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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Improvement of the AID technology through chemical biology approaches

Research Project

Project/Area Number 18H02170
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

鐘巻 将人  国立遺伝学研究所, 遺伝メカニズム研究系, 教授 (20444507)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 林 謙一郎  岡山理科大学, 理学部, 教授 (30289136)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords発現制御 / タンパク質分解 / デグロン
Outline of Annual Research Achievements

オーキシンデグロン(AID)技術は、植物由来のユビキチンリガーゼOsTIR1を異種細胞に導入することにより、植物AUX/IAA由来デグロンを付加したタンパク質を、オーキシン添加により分解除去することを可能にした。現在のAID技術の問題は、デグロン付加したタンパク質がオーキシン非添加時にも弱い分解を受けること、および使用するオーキシンの濃度が比較的高い(100-500 uM)ことであった。去年度においてオーキシン非添加時における分解抑制のためにOsTIR1阻害剤auxinoleを開発した。本研究成果は、今年度論文公表をおこなった(Yesbolatova et al. Methods, 2019)。

今年度は上記問題を克服するために、AID技術を改良しAID2を作成することに成功した。AID2においては、変異型OsTIR11と新たなリガンド5-Ph-IAAを利用する。利点としては下記があげられる。
1. オーキシン非依存的分解の大幅な抑制 2. より早い分解速度 3. 従来に比べ1/670程度のリガンドで作用

また、AID2技術は酵母やヒト細胞のみならず、マウス個体で利用することができることを見出した。現在まで得られた結果は、AID2技術が従来の問題点を克服したのみならず、様々な生物種においてプロテインノックダウンを可能にすることを強く示唆している。現在、これら研究成果を論文にまとめて投稿中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

AID2技術の開発に成功し、これまでAID技術では発現制御することができなかった、マウス個体におけるタンパク質発現制御も可能になりつつあるため。

Strategy for Future Research Activity

今後はマウス個体におけるタンパク質発現制御の開発を進める。現在の方法では、脳関門の影響により、リガンド5-Ph-IAAの通過性があまり良くない。ケミカルバイオロジー的改良で、通過性の高い化合物を見出す。また、変異型OsTIR1に結合する阻害剤の開発も可能である。すでに候補化合物を複数合成したので、今後は細胞およびマウス個体における阻害効果を調べる予定である。

  • Research Products

    (16 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 4 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 5 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Stony Brook University/Baylor College of Medicine(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Stony Brook University/Baylor College of Medicine
  • [Int'l Joint Research] University of Aberdeen/University college of London(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Aberdeen/University college of London
  • [Journal Article] UBC13-Mediated Ubiquitin Signaling Promotes Removal of Blocking Adducts from DNA Double-Strand Breaks2020

    • Author(s)
      Akagawa Remi、Trinh Hai Thanh、Saha Liton Kumar、Tsuda Masataka、Hirota Kouji、Yamada Shintaro、Shibata Atsushi、Kanemaki Masato T.、Nakada Shinichiro、Takeda Shunichi、Sasanuma Hiroyuki
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 23 Pages: 101027~101027

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.isci.2020.101027

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Generation of conditional auxin-inducible degron (AID) cells and tight control of degron-fused proteins using the degradation inhibitor auxinole2019

    • Author(s)
      Yesbolatova Aisha、Natsume Toyoaki、Hayashi Ken-ichiro、Kanemaki Masato T.
    • Journal Title

      Methods

      Volume: 164-165 Pages: 73~80

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2019.04.010

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Ligand-induced genetic degradation as a tool for target validation2019

    • Author(s)
      Yesbolatova Aisha、Tominari Yusuke、Kanemaki Masato T.
    • Journal Title

      Drug Discovery Today: Technologies

      Volume: 31 Pages: 91~98

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.ddtec.2018.11.001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] HsSAS-6-dependent cartwheel assembly ensures stabilization of centriole intermediates2019

    • Author(s)
      Yoshiba Satoko、Tsuchiya Yuki、Ohta Midori、Gupta Akshari、Shiratsuchi Gen、Nozaki Yuka、Ashikawa Tomoko、Fujiwara Takahiro、Natsume Toyoaki、Kanemaki Masato T.、Kitagawa Daiju
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 132 Pages: 217521~217521

    • DOI

      https://doi.org/10.1242/jcs.217521

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Auxin-mediated rapid degradation of target proteins in hippocampal neurons2019

    • Author(s)
      Nakano Risako、Ihara Naoki、Morikawa Shota、Nakashima Ai、Kanemaki Masato T.、Ikegaya Yuji、Takeuchi Haruki
    • Journal Title

      NeuroReport

      Volume: 30 Pages: 908~913

    • DOI

      https://doi.org/10.1097/WNR.0000000000001299

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Control of homologous recombination by the HROB-MCM8-MCM9 pathway2019

    • Author(s)
      Hustedt Nicole、Saito Yuichiro、Zimmermann Michal、Alvarez-Quilon Alejandro、Setiaputra Dheva、Adam Salom?、McEwan Andrea、Yuan Jing Yi、Olivieri Michele、Zhao Yichao、Kanemaki Masato T.、Jurisicova Andrea、Durocher Daniel
    • Journal Title

      Genes & Development

      Volume: 33 Pages: 1397~1415

    • DOI

      https://doi.org/10.1101/gad.329508.119

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] The Auxin-Inducible Degron (AID) system as a tool for target validation2019

    • Author(s)
      Masato Kanemaki
    • Organizer
      TPD Forum Japan
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] MCMBP is an MCM chaperon protecting the MCM subunits from degradation2019

    • Author(s)
      Masato Kanemaki
    • Organizer
      CSHL meeting on eukaryotic DNA replication and genome maintenance
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Auxin-inducible degron (AID) technology for rapid protein depletion in human cells2019

    • Author(s)
      Masato Kanemaki
    • Organizer
      日本遺伝学会 国際シンポジウム
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The Auxin-Inducible Degron (AID) system as a tool for target validation2019

    • Author(s)
      Masato Kanemaki
    • Organizer
      TPD summit in Boston
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] MCMBP is an MCM chaperon protecting the MCM subunits from degradation2019

    • Author(s)
      鐘巻将人
    • Organizer
      3Rワークショップ
  • [Presentation] オーキシンデグロン技術を標的タンパク質誘導分解薬開発に利用する2019

    • Author(s)
      鐘巻将人
    • Organizer
      日本分子生物学会 ワークショップ3AW-19
    • Invited
  • [Remarks] オーキシンデグロン(AID)法のためのCRISPR/Cas9を利用した新規タグ導入と分解阻害剤の開発

    • URL

      https://www.nig.ac.jp/nig/ja/2019/05/research-highlights_ja/rh20190510.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] オーキシンデグロンシステムのキット、およびその使用2019

    • Inventor(s)
      鐘巻将人、林謙一郎
    • Industrial Property Rights Holder
      大学共同利用機関法人情報・システム研究機構、学校法人加計学園
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2019-131464

URL: 

Published: 2021-01-27  

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