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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of somatic mutations in brains of patients with psychiatric disorders

Research Project

Project/Area Number 18H02753
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

岩本 和也  熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 教授 (40342753)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywords体細胞変異 / 統合失調症 / エクソーム
Outline of Annual Research Achievements

本計画では、脳ゲノムDNAの高深度ゲノム配列解析データからの体細胞変異同定技術の確立を主眼としている。本年度は、昨年度取得を行い、QC、フィルタリング操作を行った死後脳高深度エクソームデータ(統合失調症患者前頭葉について、神経細胞・非神経細胞各N=5、合計10検体)を用い、1)トランスポゾンLINE-1の新規挿入箇所の確立、および2)体細胞変異(SNV)の検出パイプラインの確立を行った。また、3)高深度エクソーム解析の追加解析を行った。
1)については、申請者らが新たに確立したパイプラインであり、1高深度エクソームデータあたり、非神経細胞エクソームで平均6ヶ所、神経細胞エクソームで平均3カ所の新規転移候補の検出に成功した。本技術の応用としてマウスモデルやマカクモデルでも同様の検出が可能であると期待され、次年度以降で応用可能性の検証を行う。2)については、既存の変異コールソフトの設定を変更することで、体細胞SNVの候補を抽出した。1高深度エクソームあたり、約5カ所の候補を同定し、頻度について神経細胞・非神経細胞での差異は認めなかった。3)高深度エクソーム解析の追加は、健常者、統合失調症患者それぞれN=10、N=5を追加し、おのおの神経細胞・非神経細胞でのライブラリー調整を行った(合計30検体)。エクソームデータについては現在取得中である。
本研究計画は、熊本大学における必要なヒトゲノム解析をよび倫理承認を受けて遂行した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

解析パイプラインの確立が順調に進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

解析パイプラインの確立について、マウスやマカクなど動物モデルでの応用可能性が広がったため、次年度以降検討を行う。

  • Research Products

    (10 results)

All 2020 2019

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Global DNA hypomethylation and its correlation to the betaine level in peripheral blood of patients with schizophrenia2020

    • Author(s)
      Murata Yui、Ikegame Tempei、Koike Shinsuke、Saito Takeo、Ikeda Masashi、Sasaki Tsukasa、Iwata Nakao、Kasai Kiyoto、Bundo Miki、Iwamoto Kazuya
    • Journal Title

      Progress in Neuro-Psychopharmacology and Biological Psychiatry

      Volume: 99 Pages: 109855~109855

    • DOI

      10.1016/j.pnpbp.2019.109855

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 精神疾患とepigenetic age2020

    • Author(s)
      渡邊理紗、岩本和也
    • Journal Title

      医学のあゆみ

      Volume: 272 Pages: 57-60

  • [Journal Article] 精神疾患とエピジェネティクス―セロトニントランスポーターの大規模DNAメチル化解析からの考察2020

    • Author(s)
      岩本和也、池亀天平、文東美紀
    • Journal Title

      医学の歩み

      Volume: 272 Pages: 1212-1215

  • [Journal Article] Altered expression of microRNA-223 in the plasma of patients with first-episode schizophrenia and its possible relation to neuronal migration-related genes2019

    • Author(s)
      Zhao Zhilei et al.
    • Journal Title

      Translational Psychiatry

      Volume: 9 Pages: 289

    • DOI

      10.1038/s41398-019-0609-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Excess hydrogen sulfide and polysulfides production underlies a schizophrenia pathophysiology2019

    • Author(s)
      Ide Masayuki et al.
    • Journal Title

      EMBO Molecular Medicine

      Volume: 11 Pages: e10695

    • DOI

      10.15252/emmm.201910695

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Evaluation of the usefulness of saliva for DNA methylation analysis in cohort studies2019

    • Author(s)
      Murata Yui、Fujii Ayaka、Kanata Sho、Fujikawa Shinya、Ikegame Tempei、Nakachi Yutaka、Zhao Zhilei、Jinde Seiichiro、Kasai Kiyoto、Bundo Miki、Iwamoto Kazuya
    • Journal Title

      Neuropsychopharmacology Reports

      Volume: 39 Pages: 301~305

    • DOI

      10.1002/npr2.12075

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 体細胞変異と精神疾患2019

    • Author(s)
      岩本和也、文東美紀
    • Journal Title

      精神科

      Volume: 35 Pages: 1013-1015

  • [Journal Article] メチローム解析2019

    • Author(s)
      黒木遼太、文東美紀、岩本和也
    • Journal Title

      分子精神医学

      Volume: 19 Pages: 154-155

  • [Journal Article] 統合失調症と妊娠期ウイルス感染2019

    • Author(s)
      松原ひかり、村田唯、文東美紀、岩本和也
    • Journal Title

      精神科治療学

      Volume: 34 Pages: 1013-1015

  • [Presentation] Genetic and epigenetic variations of neuronal cells and their implications for psychiatric disorders.2019

    • Author(s)
      Iwamoto K, Bundo M, Kato T.
    • Organizer
      第41回日本神経科学会大会
    • Invited

URL: 

Published: 2021-01-27  

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