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2007 Fiscal Year Annual Research Report

精神疾患患者死後脳のDNAメチル化状態の網羅的解析

Research Project

Project/Area Number 18689029
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

岩本 和也  The Institute of Physical and Chemical Research, 精神疾患動態研究チーム, 研究員 (40342753)

KeywordsDNAマイクロアレイ / 双極性障害 / 統合失調症 / 精神疾患 / 死後脳 / エピジェネティクス / 遺伝子発現 / DNAメチル化
Research Abstract

二大精神疾患である統合失調症および双極性障害患者の死後脳サンプルを、米国スタンレー財団より入手し、DNAメチル化解析を行った。凍結前頭葉組織から抽出したゲノムDNAを用い、DNAメチル化状態をAffymetrix社製プロモータータイリングアレイを用いて網羅的に調べた。実験に際しては、前年度までに確立した条件を用い、神経細胞核でのみ発現している蛋白を標識し、セルソーターによる分離を行い、死後脳サンプルから神経細胞核と非神経細胞核に分離・回収した。また、それぞれの画分のDNAメチル化状態をタイリングアレイを用いてprofilingを行った。現在、主要なサンプルについてはタイリングアレイ実験を終了し、データ解析、及び、定量的PCR、pyrosequencingなどのvalidation実験を行い、疾患との関連を調べている。これらの主要な結果については現在投稿準備中である。本研究により、DNAメチル化パターンはヒト神経細胞、非神経細胞間で顕著な差異を示すことが明らかになり、本手法のように細胞群のある程度の純化操作抜きでは、ヒト脳サンプルにおけるDNAメチル化解析を行い、疾患の原因を探求することは困難であることが明らかになった。また、研究の過程で単一神経細胞のゲノム解析技術を確立することができた。現段階ではDNAメチル化解析そのものには応用できないが、本技術を基に単一神経細胞を対象としたDNAメチル化解析技術の開発が期待される。

  • Research Products

    (11 results)

All 2007 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Detection of chromosomal structural alterations in single cells by SNP arrays: a systematic survey of amplification bias and optimized workflow2007

    • Author(s)
      Kazuya Iwamoto
    • Journal Title

      Plos One 2

      Pages: e1306

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of the whole genome amplification methods from postmortem brain samples.2007

    • Author(s)
      Kazuya Iwamoto
    • Journal Title

      Journal of Neuroscience Methods 165

      Pages: 104-110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Behavioral and Gene Expression Analyses of Wfsl Knockout Mice as a Possible Animal Model of Mood Disorder

    • Author(s)
      Tadafumi Kato
    • Journal Title

      Neuroscience Research (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comprehensive gene expression analysis in bipolar disorder

    • Author(s)
      Tadafumi Kato
    • Journal Title

      Canadian Journal of Psychiatry (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gene expression profiling of major depression and suicide in the prefrontal cortex of postmortem brains.

    • Author(s)
      Mamoru Tochigi
    • Journal Title

      Neuroscience Research (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Methylation status of the reelin promoter region in the brain of schizophrenic patients.

    • Author(s)
      Mamoru Tochigi
    • Journal Title

      Biological Psychiatry (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Methylation status of the reelin promoter region in the brain of schizophrenic patients.

    • Author(s)
      Kazuya Iwamoto
    • Journal Title

      Psychiatry and Clinical Neurosciences (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Toward the genome analysis in single neurons: whole genome amplication from single cells and its application to the SNP array analysis2007

    • Author(s)
      岩本 和也
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大学
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071200
  • [Presentation] Whole genome amplification from human postmortem single neuronal nuclei and its application to the SNP array analysis2007

    • Author(s)
      Kazuya Iwamoto
    • Organizer
      The 15th World Congress of Psychiatric Genetics
    • Place of Presentation
      New York, USA
    • Year and Date
      20071000
  • [Presentation] Genome analysis of the single neurons in human brain using SNP arrays2007

    • Author(s)
      Kazuya Iwamoto
    • Organizer
      Joint Cold Spring Harbor Laboratory/Wellcome Trust Conference, Integrative Approaches to Brain Complexity
    • Place of Presentation
      Hinxton, UK
    • Year and Date
      20070900
  • [Presentation] 精神疾患患者由来死後脳および培養リンパ芽球におけるDNAメチル化状態の解析2007

    • Author(s)
      岩本 和也
    • Organizer
      第29回日本生物学的精神医学会・第37回日本神経精神薬理学会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      20070700

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Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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