2008 Fiscal Year Annual Research Report
日本産繊毛虫及び有殻アメーバ(原生生物)のインベントリーと遺伝子データベース構築
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18770060
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| Research Institution | Miyagi University of Education |
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Principal Investigator |
島野 智之 Miyagi University of Education, 附属環境教育実践研究センター, 准教授 (70355337)
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| Keywords | 原生生物 / インベントリー / 繊毛虫類 / 有殻アメーバ類 / 分子生物学的手法 |
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| Research Abstract |
1. 「日本産繊毛虫類・有殻アメーバ類生息種情報データベース」
日本から記録された全ての繊毛虫類と有殻アメーバ類の記録調査のために、海域、淡水域、土壌、生活環境、温泉など自由生活性の原生生物の調査記録の掲載されている可能性のある文献(図鑑、図説、学会誌、大学の紀要、生物調査報告書など)の収集を、予想される文献の85%〜90%程度まで完了した。また、繊毛虫類で重複を含めて、のべ4665種のデータ入力を終了し, 有殻アメーバ約350種の情報を補足した。日本原生動物学会誌にこれを公開しweb上に公開した。これは今後更新されていく。日本産有殻アメーバの目録も投稿準備中である。
2. single cell PCRを用いた野外株からの塩基配列解析系の確立
申請者の研究室で確立した、原生生物繊毛虫の1つの細胞からPCRを行う方法を学会誌に報告した。培養不可能な自由生活性原生動物における単一細胞由来のリボゾーム遺伝子配列をPCR増幅し、分子生物学的情報に基づいて系統関係および遺伝的距離などをEuplotes属についておこなったところ、これまでの知見とはことなり、Euplotes属では地理的変異の少ないことが考えられた。
3. 環境DNAからえられた遺伝情報
秋吉台の環境から環境中の微生物を含む原生生物の環境配列を得て、これを報告した。また、土壌より合計700塩基配列を得て、重複を除く100程度の環境配列を得た。
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