2020 Fiscal Year Annual Research Report
Microbial communities around roots of cypress trees grown under various ranges of acidic soils
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18H02237
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| Research Institution | Mie University |
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Principal Investigator |
松田 陽介 三重大学, 生物資源学研究科, 教授 (30324552)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
谷川 東子 名古屋大学, 生命農学研究科, 准教授 (10353765)
小長谷 啓介 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (90612739)
北上 雄大 三重大学, 生物資源学研究科, 助教 (40882684)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | スギ / 人工林 / 次世代シークエンス法 / DNA解析 / 細根 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
日本の森林面積の18%を占めるスギ人工林に関わる土壌微生物を明らかにするため，本年度は過去に採取した試料を用いてスギの細根に共生する菌，アーバスキュラー菌根菌，の群集構造を調べた．
実験に用いた試料は，中日本の5地域（大阪府，三重・兵庫・福井・石川県）7林分に由来するスギの細根である．各林分内に100×100 mプロットを設定し，表層から土壌ブロック（10×10×10 cm）を採取した．持ち帰った土壌からスギ根系を取り出し，細根からDNA抽出を行った．AM菌特異的プライマーを用いて，核リボソームのSSU領域の部分領域を対象に，ION PGMを用いて次世代シークエンス（NGS）法を用いて塩基配列を決定した．NGSで得られた配列は，97％の相同性にもとづきクラスタリングを行い，分子操作的分類群（OTU）とした．それらの代表配列は，Blast解析により分類群（Virtual Taxa）の推定を行った．
その結果，AM菌と推定された226771配列は，各調査地から9－23 OTU，合計48 OTUに分けられた．いずれの調査地においても，Glomeraceae科の検出率が78.5－99.4％と優占した．非計量多次元尺度法による調査地間のAM菌群集には有意なまとまりは認められなかった．
以上より，スギ細根に関わるAM菌の群集構造には，調査した地域レベルの範囲では明瞭な変化がなく，Glomeraceae科が優占的にスギと共生関係を構築しているものと推察された．今後，本科のスギに対する働きを明らかにする必要がある．
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| Research Progress Status |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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