2022 Fiscal Year Annual Research Report
マダガスカルでの遺伝子水平伝播パンデミックとヘビによる世界的な伝播因子拡散の実証
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18H02497
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| Research Institution | Nagahama Institute of Bio-Science and Technology |
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Principal Investigator |
倉林 敦 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 准教授 (00327701)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
太田 英利 兵庫県立大学, 自然・環境科学研究所, 教授 (10201972)
田辺 秀之 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 准教授 (50261178)
森 哲 京都大学, 理学研究科, 教授 (80271005)
米澤 隆弘 東京農業大学, 農学部, 准教授 (90508566)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 遺伝子水平伝播 / ブラーミニメクラヘビ / 全ゲノム解析 / Indotyphlops属 / Psammophis condortus / BovB |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、ヘビからカエルに水平伝播したLINEレトロトランスポゾンBovBについて、（1）水平伝播時期と地域の解明、（2）水平伝播遺伝子の視覚化、（3）爬虫類・両生類以外のマダガスカル産脊椎動物にもBovBの水平伝播が生じているかの解明、（4）水平伝播を媒介した寄生虫・ウィルスの探索、（5）南アジア原産のブラーミニメクラヘビが、マダガスカルのヘビタイプのBovBを持っている理由の解明、の5点を目的としている。
本年度は、主に（5）について研究を行った。まず、水平伝播によってBovB配列を持つようになったと思われるブラーミニメクラヘビのゲノムに転移が可能な完全なBovB配列が存在しているかを明らかにするために、本種の全ゲノム配列を決定した。その結果、ブラーミニメクラヘビには転移可能な完全なBovB配列が存在することが確認された。また、本種の全ゲノム情報をScientific Data (IF=8.6)において公表した。
さらに、スリランカとバングラデシュ産のIndotyphlops類の標本（26と35標本）の輸出許可を得ることに成功した。これらのサンプルについて分子系統解析を行い、9種の未記載種が含まれている可能性を示した。また、これらのメクラヘビ類からはBovBの増幅が見られた。さらに、ブラーミニメクラヘビのBovBの起源と思われるアレチヘビ類の中でも例外的にアジアに産する Psammophis condortus の入手にも成功し、本種からもBovBの増幅を確認した。
今後、Indotyphlops類とPsammophisのBovBとブラーミニメクラヘビのBovBの関係が明らかにすることで、ブラーミニメクラヘビへのBovBの水平伝播がアフリカで生じたのか、アジア起源なのかが明らかにできる。
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| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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