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2019 Fiscal Year Annual Research Report

新規化合物を用いて迫る概日時計タンパク質CRY1とCRY2の特異性の分子基盤

Research Project

Project/Area Number 18H02402
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

廣田 毅  名古屋大学, トランスフォーマティブ生命分子研究所, 特任准教授 (50372412)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords概日時計 / ケミカルバイオロジー / 化合物 / CRYタンパク質 / 選択性
Outline of Annual Research Achievements

睡眠・覚醒や代謝など、多様な生理現象は体内に存在する概日時計に支配されて一日周期のリズムを示す。申請者はケミカルバイオロジーを応用し、概日時計の機能を調節する新規化合物を発見して鍵となる制御機構を明らかにしてきた。そのひとつである化合物KL001は、概日時計の発振に中心的な役割を果たす時計タンパク質CRYを標的とする。さらに、KL001誘導体の解析から非常に高い活性を持つKL044を見出した。KL001とKL044は共にCRY1とCRY2の両者に作用する。これに対し、全く異なる化学構造を持つ新たな周期延長化合物AとBを表現型スクリーニングから見出し、CRY1選択的に作用することを発見した。本研究ではこれらのユニークな化合物を用い、CRY1とCRY2の違いを生み出すメカニズムに迫る。本年度はまず、CRY2により強く作用する化合物として同定したCの特異性を、Cry1およびCry2ノックアウト細胞を用いてPer2レポーターの抑制活性ならびに周期延長活性を指標に解明した。さらにCRY2の発現・精製系を構築し、CRY2と化合物Cとの複合体の構造をX線結晶構造解析によって明らかにした。化合物Cの誘導体が概日リズムの周期に与える作用を細胞レベルで評価して構造活性相関を解析し、活性に必要な化合物の特徴を抽出して立体構造との対応を明らかにすると共に、結晶構造におけるタンパク質と化合物の相互作用様式が溶液中でも成り立つことを示した。さらに、CRY1とCRY2の間で違いのあるアミノ酸残基を入れ替えた変異体を作製し、化合物AとCに対する感受性の変化を解析することによって、選択性に必要な領域を見出した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

CRY2に選択性をもつ化合物として見出したCとCRY2との複合体の構造を決定し、順調に進展している。さらに、CRY1とCRY2の選択性に必要な領域を見出すことに成功した。

Strategy for Future Research Activity

化合物Bの解析を進め、化合物AならびにCと比較することにより、CRY1とCRY2の違いを生み出す分子基盤を解析する。

  • Research Products

    (15 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 5 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Southern California/University of California Santa Cruz/California Institute of Technology(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of Southern California/University of California Santa Cruz/California Institute of Technology
    • # of Other Institutions
      1
  • [Int'l Joint Research] University of Groningen(オランダ)

    • Country Name
      NETHERLANDS
    • Counterpart Institution
      University of Groningen
  • [Journal Article] Isoform-selective regulation of mammalian cryptochromes2020

    • Author(s)
      Miller Simon、Son You Lee、Aikawa Yoshiki、Makino Eri、Nagai Yoshiko、Srivastava Ashutosh、Oshima Tsuyoshi、Sugiyama Akiko、Hara Aya、Abe Kazuhiro、Hirata Kunio、Oishi Shinya、Hagihara Shinya、Sato Ayato、Tama Florence、Itami Kenichiro、Kay Steve A.、Hatori Megumi、Hirota Tsuyoshi
    • Journal Title

      Nature Chemical Biology

      Volume: 16 Pages: 676~685

    • DOI

      10.1038/s41589-020-0505-1

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Pharmacological Interventions to Circadian Clocks and Their Molecular Bases2020

    • Author(s)
      Miller Simon、Hirota Tsuyoshi
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology

      Volume: 432 Pages: 3498~3514

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2020.01.003

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Dynamics at the serine loop underlie differential affinity of cryptochromes for CLOCK:BMAL1 to control circadian timing2020

    • Author(s)
      Fribourgh Jennifer L、Srivastava Ashutosh、Sandate Colby R、Michael Alicia K、Hsu Peter L、Rakers Christin、Nguyen Leslee T、Torgrimson Megan R、Parico Gian Carlo G、Tripathi Sarvind、Zheng Ning、Lander Gabriel C、Hirota Tsuyoshi、Tama Florence、Partch Carrie L
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 9 Pages: e55275

    • DOI

      10.7554/eLife.55275

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Controlling the Circadian Clock with High Temporal Resolution through Photodosing2019

    • Author(s)
      Kolarski Dusan、Sugiyama Akiko、Breton Ghislain、Rakers Christin、Ono Daisuke、Schulte Albert、Tama Florence、Itami Kenichiro、Szymanski Wiktor、Hirota Tsuyoshi、Feringa Ben L.
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 141 Pages: 15784~15791

    • DOI

      10.1021/jacs.9b05445

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of pathways that regulate circadian rhythms using a larval zebrafish small molecule screen2019

    • Author(s)
      Mosser Eric A.、Chiu Cindy N.、Tamai T. Katherine、Hirota Tsuyoshi、Li Suna、Hui May、Wang Amy、Singh Chanpreet、Giovanni Andrew、Kay Steve A.、Prober David A.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: 12405

    • DOI

      10.1038/s41598-019-48914-7

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Chemical Synthesis of Atomically Tailored SUMO E2 Conjugating Enzymes for the Formation of Covalently Linked SUMO?E2?E3 Ligase Ternary Complexes2019

    • Author(s)
      Zhang Yinfeng、Hirota Tsuyoshi、Kuwata Keiko、Oishi Shunsuke、Gramani Subramanian G.、Bode Jeffrey W.
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 141 Pages: 14742~14751

    • DOI

      10.1021/jacs.9b06820

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Casein kinase 1 family regulates PRR5 and TOC1 in the Arabidopsis circadian clock2019

    • Author(s)
      Uehara TN、Mizutani Y、Kuwata K、Hirota T、Sato A、Mizoi J、Takao S、Matsuo H、Suzuki T、Ito S、Saito AN、Nishiwaki-Ohkawa T、Yamaguchi-Shinozaki K、Yoshimura T、Kay SA、Itami K、Kinoshita T、Yamaguchi J、Nakamichi N
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 116 Pages: 11528~11536

    • DOI

      10.1073/pnas.1903357116

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Small molecule modulators of the circadian clock function2020

    • Author(s)
      Tsuyoshi Hirota
    • Organizer
      日本薬理学会 第93回年会
    • Invited
  • [Presentation] 哺乳類CRYタンパク質のアイソフォーム選択的な制御2019

    • Author(s)
      廣田 毅
    • Organizer
      第2回構造生命科学研究会
  • [Presentation] 概日時計タンパク質を標的とする低分子化合物2019

    • Author(s)
      廣田 毅
    • Organizer
      2019年度BINDS公開シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Chemical and structural biology approach for circadian biochemistry of clock proteins2019

    • Author(s)
      Tsuyoshi Hirota
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] Small molecule modulators of mammalian clock proteins2019

    • Author(s)
      Tsuyoshi Hirota
    • Organizer
      2019 CIBR Beijing Conference on Brain & Behavior
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 名古屋大学トランスフォーマティブ生命分子研究所Kay-廣田グループ

    • URL

      http://www.itbm.nagoya-u.ac.jp/ja/kay-hirota_group/

URL: 

Published: 2021-01-27  

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