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2021 Fiscal Year Annual Research Report

初期生命におけるRNA・タンパク質共進化プロセスの再現

Research Project

Project/Area Number 18H01328
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

田上 俊輔  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (40586939)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2023-03-31
KeywordsRNAポリメラーゼ / ペプチド / RNA / 生命の起原
Outline of Annual Research Achievements

生命がどのように誕生したかは生物学に残された最も大きな謎の1つである.現存する生命の遺伝子発現機構は複数の分子種 (DNA,RNA,タンパク質) の共依存によって成り立っているが,そのような複雑な系が如何にして誕生・進化してきたのかは生命を理解する上で特に本質的な問いであると言える.これらの分子種の中ではRNAから進化が開始したという仮説 (RNAワールド仮説) が有力であり,その後,RNAとタンパク質の共進化により精巧な遺伝子発現機構に進化してきたと推測される.そこで本研究では,初期生命におけるRNAとタンパク質の共進化のプロセスを実験的に再現することを試みる.そのために, 人工的なRNA酵素 (リボザイム) の実験系をモデルに用い,RNA単独では克服できない課題を原始的なペプチド・タンパク質の添加により解決することで,「RNAワールドにおいて,なぜタンパク質が必要とされ,どのように進化が進行したか」を解明する.本研究では,正電荷をもったペプチドによるアミロイド形成を行い,そのような自己集合するペプチドのリボザイム活性への影響を調べている.その中で条件特異的にリボザイムの活性を上昇させるものを発見することができた.特にKKVVVVVVのような単純なペプチドでも,アミロイド形成・RNA濃縮・リボザイムの活性化という機能を示すことができたのは特筆すべき成果と言える.また,本研究ではタンパク質のRNAポリメラーゼの中心構造に保存されている太古のタンパク質構造を短いペプチドで再現する実験を行った.その結果わずか7種類のアミノ酸で,古代タンパク質を再現することに成功した.この7種類のアミノ酸は遺伝暗号上で固まった位置にコードされており,古代の遺伝暗号を再現するものであると推測された.

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (3 results)

All 2021 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Seven Amino Acid Types Suffice to Create the Core Fold of RNA Polymerase2021

    • Author(s)
      Sota Yagi, Aditya K. Padhi, Jelena Vucinic, Sophie Barbe, Thomas Schiex, Reiko Nakagawa, David Simoncini*, Kam Y. J. Zhang*, and Shunsuke Tagami*
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 143 Pages: 15998-16006

    • DOI

      10.1021/jacs.1c05367

    • Peer Reviewed
  • [Remarks] タンパク質の進化から生命誕生の謎に挑む

    • URL

      https://www.riken.jp/pr/closeup/2022/20220221_1/index.html

  • [Remarks] 生命誕生初期のタンパク質を再現する試み

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2021/20211202_2/index.html

URL: 

Published: 2022-12-28  

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