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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of roles of nuclear actin family in the maintenance of genome stability and operation of their functions using peptides

Research Project

Project/Area Number 18H02164
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

原田 昌彦  東北大学, 農学研究科, 教授 (70218642)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 太田 邦史  東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (90211789)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords核内アクチン / アクチンファミリー / クロマチン / ヒストンバリアント
Outline of Annual Research Achievements

進化的に保存されたヒストンバリアントH2A.Zは、クロマチンに導入あるいは排除されることで多くの遺伝子の転写制御に関わる。さらに,H2A.Z存在量の異常な増加は細胞がん化などを引き起こす。しかし,これまで、H2A.Z導入・排除のダイナミクスの制御機構は不明であったが、これまでの我々の研究により、細胞核内でのアクチンファミリーとヒストンファミリーの機能的な関連性が見出された。本研究では、アクチンファミリーがH2A.Zのゲノム上の存在部位をどのように決定し、またアクチンファミリーのリン酸化修飾によってH2A.Z導入・排除がどのように制御されるかを明らかにすることを目的とした。
まず、H2A.Zの導入に関与するSRCAP酵素と複合体を形成するArp6について、Arp6を破壊した脊椎動物細胞株を用い、抗H2A.Z抗体を用いたChIP法を行った。その結果、H2A.Zが減少するゲノム領域が観察された。また、Arp8を含むINO80複合体が、二つのH2A.Zアイソフォームのクロマチンからの排除に異なった役割を果たすことが示された。さらに、アクチンファミリーArp6, Arp8に特異的に結合する複数の二重環状ペプチド(bicyclic peptide)を細胞に導入し、H2A.Zの導入および排除の阻害と共に、がん細胞の増殖について観察を行った。現在までに、H2A.Z動態については明確な差が確認されていないが、がん細胞の増殖を抑制する効果が観察され、引き続き解析を行っている。また、アクチンファミリーのリン酸化を検出するための実験方法の検討を行っている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

Arp6ノックアウト細胞株の解析により、ヒストンバリアントH2A.Zのクロマチンからの排除におけるINO80複合体の機能について、新規な知見が得られている。また、生細胞にbicyclic peptideを導入して解析する実験手法が確立できている。

Strategy for Future Research Activity

H2A.Zの導入や排除の制御機構については、未だ不明な点が多く残されている。細胞核内でのアクチンファミリーとH2A.Zのクロストークが確認されていることに注目し、アクチンファミリーのノックアウト細胞、アクチンファミリーの翻訳後修飾との関連性、またアクチンファミリーに対するbicyclic peptidesの利用などにより、この機構を明らかにすることを目指す。

  • Research Products

    (28 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results) Presentation (21 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] Freadrich Miescher Institute(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      Freadrich Miescher Institute
  • [Int'l Joint Research] Institute of Molecular Genetics(チェコ)

    • Country Name
      CZECH
    • Counterpart Institution
      Institute of Molecular Genetics
  • [Int'l Joint Research] Friburg University(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      Friburg University
  • [Journal Article] Cancer-associated mutations of histones H2B, H3.1 and H2A.Z.1 affect the structure and stability of the nucleosome2018

    • Author(s)
      Arimura Yasuhiro、Ikura Masae、Fujita Risa、Noda Mamiko、Kobayashi Wataru、Horikoshi Naoki、Sun Jiying、Shi Lin、Kusakabe Masayuki、Harata Masahiko、Ohkawa Yasuyuki、Tashiro Satoshi、Kimura Hiroshi、Ikura Tsuyoshi、Kurumizaka Hitoshi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 46 Pages: 10007-10018

    • DOI

      10.1093/nar/gky661

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Actin polymerization is activated by terahertz irradiation2018

    • Author(s)
      Yamazaki Shota、Harata Masahiko、Idehara Toshitaka、Konagaya Keiji、Yokoyama Ginji、Hoshina Hiromichi、Ogawa Yuichi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: 9990

    • DOI

      10.1038/s41598-018-28245-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Distinct roles of ATM and ATR in the regulation of ARP8 phosphorylation to prevent chromosome translocations2018

    • Author(s)
      Sun Jiying、Shi Lin、Kinomura Aiko、Fukuto Atsuhiko、Horikoshi Yasunori、Oma Yukako、Harata Masahiko、Ikura Masae、Ikura Tsuyoshi、Kanaar Roland、Tashiro Satoshi
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 7 Pages: e32222

    • DOI

      10.7554/eLife.32222

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] SUMO modification system facilitates the exchange of histone variant H2A.Z-2 at DNA damage sites2018

    • Author(s)
      Fukuto Atsuhiko、Ikura Masae、Ikura Tsuyoshi、Sun Jiying、Horikoshi Yasunori、Shima Hiroki、Igarashi Kazuhiko、Kusakabe Masayuki、Harata Masahiko、Horikoshi Naoki、Kurumizaka Hitoshi、Kiuchi Yoshiaki、Tashiro Satoshi
    • Journal Title

      Nucleus

      Volume: 9 Pages: 87-94

    • DOI

      10.1080/19491034.2017.1395543

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 早老症モデル細胞における核内アクチン状態の解析2019

    • Author(s)
      髙橋祐人、 町田奈々子、 Tom Misteli、 Robert Grosse、 宮本圭、 原田昌彦
    • Organizer
      第36回 染色体ワークショップ・第17回 核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] ヒストンバリアントH2A.Z のクロマチン導入部位決定機構解析2019

    • Author(s)
      高橋大輔、北川紗帆、小田有沙、仮屋園遼、尾間由佳子、太田邦史、原田昌彦
    • Organizer
      第36回 染色体ワークショップ・第17回 核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] ヒストンバリアントH2A.Z機能構造の進化的保存性の解析2019

    • Author(s)
      北川紗帆、日下部将之、奥裕之、高橋大輔、成宮巧、中林悠、関政幸、原田昌彦
    • Organizer
      第36回 染色体ワークショップ・第17回 核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] 二重環状ペプチドを用いた INO80 クロマチンリモデリング複合体機能の人為制御2019

    • Author(s)
      原田 海、秋山祐亮、高橋裕一朗、町田奈々子、HEINIS Christian、原田昌彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] 脊椎動物ヒストンバリアント H2A.Z のアイソフォーム間での転写制御機構の差異の解析2019

    • Author(s)
      荻原 望、高橋大輔、日下部将之、原田昌彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] エピジェネティック制御における細胞核内F-アクチンの機能解析2018

    • Author(s)
      髙橋祐人、町田奈々子、山本浩志、山崎祥他、原田昌彦
    • Organizer
      日本生化学会東北支部 第84会例会
  • [Presentation] Contribution of nuclear pore complex to DNA damage-induced sister chromatid cohesion through promoting SUMOylation of cohesin2018

    • Author(s)
      Yukako Oma, Yuki Orihara, Daisuke Takahashi, Tatsunori Konishi, Masahiko Harata
    • Organizer
      The Joint Annual Meeting of 51st JSDB and 70th JSCB
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA損傷誘導的コヒージョンにおけるコヒーシンSUMO化と核膜孔複合体の関与2018

    • Author(s)
      尾間由佳子、折原行希、高橋大輔、小西辰紀、原田昌彦
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第51回研究報告会
  • [Presentation] DNA損傷修復における細胞核構造の役割:出芽酵母をモデル系とした解析2018

    • Author(s)
      尾間由佳子、折原行希、高橋大輔、小西辰紀、原田昌彦
    • Organizer
      農芸化学会 東北・北海道合同支部大会(東北支部第153回大会)
  • [Presentation] がん細胞で検出されるヒストンバリアントH2A.Z変異体の解析2018

    • Author(s)
      成宮 巧、日下部 将之、折原 行希、尾間 由佳子、原田 昌彦
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部第153回大会
  • [Presentation] ヒストンバリアントH2A.Zにおけるがん関連変異の遺伝子破壊細胞を用いた解析2018

    • Author(s)
      高橋 大輔, 日下部 将之, 折原 行希, 尾間 由佳子, 原田 昌彦
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 核内アクチンによるクロマチン構造制御機能の解明に向けたアクチン結合ペプチドの開発と評価2018

    • Author(s)
      町田 奈々子 、村上 寛和、秋山 祐亮、Christian Heinis、Bertoldo Davide、原田 昌彦
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 転写マシナリーへの核内アクチンの寄与:核移行性アクチン結合環状ペプチドによる解析2018

    • Author(s)
      平塚晶吾、町田奈々子、Christian Heinis、Bertoldo Davide、原田昌彦
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] クロマチン構造形成におけるH2A.Zの機能とその進化的保存性2018

    • Author(s)
      原田昌彦
    • Organizer
      第5回ヒストンバリアント研究会
    • Invited
  • [Presentation] 農学分野への応用が期待される革新的イメージング技術2018

    • Author(s)
      原田昌彦
    • Organizer
      多元物質科学研究所放射光産学連携準備室第1回ワークショップ
    • Invited
  • [Presentation] Cross-talk of histone and actin families affect chromosome dynamics in mitotic and interphase cells2018

    • Author(s)
      Masahiko Harata
    • Organizer
      22nd International Chromosome Conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Functional Interactions between actin, ARPs and chromatin2018

    • Author(s)
      Masahiko Harata
    • Organizer
      ASCB-EMBO 2018 Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Influence of epigenetic changes in trained immunity in common carp (Cyprinus Carpio)2018

    • Author(s)
      Ginji Yokoyama, Danilo Pietretti, Jules Petit, Daisuke Takahashi, Masahiko Harata, Geert F. Wiegertjes
    • Organizer
      19th Fish Immunology Workshop
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Functional analysis of nuclear actin: approach with bicyclic peptides binding to nuclear G-actin2018

    • Author(s)
      Yuto Takahashi, Nanako Machida, Christian Heinis, Masahiko Harata
    • Organizer
      22nd International Chromosome Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Involvement of histone variant H2A.Z in chromosomal segregation: analysis by genetic complementation system with H2A.Z knockout cells2018

    • Author(s)
      Takahashi D, Kusakabe M, Narimiya T, Kitagawa S, Oma Y, Harata M
    • Organizer
      22nd International Chromosome Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Contribution of actin family proteins to nuclear organization2018

    • Author(s)
      Masahiko Harata
    • Organizer
      2018 4D Nucleome-ASCB Satellite meeting
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-01-27  

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