<th> International Conference on Luminescence and Optical Spectroscopy of Condensed Matter (ICL08)
    • Place of Presentation
      Lyon, France
    • Year and Date
      20080607-11
  • [Presentation] 紅色光合成細菌のアンテナ系LH1複合体の再構成とStark分光による機能評価2008

    • Author(s)
      中川勝統, 中野翼, 福井直美, 出羽毅久, 藤井律子, 橋本秀樹, 南後守
    • Organizer
      第8回日本光合成研究会公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大
    • Year and Date
      20080530-31
  • [Book] Petra Fromme (Ed.), Photosynthetic Protein Complexes A Structural Approach2008

    • Author(s)
      R.J. Cogdell, A.T. Gardiner, M. Gabrielsen, J. Southall, A.W. Roszak, N.W. Isaacs, R. Fujii, H. Hashimoto
    • Total Pages
      325-340
    • Publisher
      Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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