2020 Fiscal Year Annual Research Report
新規に開発した異種染色体置換部分解析ツールを用いたブラシカ作物の春化機構の解析
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18H02173
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
岡崎 桂一 新潟大学, 自然科学系, 教授 (20270936)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
深井 英吾 新潟大学, 自然科学系, 准教授 (00570657)
柿崎 智博 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 野菜花き研究部門, 上級研究員 (30547229)
藤本 龍 神戸大学, 農学研究科, 准教授 (60620375)
板橋 悦子 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 野菜花き研究部門, 主任研究員 (70783273)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 春化 / QTL / セイヨウナタネ / キャベツ / 遺伝子発現 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
セイヨウナタネの種子春化型イスズナタネと緑体春化型ルタバガ(WH) の交雑から育成したF2約136個体を、3-4葉ステージで春化処理 (4℃,6週間) し、処理後は植物体を温室で栽培し到花蕾日数を調査した。F2集団のうち, 早期開花個体と未開花（一部晩生個体）をそれぞれ25個体のバルクDNAを作成し、QTL-seqを実施した。その結果, C2， C6染色体上に5%有意水準に近いLODピークがみられたが, 有意ではなかった。LODピークが検出できたC6領域には, B. napusのFTオルソログ、C2領域の近傍にFLC2オルソログともう一つのFT1が座乗した。また、同様に、B. napusの別の交雑組み合わせ（種子春化型イスズナタネ×緑体春化型合成ナプス）のおいても、3-4葉ステージの植物体の春化要求性のQTL解析を行った。その結果、Cゲノム染色体の1箇所にQTLが検出された。両交雑組み合わせから同定されたQTL-seqの分析条件の再現性を確認中である。
セイヨウナタネと合成ナタネについて、播種後14日の葉、播種後14日後に8週間の低温処理した葉、8週間の低温処理後12日間通常温度に戻した葉を用いてRNA-seqを実施し、それぞれの3つの処理区で発現レベルが異なる遺伝子を同定し、AゲノムとCゲノムに存在する各FLCの遺伝子発現パターンを明らかにした。また、BoFLC2置換型ハクサイ（IL18）と戻し交雑親に用いた歓喜について、播種後14日後の葉、播種後14日後に4週間の低温処理した葉、4週間の低温処理後12日間通常温度に戻した葉を用いてRNA-seqを実施し、それぞれの3つの処理区で発現レベルが異なる遺伝子を同定した。
キャベツの低温要求性の決定にはBoFLC2に加えてBoFLC1が関与する可能性が新たに示唆され、その発現量および発現パターンの品種間差を明らかにした。
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| Research Progress Status |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Gene Expression Analysis in Response to Vernalization in Chinese Cabbage (Brassica rapa L.)2020
Author(s)
Ayasha Akter, Junji Miyazaki, Daniel J. Shea, Namiko Nishida, Satoko Takada, Naomi Miyaji, Hasan Mehraj, Motoki Shimizu, Md. Asad-ud Doullah, Takeshi Takasaki-Yasuda, Keiichi Okazaki, Ryo Fujimoto
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Journal Title
The Horticulture Journal
Volume: 89(3)
Pages: 268 - 277
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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