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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Diversity of acyl groups of phospholipids in bacterial cell membranes: Its generation mechanism and physiological significance

Research Project

Project/Area Number 18H02127
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

栗原 達夫  京都大学, 化学研究所, 教授 (70243087)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords生体膜 / リン脂質 / リゾホスファチジン酸アシル基転移酵素 / PlsC
Outline of Annual Research Achievements

リゾホスファチジン酸のsn-2位へのアシル基転位を触媒するリゾホスファチジン酸アシル基転移酵素(LPAAT)は、リン脂質アシル鎖の多様性創出において主要な役割を果たす。Escherichia coliでは、従来、1種類のLPAAT (PlsC)のみが見出されていた。一方、本研究代表者らは、低温菌Shewanella livingstonensis Ac10が5種のLPAATホモログ(PlsC1-5)を有し、PlsC4が分岐鎖脂肪酸のリン脂質への導入を担うことを示すとともに、E. coliの機能未知タンパク質YihGがPlsC4と39.1%の相同性を持つことを見出した。そこで、E. coliのYihGの機能解析を行った。まず、E. coliのPlsCの温度感受性変異株にYihG高発現プラスミドを導入し、非許容温度における生育を調べた。その結果、YihGの高発現で本株の生育不全が抑制されたことから、YihGがLPAAT活性を有すると考えられた。次に、YihG高発現株とPlsC高発現株のリン脂質sn-2位のアシル鎖組成を解析した。その結果、YihG高発現株ではミリスチン酸(14:0)とcis-バクセン酸(18:1Δ11)の相対量がPlsC高発現株と比較して有意に高かった。このことから、YihGは14:0と18:1Δ11に対する活性がPlsCよりも高いと考えられた。一方、E. coliのyihG欠損株のリン脂質sn-2位のアシル鎖組成を解析した結果、18:1Δ11の相対量が野生株と比較して有意に低かったことから、生理的条件下においてYihGは18:1Δ11をリン脂質に導入すると考えられた。さらに、運動性をもつ細胞の割合と遊泳速度がyihG欠損によって増加することが見出された。以上から、YihGによって調節される膜リン脂質組成がE. coliの運動機能に影響することが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

E. coliにおけるリン脂質アシル鎖多様性創出のメカニズムと生理的意義の解明については、新規リゾホスファチジン酸アシル基転移酵素であるYihGの同定と機能解析によって、計画以上の進展があった。一方、S. livingstonensis Ac10におけるリン脂質アシル鎖多様性創出に寄与するPlsC4とPlsC5については、それらの基質特異性についての知見は得られつつあるものの、生理的意義の解明には至っていないため、総合的には「おおむね順調に進展している」と評価することが妥当と考えられる。

Strategy for Future Research Activity

常温菌E. coliと低温菌S. livingstonensis Ac10に加えて、好熱菌Thermus thermophilus HB8を主な対象として、リン脂質アシル鎖多様性創出のメカニズムと生理的意義の解明を進める。E. coliについては、本研究で見出されたYihG欠損による運動性向上のメカニズムについて、特にべん毛構造の形成にリン脂質組成が及ぼす影響の解析を進める。S. livingstonensis Ac10については、機能的な重複の可能性が考えられるPlsC4とPlsC5について二重欠損株を作製し、その表現型を解析する。特に、異なる温度における生育特性や運動性、細胞外膜小胞の生産性に着目した解析を進める。T. thermophilus HB8については、PlsCの酵素学的な特性解明とともに、遺伝子破壊株の表現型解析を進める。

  • Research Products

    (11 results)

All 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Isolation of a novel bacterial strain capable of producing abundant extracellular membrane vesicles carrying a single major cargo protein and analysis of its transport mechanism2020

    • Author(s)
      Chen Chen、Jun Kawamoto、Soichiro Kawai、Akihiro Tame、Chiaki Kato、Tomoya Imai、Tatsuo Kurihara
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 10 Pages: 3001

    • DOI

      10.3389/fmicb.2019.03001

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genetic characterization and functional implications of the gene cluster for selective protein transport to extracellular membrane vesicles of Shewanella vesiculosa HM132020

    • Author(s)
      Kouhei Kamasaka、Jun Kawamoto、Chen Chen、Fumiaki Yokoyama、Tomoya Imai、Takuya Ogawa、Tatsuo Kurihara
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.03.125

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] In vitro and In vivo analysis of FadH protein from Shewanella livingstonensis Ac10 involved in DHA conversion2020

    • Author(s)
      Yustina Yusuf、廣瀬和樹、川本純、小川拓哉、栗原達夫
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
  • [Presentation] リゾホスファチジン酸アシル基転移酵素ホモログの比較解析2020

    • Author(s)
      久保嶋美咲、Nittikarn Suwanawat、川本純、小川拓哉、栗原達夫
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
  • [Presentation] 海洋性 Shewanella 属細菌による ω-3 系高度不飽和脂肪酸の変換経路の解明2019

    • Author(s)
      小川拓哉、廣瀬和樹、川本純、栗原達夫
    • Organizer
      第66回日本生化学会近畿支部例会
  • [Presentation] 細菌における長鎖多価不飽和脂肪酸結合型タンパク質の探索2019

    • Author(s)
      川本純、米田雄紀、小川拓哉、栗原達夫
    • Organizer
      第61回日本脂質生化学会
  • [Presentation] Shewanella 属細菌における新規エイコサペンタエン酸生産経路の解析2019

    • Author(s)
      小川拓哉、廣瀬和樹、川本純、栗原達夫
    • Organizer
      酵素・補酵素研究会2019
  • [Presentation] 細菌生体膜機能発現の分子基盤: 膜リン脂質・膜小胞研究の新展開2019

    • Author(s)
      栗原達夫
    • Organizer
      第33回ケミカルバイオロジー研究所セミナー/第105回生物科学フロンティアセミナー
    • Invited
  • [Presentation] Polyunsaturated fatty acid conversion in Shewanella livingstonensis Ac102019

    • Author(s)
      Yusina Yusuf、廣瀬和樹、小川拓哉、川本純、栗原達夫
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
  • [Presentation] Shewanella livingstonensis Ac10 の多価不飽和脂肪酸の変換における FadE の役割2019

    • Author(s)
      Yustina Yusuf、廣瀬和樹、小川拓哉、川本純、栗原達夫
    • Organizer
      第20回極限環境生物学会年会
  • [Presentation] 低温菌 Shewanella livingstonensis Ac10 におけるリゾホスファチジン酸アシル基転移酵素 PlsC5 の機能解析2019

    • Author(s)
      久保嶋美咲、小川拓哉、川本純、栗原達夫
    • Organizer
      第20回極限環境生物学会年会

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Published: 2021-01-27  

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