• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2020 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of roles of nuclear actin family in the maintenance of genome stability and operation of their functions using peptides

Research Project

Project/Area Number 18H02164
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

原田 昌彦  東北大学, 農学研究科, 教授 (70218642)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 太田 邦史  東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (90211789)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywordsアクチンファミリー / ヒストン / 細胞核
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、細胞核内のアクチンファミリーがヒストンバリアントH2A.Zの導入や排除に関与する分子メカニズムに注目して解析を進めた。出芽酵母や脊椎動物に至るまで、進化的に保存されたH2A.Zは、クロマチンに導入、あるいは排除されることで様々な遺伝子の転写制御に関わることが示されている。H2A.Zの発現異常や変異が、細胞のがん化などを引き起こすことも知られている。本研究では、細胞核内のアクチンファミリーとH2A.Z機能との関連を明らかにするとともに、アクチンファミリーに特異的に結合する二重環状ペプチドを用いて、H2A.Z導入・排除を人為操作するための技術基盤構築にも取り組んだ。Arp6, Arp8などのアクチンファミリーを欠損した細胞株を用いて、ゲノム上のH2A.Zの局在を解析することによって、これらのアクチンファミリーがH2A.Zのダイナミクスに影響を与えることを示した。また、アクチンファミリーに特異的な二重環状ペプチドを、エレクトロポレーション法によって生細胞に導入した。導入した二重環状ペプチドの影響を、遺伝子発現の解析や、クロマチン免疫沈降法などによって解析した。その結果、これらの二重環状ペプチドが、H2A.Zの導入や排除を行う複合体の機能を抑制していることが示された。この結果は、アクチンファミリーに結合する二重環状ペプチドによって、H2A.Zダイナミクスを介した人為的な遺伝子機能解析を行うことができる可能性を示唆しており、今後の活用が期待される。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (42 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (11 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 11 results,  Open Access: 6 results) Presentation (31 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] The auxin-inducible degron 2 (AID2) system enables controlled protein knockdown during embryogenesis and development in Caenorhabditis elegans2022

    • Author(s)
      Negishi T, Kitagawa S, Horii N, Tanaka Y, Haruta N, Sugimoto A, Sawa H, Hayashi KI, Harata M, Kanemaki MT.
    • Journal Title

      Genetics

      Volume: 220 Pages: iyab218

    • DOI

      10.1093/genetics/iyab218

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Nucleoskeleton proteins for nuclear dynamics2021

    • Author(s)
      Miyamoto K, Harata M.
    • Journal Title

      J Biochem

      Volume: 169 Pages: 237-241

    • DOI

      10.1093/jb/mvab006

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] THz irradiation inhibits cell division by affecting actin dynamics2021

    • Author(s)
      Yamazaki S, Ueno Y, Hosoki R, Saito T, Idehara T, Yamaguchi Y, Otani C, Ogawa Y, Harata M, Hoshina H.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 16 Pages: e0248381

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0248381

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] In Vitro-Evolved Peptides Bind Monomeric Actin and Mimic Actin-Binding Protein Thymosin-beta42021

    • Author(s)
      Gubeli RJ, Bertoldo D, Shimada K, Gerhold CB, Hurst V, Takahashi Y, Harada K, Mothukuri GK, Wilbs J, Harata M, Gasser SM, Heinis C.
    • Journal Title

      ACS Chem Biol

      Volume: 16 Pages: 820-828.

    • DOI

      10.1021/acschembio.0c00825

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Modulating dynamics and function of nuclear actin with synthetic bicyclic peptides2021

    • Author(s)
      Machida N, Takahashi D, Ueno Y, Nakama Y, Gubeli RJ, Bertoldo D, Harata M.
    • Journal Title

      J Biochem

      Volume: 169 Pages: 295-302

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa130

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Analysis of the molecular evolution of histone variant H2A.Z using a linker-mediated complex strategy and yeast genetic complementation2021

    • Author(s)
      Kitagawa S, Kusakabe M, Takahashi D, Narimiya T, Nakabayashi Y, Seki M, Horigome C, Harata M.
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem

      Volume: 86 Pages: 104-108

    • DOI

      10.1093/bbb/zbab190

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An improved functional analysis of linker-mediated complex (iFALC) strategy2020

    • Author(s)
      Nakabayashi Y, Harata M, Seki M.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 526 Pages: 1164-1169

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.04.039

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Actin-Family Protein Arp4 Is a Novel Suppressor for the Formation and Functions of Nuclear F-Actin2020

    • Author(s)
      Yamazaki S, Gerhold C, Yamamoto K, Ueno Y, Grosse R, Miyamoto K, Harata M.
    • Journal Title

      Cells

      Volume: 9 Pages: 758

    • DOI

      10.3390/cells9030758

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Propagation of THz irradiation energy through aqueous layers: Demolition of actin filaments in living cells2020

    • Author(s)
      Yamazaki S, Harata M, Ueno Y, Tsubouchi M, Konagaya K, Ogawa Y, Isoyama G, Otani C, Hoshina H.
    • Journal Title

      Sci Rep

      Volume: 10 Pages: 9008

    • DOI

      10.1038/s41598-020-65955-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Impairment of nuclear F-actin formation and its relevance to cellular phenotypes in Hutchinson-Gilford progeria syndrome2020

    • Author(s)
      Takahashi Y, Hiratsuka S, Machida N, Takahashi D, Matsushita J, Hozak P, Misteli T, Miyamoto K, Harata M.
    • Journal Title

      Nucleus

      Volume: 11 Pages: 250-263

    • DOI

      10.1080/19491034.2020.1815395

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] SMARCA4 deficiency-associated heterochromatin induces intrinsic DNA replication stress and susceptibility to ATR inhibition in lung adenocarcinoma2020

    • Author(s)
      Kurashima K, Kashiwagi H, Shimomura I, Suzuki A, Takeshita F, Mazevet M, Harata M, Yamashita T, Yamamoto Y, Kohno T, Shiotani B.
    • Journal Title

      NAR Cancer

      Volume: 2 Pages: zcaa005

    • DOI

      10.1093/narcan/zcaa005

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 細胞内蛋白質に対するテラヘルツ光照射影響2022

    • Author(s)
      上野佑也、山崎祥他、大谷知行、原田昌彦、保科宏道
    • Organizer
      理研シンポジウム第 9 回「光量子工学研究」―エクストリームフォトニクスが拓く未来の光科学―
  • [Presentation] 核内アクチン繊維形成とゲノム機能制御におけるアクチンファミリーArp4の役割、The actin-family protein Arp4 suppresses formation of nuclear actin filament2021

    • Author(s)
      上野 佑也、山崎 祥他、GERHOLD Christian、山本 浩志、宮本 圭、原田 昌彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
  • [Presentation] DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着への核膜孔の関与 Relocation of DNA breaks to nuclear pores is involved in damage-induced sister chromatid cohesion2021

    • Author(s)
      折原行希,高橋大輔,小西辰紀,尾間由佳子,島田健士, Susan M. Gasser, 原田昌彦, 堀籠智洋
    • Organizer
      第38回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着への核膜孔の関与 Relocation of DNA breaks to nuclear pores is involved in damage-induced sister chromatid cohesion2021

    • Author(s)
      折原行希,高橋大輔,小西辰紀,尾間由佳子,島田健士, Susan M. Gasser, 原田昌彦, 堀籠智洋
    • Organizer
      日本農芸化学会 2021 年度(令和3 年度)[仙台]大会
  • [Presentation] 細胞内のアクチン繊維形成はTHz光照射によって促進される2021

    • Author(s)
      細木 亮輔,山崎祥他,上野裕也,保科宏道,小川雄一,原田昌彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大
  • [Presentation] 放射光が食と農の未来を拓く2021

    • Author(s)
      原田昌彦
    • Organizer
      東北大学多元物質科学研究所イノベーション・エクスチェンジ2020
    • Invited
  • [Presentation] 東北大学農学研究科の取り組みと農学分野における利用可能性2021

    • Author(s)
      原田昌彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会、シンポジウム「農芸化学領域における次世代放射光施設利活用ポテンシャルと将来展望」
    • Invited
  • [Presentation] DNA損傷依存的な姉妹染色分体間接着には核膜孔との結合が必要である2021

    • Author(s)
      折原行希、高橋大輔、小西辰紀、岡田大和、尾間由佳子、島田健士、Susan M. Gasser、 原田昌彦、堀籠智洋
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第54回研究報告会
  • [Presentation] Roles of the histone variant H2A.Z in post-embryonic development of C. elegans2021

    • Author(s)
      Saho Kitagawa, Natsumi Horii, Nami Haruta, Yukako Oma, Akane Konno, Masato Kanemaki, Sugimoto, and Masahiko Harata
    • Organizer
      23rd International C. elegans Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Functional analysis of histone variant H2A.Z in response to nickel exposure of Caenorhabditis elegans2021

    • Author(s)
      Natsumi Horii, Saho kitagawa, Mayu Aida, Masahiko Harata
    • Organizer
      線虫研究の未来を創る会 2021
  • [Presentation] 大腸菌培養におけるフッ素系不活性溶媒添加の影響解析2021

    • Author(s)
      細木亮輔、川田晃士、山重貴久、菊池正二郎、小川雄一、原田昌彦
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部第156回大会
  • [Presentation] 老化した出芽酵母における DNA 二本鎖切断の核膜結合に関する解析2021

    • Author(s)
      堀川和希、原田昌彦、堀籠智洋
    • Organizer
      酵母研究若手の会 第7回研究会
  • [Presentation] 老化した出芽酵母におけるDNA二本鎖切断の解析2021

    • Author(s)
      堀川和希、原田昌彦、堀籠智洋
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部 第156回大会
  • [Presentation] 核膜孔結合によるrDNA安定化機構の解明2021

    • Author(s)
      岡田大和、原田昌彦、堀籠智洋
    • Organizer
      第7回酵母研究若手の会
  • [Presentation] DNA損傷誘導性姉妹染色分体間接着には損傷部位と核膜孔との結合が必要である2021

    • Author(s)
      岡田大和、折原行希、高橋大輔、小西辰紀、尾間由佳子、島田健士、Susan M. Gasser、原田昌彦、堀籠智洋
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部 第156回大会
  • [Presentation] テラヘルツ光照射による細胞内アクチン繊維形成の制御技術の探索2021

    • Author(s)
      上野佑也、山崎祥他、小川雄一、保科宏道、原田昌彦
    • Organizer
      テラヘルツ科学の最先端VIII
  • [Presentation] テラヘルツ光照射による細胞内アクチンフィラメント操作の試み、Application of terahertz wave for manipulation of intracellular actin filaments2021

    • Author(s)
      上野 佑也、山崎 祥他、坪内 雅明、小川 雄一、保科 宏道、大谷 知行、原田 昌彦
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 早老症細胞における核内アクチン動態変化とその機構の解析2021

    • Author(s)
      高橋祐人、町田奈々子、松下純平、宮本圭、原田昌彦
    • Organizer
      第73回日本細胞生物学会大会
  • [Presentation] 高強度テラヘルツ光照射がDNA損傷修復反応に与える影響の解析2021

    • Author(s)
      細木亮輔、上野佑也、山崎祥他、保科宏導、小川雄一、原田昌彦
    • Organizer
      第44回回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 早老症細胞における核内アクチンとラミンAのクロストーク2021

    • Author(s)
      高橋祐人、名嘉真良広、町田奈々子、Tom Misteli、原田昌彦
    • Organizer
      第39回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] ゲノム機能制御および個体発生・分化におけるヒストンバリアントH2A.Zの機能解明2021

    • Author(s)
      北川紗帆、堀井菜摘、春田奈美、尾間由佳子、金野あかね、鐘巻将人、杉本亜砂子、原田昌彦
    • Organizer
      第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] DNA損傷依存的な姉妹染色体分体間接着には核膜孔との結合が必要である2021

    • Author(s)
      Yamato Okada, Yuki Orihara, Daisuke Takahashi, Tatsunori Konishi, Yukako Oma, Kenji Shimada, Susan M. Gasser, Masahiko Harata, Chihiro Horigome
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 老化した出芽酵母におけるDNA二本鎖切断の核膜結合に関する解析2021

    • Author(s)
      堀川和希、原田昌彦、堀籠智洋
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ヒストンバリアントH2A.Z導入機構と機能の進化的保存性解析2020

    • Author(s)
      北川紗帆、高橋大輔、日下部将之、尾間由佳子、奥裕之、成宮巧、中林悠、関政幸、原田昌彦
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第 53 回研究報告会
  • [Presentation] THz wave irradiation activates polymerization of protein inside cells、THz光照射による細胞内タンパク質の重合反応促進2020

    • Author(s)
      上野佑也、山崎祥他、細木亮輔、小川雄一、保科弘道、大谷知行、原田昌彦
    • Organizer
      東北大学&理化学研究所 連携シンポジウム
  • [Presentation] アクチンファミリータンパク質Arp4は核内アクチン繊維の形成と機能を制御する、The actin-family protein Arp4 regulates the formation and functions of nuclear actin filament2020

    • Author(s)
      上野佑也 、山崎祥他 、Christian Gerhold 、山本浩志 、宮本圭 、原田昌彦
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Evolutionary conservativeness of the histone variant H2A.Z in its deposition and functions2020

    • Author(s)
      北川紗帆 、日下部将之 、奥裕之 、高橋大輔 、成宮巧 、中林悠、関政幸、原田昌彦
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 早老症細胞における核内アクチン繊維の形成異常と早老症病態との関連性 Nuclear F-actin formation and the etiology of Hutchinson-Gilford progeria syndrome2020

    • Author(s)
      高橋祐人、平塚晶吾、町田奈々子、Pavel Hozak、Tom Misteli、宮本圭、原田昌彦
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ヒストンバリアントH2A.Zのゲノム導入部位決定機構解析2020

    • Author(s)
      高橋大輔、北川紗帆、小田有沙、仮屋園遼、尾間由佳子、太田邦史、原田昌彦
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] H2A.Zヒストンバリアントアイソフォーム間における酸化ストレス応答遺伝子EGR1転写制御機構の差異の解析2020

    • Author(s)
      荻原望、高橋大輔、堀哲也、深川竜郎、原田昌彦
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] テラヘルツ光照射による細胞内アクチン重合化の促進2020

    • Author(s)
      細木亮輔、山崎祥他、上野佑也、保科宏道、小川雄一、原田昌彦
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi