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2007 Fiscal Year Annual Research Report

地球上で最も未知な生物群「古細菌」ー純粋分離で開拓する多様な新生物機能ー

Research Project

Project/Area Number 18687006
Research InstitutionJapan Agency for Marine-Earth Science and Technology

Principal Investigator

井町 寛之  Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, 極限環境生物圏研究センター, 研究員 (20361933)

Keywords古細菌 / 分離 / 生物資源保全 / 16S rRNA 遺云子 / メタン / 嫌気的メタン酸化
Research Abstract

昨年度に引き続き,未培養のメタン生成古細菌(メタン菌)を分離するために私が開発した新規メタン生成古細菌の培養法である嫌気共生培養法を用いて,様々な環境から採取してきた土壌サンプル等を植種源として培養を行った。その結果,Methanomicrobiales目やMethanocellales目の新種あるいは新属新種を代表すると考えられる種のメタン菌を新たに10種程度集積培養することができた。さらに,これらの新規なメタン菌の中から3種類のメタン菌の分離に成功し,菌学的な特徴の決定を行った後に,命名を行った。
難培養性微生物の代表である嫌気性メタン酸化古細菌の培養を行うために,昨年度から引き続き新規嫌気性培養器を用いて培養を継続して行っている。昨年度は和歌山県沖の南海トラフから採取してきた深海堆積物を植種源にした培養系だけであったが,今年度は新たに下北半島東方沖で採取された深海底堆積物コアサンプルを植種源として培養を始めた。培養を開始してから9月経過した後に培養系内に嫌気的メタン酸化古細菌が生育しているかを確かめるために16S rRNA遺伝子に基づいた解析を行った。その結果,嫌気的メタン酸化古細菌を培養することができているというデータをとることができた。現在まで,嫌気的メタン酸化古細菌を培養できた例はほとんどなく,これは非常にインパクトのある成果である。さらに本年度は,昨年度作成していた嫌気的メタン酸化古細菌の検出、定量をするための16S rRNA遺伝子を標的にしたプライマーセットを用いて,環境中の嫌気的メタン酸化古細菌の多様性の調査を行った。その結果,いくつかの水田土壌において嫌気的メタン酸化古細菌が存在していることを明らかにした。水田は主要なメタンガス放出源であり,この発見も非常にインパクトがある。

  • Research Products

    (13 results)

All 2008 2007

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Methanolinea tarda gen.nov.sp.nov.,a methaneproducing archaeon isolated from a methanogenic digester sludge2008

    • Author(s)
      Imachi, H.
    • Journal Title

      lnternational Joumal of SyStematic and Evolutionary Microbilogy 58

      Pages: 294-301

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of enzymatic cell treatments for application of CARD-FISH to methanogens2008

    • Author(s)
      Kubota, K.
    • Journal Title

      Journal of Microbiological Methods 72

      Pages: 54-59

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation of key methanogens for global methane emission from rice paddy field=a novel isolate affiliated with a clone cluster,the Rice Cluster I2007

    • Author(s)
      Imachi, H.
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 73

      Pages: 4326-4331

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Syntrophomonas palmitatica sp.nov.,a novel anaerobic,syntropbic long-chain fatty acid-oxidizing bacterium isolated from a methanogenic sludge2007

    • Author(s)
      Imachi, H.
    • Journal Title

      International Joumal of Systematic and Evolutionary Microbilogy 57

      Pages: 2137-2142

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] solation of keymethanogens for global methane emission from rice paddy fielda novel isolate affiliated with aclone cluster,the Rice Cluster I2007

    • Author(s)
      Imachji, H.
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 73

      Pages: 4326-4331

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 水田土壌からのメタン生成キープレイヤー-Rice Cluster IIメタン生成古細菌を"嫌気共生培養法"で純粋分離に成功一2007

    • Author(s)
      酒井 早苗
    • Journal Title

      化学と生物(日本農芸化学会和文誌) 72

      Pages: 814-816

  • [Presentation] 嫌気共生培養法を利用した新規なメタン生成古細菌の分離・培養2008

    • Author(s)
      井町 寛之
    • Organizer
      第42回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2008-03-21
  • [Presentation] 嫌気的メタン酸化反応を担う微生物の分離の試み2008

    • Author(s)
      宮下 藍
    • Organizer
      第42回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2008-03-20
  • [Presentation] Archaea responsible for global methane emission and oxidation2008

    • Author(s)
      Imachi, H.
    • Organizer
      The 8th International Symposium Global Renaissance by Green Energy Revolution
    • Place of Presentation
      長岡技術科学大学
    • Year and Date
      2008-01-27
  • [Presentation] Isolation of Rice Xluster I methanogens playing a key role of glabal me thane emission2008

    • Author(s)
      Sakai, S.
    • Organizer
      The 8th International Symposium Global Remissance by Green Energy Revolution
    • Place of Presentation
      長岡技術科学大学
    • Year and Date
      2008-01-26
  • [Presentation] 16S rRNA gene-based molecular survey of anaerobic methaneoxidizingArchaea in terrestrial habitats2008

    • Author(s)
      Miyashita, A.
    • Organizer
      The 8th International Symposium Global Renaissance by Green Energy Revolution
    • Place of Presentation
      長岡技術科学大学
    • Year and Date
      2008-01-26
  • [Presentation] Isolation of athermophilic Rice Cluster I methanogen2007

    • Author(s)
      酒井 早苗
    • Organizer
      第23回日本微生物生態学会
    • Place of Presentation
      愛媛大学城北キャンパス
    • Year and Date
      2007-09-17
  • [Presentation] 16S rRNA phylogenetic investigation of anaerobic methane-oxidizing Archaea2007

    • Author(s)
      井町 寛之
    • Organizer
      第23回日本微生物生態学会
    • Place of Presentation
      愛媛大学城北キャンパス
    • Year and Date
      2007-09-17

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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