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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Analyses of epigenetic regulation of plant meiosis and intercellular communication between germ and somatic cells

Research Project

Project/Area Number 18H02181
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

野々村 賢一  国立遺伝学研究所, 遺伝形質研究系, 准教授 (10291890)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords減数分裂 / イネ / 植物 / 生殖 / small RNA / エピゲノム
Outline of Annual Research Achievements

Argonaute(AGO)タンパク質は、20から30塩基長のsmall RNAをガイド配列として取り込み、ガイドと相補的な配列をもつ標的RNAと結合し、遺伝子のサイレンシングやクロマチン修飾などを制御する。今年度は、生殖細胞特異的に発現するイネAGOタンパク質MEL1について、MEL1が標的とするRNA分子の特定を行った。具体的には、減数分裂期の葯で発現するMEL1とMEL1結合RNAを架橋した後、MEL1に対する特異的抗体を用いて免疫沈降シーケンスし、MEL1標的候補配列を解析・抽出した。その結果、9つのRNA配列が有力な候補として浮上した。候補9配列の1つは、減数分裂直後の花粉形成での機能が報告されている遺伝子の転写産物の一部と一致した。この結果は、減数分裂期あるいはそれ以前の葯において、当該遺伝子が花粉形成期以前に誤作動しないための、いわばセーフティーロックとしてMEL1が機能する可能性を示唆している。別の標的候補配列は、MEL1の減数分裂期エピゲノム修飾への関与を示唆する遺伝子転写産物と一致した。現在は、上記のような仮説を検証するための各種形質転換イネ作成を進めている。
MEL1とは異なるイネAGOタンパク質とGFPの融合タンパク質(AGO-GFP)を発現する形質転換イネの葯を観察したところ、AGO-GFPが減数分裂細胞核に高度に蓄積することを見出した。AGO-GFP特異的抗体を作成して減数分裂期葯を用いた免疫沈降シーケンスを行い、AGOガイドRNA配列を網羅的に解析した。その結果、AGOガイドRNAの70%以上は、減数分裂特異的に葯で発現することが知られるタイプのsmall RNAであることを明らかにした。現在、ago変異体を作成しており、減数分裂における表現型解析などを行う予定である。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2021 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] miR2118-dependent U-rich phasiRNA production in rice anther wall development2020

    • Author(s)
      Araki Saori、Le Ngoc Tu、Koizumi Koji、Villar-Briones Alejandro、Nonomura Ken-Ichi、Endo Masaki、Inoue Haruhiko、Saze Hidetoshi、Komiya Reina
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Pages: 3115

    • DOI

      10.1038/s41467-020-16637-3

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] イネ葯室へのカロース高蓄積は減数分裂開始時期の制御に必須である2021

    • Author(s)
      ソマシェカーハーシャ, 三村真生, 津田勝利, 野々村賢一
    • Organizer
      日本育種学会 第140回講演会
  • [Presentation] 正常な雄性減数分裂進行に必要なイネ葯室細胞間隙へのカロース多糖の高蓄積2021

    • Author(s)
      ソマシェカーハーシャ, 三村真生, 津田勝利, 野々村賢一
    • Organizer
      日本遺伝学会第93回大会
  • [Presentation] Understanding the importance of cell-cell communication for plant meiosis using rice (Oryza sativa) as model organism2021

    • Author(s)
      Harsha Somashekar, Manaki Mimura, Tsuda Katsutoshi, Ken-Ichi Nonomura
    • Organizer
      EMBO Workshop: Intercellular communication and plasmodesmata in plant development and disease (virtual)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Callose depletion during meiosis exhibits prominent meiotic defects in rice anthers2021

    • Author(s)
      Harsha Somashekar, Manaki Mimura, Ken-Ichi Nonomura
    • Organizer
      日本育種学会 第139回講演会オンライン
  • [Presentation] Callose accumulation at onset of meiosis is crucial for normal meiosis progression in Rice2020

    • Author(s)
      Harsha Somashekar,Manaki Mimura,Ken-Ichi Nonomura
    • Organizer
      日本育種学会第137回講演会
  • [Presentation] 殿崎 薫, 小野 明美, 永田 博基, 古海 弘康, 野々村賢一, 川勝 泰二, 佐藤 豊, Luca Comai, 木下 哲2020

    • Author(s)
      栽培イネと野生イネにおけるインプリントームの比較
    • Organizer
      日本育種学会第137回講演会
  • [Presentation] イネ染色体添加系統におけるゲノムの高次構造解析2020

    • Author(s)
      保坂 碧, 真弓彩夏, 鈴木 創, 笠原 雅弘, 野々村賢一, 安井 秀, 辻 寛之
    • Organizer
      日本育種学会第137回講演会
  • [Book] 改訂 遺伝単 遺伝学用語集2021

    • Author(s)
      野々村賢一(分担執筆)
    • Total Pages
      454
    • Publisher
      株式会社エヌ・ティー・エス

URL: 

Published: 2022-12-28  

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