2018 Fiscal Year Annual Research Report
Invasion process of apomictic plants: a case study of hybrid dandelions in Japan
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18H02224
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| Research Institution | Osaka City University |
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Principal Investigator |
伊東 明 大阪市立大学, 大学院理学研究科, 教授 (40274344)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
今村 彰生 北海道教育大学, 教育学部, 准教授 (00390708)
松山 周平 酪農学園大学, 農食環境学群, 准教授 (30570048)
名波 哲 大阪市立大学, 大学院理学研究科, 准教授 (70326247)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 侵略的外来植物 / 無融合生殖 / 雑種 / タンポポ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
日本における雑種タンポポの形成・拡大過程を推定するために以下の研究を行った。(1)西日本における雑種タンポポ分布の10年間の変動：「タンポポ調査西日本」における雑種解析の計画を立案し、実行委員会を組織して関係者と打ち合わせを行って準備を進め、2019年3月から市民参加型の調査を開始することが確定した。(2)ゲノムワイドな配列情報による雑種起源地推定方法の開発：GRAS-Di法を用いてゲノムワイドなDNA配列情報を取集して在来タンポポ、セイヨウタンポポ、雑種タンポポの遺伝的変異を解析した結果、セイヨウタンポポと在来タンポポが遺伝的に大きく異なること、また、在来タンポポの個体が遺伝的に異なる7つの地域集団に分けられることが明らかになった。この結果は、GRAS-Di法で雑種起源地の推定に利用可能なことを示唆するものである。今後、在来タンポポとセイヨウタンポポに特異的な配列を識別する解析方法を開発することで雑種タンポポの起源地が推定できる可能性がある。(3)北海道における雑種タンポポの分布状況：北海道東部からセイヨウタンポポに見える個体の果実を採取して雑種判定を実施した結果、北海道東部に雑種タンポポが分布している可能性が示唆された。また、旭川周辺で発見した北海道の二倍体在来タンポポ（オオタカネタンポポ）とセイヨウタンポポの雑種と思われる個体について、詳細な現地調査と遺伝子解析（葉緑体と核DNAの配列解析）を行った結果、これらの個体の一部が雑種である可能性が示唆された。(4)栽培実験による雑種の生態特性解析：大阪と北海道の雑種タンポポから栽培実験に用いる果実を採取し、栽培実験の準備を進めた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
ゲノムワイド遺伝情報を用いた雑種解析法の開発に用いる手法をRADseq法からGRAS-Di法に変更したため、当初2018年度に予定していた実験開始を2019年度に延期した。しかし、2019年度に実施したGRAS-Di法で期待された結果が得られたため、今後はこの方法を用いて新しい雑種解析を開発できると考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後も、当初の予定通り、(1)西日本における雑種タンポポ分布の10年間の変動、(2)雑種の形成地域と移動経路の推定、(3)北海道における雑種タンポポの分布状況の把握と雑種形成初期過程の推定、(4)栽培実験による雑種クローンの環境適応の検証、について研究を進める予定である。ただし、(2)の中で行う、ゲノムワイドな遺伝情報を用いた新しい雑種解析の開発では、当初考えていたRADseq法ではなくGRAS-Di法を用いる。
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