• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2018 Fiscal Year Annual Research Report

Importance of lanthanides in microorganisms

Research Project

Project/Area Number 18H02129
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

谷 明生  岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (00335621)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
KeywordsMethylotrophs / Methylobacterium / lanthanide
Outline of Annual Research Achievements

mxaF発現に xoxF が必要であることがわかっており、XoxF 欠失株からメタノールでの生育がXoxFに依存しない復帰変異株を解析した結果、mxaF 発現に必要とされる mxbD センサーキナーゼに共通変異があった。mxbD 欠失株は Ln 非存在下でメタノールに生育せず、 Ln 存在下で微弱に生育する。xoxFmxbD 二重欠失株に変異型 mxbD を導入すると Ln に関わらず生育が回復することから、表現型復帰の原因は mxbD にある 。この分子が Ln を直接・ 間接的に認識し、2種類のMDH の発現調節を行っていると考えられる。そこで、シグナル伝達下流にある mxbM 転写制御因子について抗体を作製しウエスタン解析を行った結果、MxbD欠失株ではリン酸化が起こらず、XoxF欠失株復帰変異体ではリン酸化されていることから、MxbMがMxbDによりリン酸化されてMxaF誘導を起こすことが示唆された。
一方、Lnにより発現誘導されるEF-handモチーフを持つタンパク質は先行研究に寄りLanmodulinと名付けられ、Lnとの結合が詳しく調べられた。本研究でも大腸菌で発現させたタンパク質を用いてランタノイドへの結合と構造変化が起こることを明らかにした。
これまで性質が明らかになっていなかったXoxFについてはHisタグタンパク質発現系をMethylobacterium属細菌で作製し、精製した。XoxFはメタノール、ホルムアルデヒドに対しても活性を持つこと、Lnを保持することを確認した。MxaFは発現量が低く、プロモーターの変更などを検討して、同じくMDHとしての性質を明らかにし、二つのMDHの違いを明らかにする。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究ではMethylobacterium属細菌のLn存在下でのふるまいを明らかにするために、トランスクリプトーム解析のデータを元に新規遺伝子・タンパク質に注目してその機能解析を行っている。機能の分からないタンパク質の解析は仮定を立てて証明するプロセスを踏む。想定している機能とは違う場合もあり、期待以上の成果とまでは言えないが、確実に追い詰めている状況である。

Strategy for Future Research Activity

本年度はMxbDMのさらに上流にあるMxcEQの二成分系についても同様の方法で解析する。ランタノイド結合タンパク質に関してはその細胞での機能がほぼ明らかになったので論文として発表する。MDHに関しては各種のホルムアルデヒド脱水素酵素系遺伝子の欠失株を作製しており、MDHがホルムアルデヒドの酸化にも関わっているかどうかを詰めていく予定である。

  • Research Products

    (19 results)

All 2018 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 5 results) Presentation (9 results)

  • [Int'l Joint Research] Skryabin Institute(ロシア連邦)

    • Country Name
      RUSSIA FEDERATION
    • Counterpart Institution
      Skryabin Institute
  • [Int'l Joint Research] Mugla Sitka Kocman University(トルコ)

    • Country Name
      TURKEY
    • Counterpart Institution
      Mugla Sitka Kocman University
  • [Int'l Joint Research] Swinburne University(マレーシア)

    • Country Name
      MALAYSIA
    • Counterpart Institution
      Swinburne University
  • [Int'l Joint Research] Burapha University(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      Burapha University
  • [Int'l Joint Research] Jomo Kenyatta University(ケニア)

    • Country Name
      KENYA
    • Counterpart Institution
      Jomo Kenyatta University
  • [Journal Article] Lanthanide-dependent regulation of methylotrophy in Methylobacterium aquaticum strain 22A.2018

    • Author(s)
      Masuda S, Suzuki Y, Fujitani Y, Mitsui R, Nakagawa T, Shintani M, Tani A
    • Journal Title

      mSphere

      Volume: 3 Pages: e00462-17

    • DOI

      DOI: 10.1128/mSphere.00462-17

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation and genomic characterization of Novimethylophilus kurashikiensis gen. nov. sp. nov., a new lanthanide-dependent methylotrophic species of Methylophilaceae.2018

    • Author(s)
      Lv H, Sahin N, Tani A
    • Journal Title

      Environ Microbiol

      Volume: 20 Pages: 1204-1223

    • DOI

      doi.org/10.1111/1462-2920.14062

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Distribution of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase and D-cysteine desulfhydrase genes among type species of the genus Methylobacterium2018

    • Author(s)
      Ekimova GA, Fedorov DN, Tani A, Doronina NV, Trotsenko YA.
    • Journal Title

      Antonie Van Leeuwenhoek.

      Volume: 111 Pages: 1723-1734

    • DOI

      doi: 10.1007/s10482-018-1061-5

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Ergothioneine production using Methylobacterium species, yeast, and fungi.2018

    • Author(s)
      Fujitani Y., Alamgir M.K. Tani A.
    • Journal Title

      J Biosci Bioeng

      Volume: 126 Pages: 715-722

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.jbiosc.2018.05.021

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic characterization of methylotrophy of Oharaeibacter diazotrophicus strain SM30T.2018

    • Author(s)
      Lv H, Tani A
    • Journal Title

      J Biosci Bioeng

      Volume: 126 Pages: 667-675

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.jbiosc.2018.05.023

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Multiple formaldehyde oxidation pathways in Methylobacterium aquaticum strain 22A2018

    • Author(s)
      Patcha Yanpirat and Akio Tani
    • Organizer
      日本微生物生態学会 第32回大会
  • [Presentation] Functional analysis of lanthanide inducible protein in Methylobacterium aquaticum 22A2018

    • Author(s)
      Yoshiko Fujitani and Akio Tani
    • Organizer
      日本微生物生態学会 第32回大会
  • [Presentation] Molecular mechanism of methylotaxis in Methylobacterium aquaticum strain 22A2018

    • Author(s)
      Yuuki Haruna, Junichi Kato, and Akio Tani
    • Organizer
      日本微生物生態学会 第32回大会
  • [Presentation] Methylobacterium extorquens AM1のランタノイド依存型メタノールデヒドロゲナーゼの解析2018

    • Author(s)
      吉川友理、北村純一、矢野嵩典、中川智行、谷 明生、三井亮司
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
  • [Presentation] ランタノイド依存型メタノール脱水素酵素XoxF1の酵素活性と安定性はランタノイド種に依存する2018

    • Author(s)
      王 倫,菅沼宗矢,日比野歩美,谷明生,三井亮司,海老原章郎, 岩本悟志,稲垣瑞穂,島田昌也,早川享志,中川智行
    • Organizer
      農芸化学会中部支部 支部例会
  • [Presentation] ホウレンソウにおける収穫後のMethylobacterium属細菌の挙動とその成育を制御する微生物の探索2018

    • Author(s)
      阪口由佳、繁原安美、王倫、谷明生,中野浩平、稲垣瑞穂、 島田昌也、早川享志、中川智行
    • Organizer
      美味技術学会 第18回大阪例会
  • [Presentation] Formaldehyde oxidation in lanthanide-dependent methylotrophy in Methylobacterium aquaticum strain 22A2018

    • Author(s)
      Patcha Yanpirat and Akio Tani
    • Organizer
      3rd International Conference on Biologically Active Substances Bioactive Okayama 2018
  • [Presentation] Functional analysis of lanthanide inducible proteins of Methylobacterium aquaticum 22A2018

    • Author(s)
      Yoshiko Fujitani and Akio Tani
    • Organizer
      3rd International Conference on Biologically Active Substances Bioactive Okayama 2018
  • [Presentation] Molecular mechanism of methylotaxis in Methylobacterium aquaticum strain 22A2018

    • Author(s)
      Yuuki Haruna and Akio Tani
    • Organizer
      3rd International Conference on Biologically Active Substances Bioactive Okayama 2018

URL: 

Published: 2019-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi