2019 Fiscal Year Annual Research Report
限定的発現遺伝子群espが担う新たな細菌特性の解明
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18H02652
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| Research Institution | University of Tsukuba |
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Principal Investigator |
森川 一也 筑波大学, 医学医療系, 教授 (90361328)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
尾花 望 筑波大学, 医学医療系, 助教 (00722688)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 限定的発現 / 黄色ブドウ球菌 / esp |
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| Outline of Annual Research Achievements |
黄色ブドウ球菌の限定的発現遺伝子esp (expression in minor subpopulation)は数パーセント以下の細胞で限定的に発現するものである。esp16が遺伝子水平伝達を、esp17が乾燥耐性に関与することを明らかにしてきたが、その他多くのesp遺伝子の役割は不明である。本研究は、espが生む細胞集団の多様性に基づいた新たな特性を明らかにすることを目標にしている。まずesp発現細胞での遺伝子発現プロフィールを明らかにする計画であるが、本年度はセルソーターによる回収に適したレポーター系の作成を中心にを進めたが、ベクター系の問題を解決すべく、現在も改良を続けている。幾つかのesp遺伝子については欠損株を作成し、M9培地での増殖などの一般的な表現型に変化はみられなかった。すなわち、これらは通常の培養条件での増殖には必須でない遺伝子であることが明らかとなった。
黄色ブドウ球菌の病原性制御因子Agrに関して、可逆的なフェーズバリアントが存在すること、Agr-ネガティブ集団の中のリバータントはAgr活性はOFFのままであるが、ファゴソームに取り込まれるとAgrをONにすることなどを確認していたが、これらについて投稿中の論文改訂を完了し、報告を完了した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
セルソーターに適したレポーター系の作成に問題があり、当初予定通りにすすんでおらず、全般的にやや遅れている。一方、本菌の病原性のマスターレギュレータであるAgr系が、ある局面では限定的発現遺伝子として機能することがあるという発見を論文報告できたことは計画外の成果であった。
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| Strategy for Future Research Activity |
本研究で、各esp遺伝子のGFPレポータ株を作成し、GFP陽性細胞をセルソーターで回収し、RNA-seqにより「同時に発現する遺伝子セット」を解明することを計画している。これまでGFP陽性細胞の分離とそこからのRNA精製の条件検討に時間を要してきたが、特にレポータ系の改良を早急に完成させ、「espと同時に発現する遺伝子セット」を同定する。これらの機能予測により未知特性を予想し作業仮説とする。
研究計画自体に変更はない。
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