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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of somatic mutations in brains of patients with psychiatric disorders

Research Project

Project/Area Number 18H02753
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

岩本 和也  熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 教授 (40342753)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 川野 美智代  尚絅大学, 生活科学部, 准教授 (30738472)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywords体細胞変異 / 統合失調症 / エクソーム
Outline of Annual Research Achievements

本計画では、脳神経系のゲノムDNAの高深度ゲノム配列解析データからの体細胞変異同定技術の確立を行っている。最終年度である本年度は、これまでに追加で取得を行った、高深度エクソーム解析データ(統合失調症前頭葉神経細胞および非神経細胞について各N=10、健常者と合わせて合計20検体)について、確立したパイプラインの適用と解析を終了した。死後脳試料は米国スタンレー財団より提供を受けた試料を使用した。また、昨年度、先進ゲノム解析研究推進プラットフォームの支援を受け、統合失調症マウスモデル(母体免疫活性化モデルおよび対照群)の前頭葉試料および尻尾においても、高深度エクソーム解析データの取得を行い、マウス用に確立したパイプラインを適用し、解析を終了した。統合失調症患者死後脳試料における解析からは、統合失調症特異的、また、細胞種特異的なSNVを同定し、新規転移因子のゲノム挿入を検出した。統合失調症動物モデルにおいても、母体免疫活性化処理群における新規転移数の上昇と処理群特異的SNVの検出に成功した。これら一連の解析から、本計画で確立したバイオインフォマティクスパイプラインの有用性が認められた。今後、患者死後脳および動物モデル共に、多検体での解析を実施すると共に、特に細胞種ごとの詳細な解析が有用であると考えられた。本計画は、熊本大学において必要と定められたヒトゲノム解析および倫理承認を受けて遂行した。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Cell-type-specific DNA methylation analysis of the frontal cortices of mutant Polg1 transgenic mice with neuronal accumulation of deleted mitochondrial DNA2022

    • Author(s)
      Sugawara Hiroko、Bundo Miki、Kasahara Takaoki、Nakachi Yutaka、Ueda Junko、Kubota-Sakashita Mie、Iwamoto Kazuya、Kato Tadafumi
    • Journal Title

      Molecular Brain

      Volume: 15 Pages: 9

    • DOI

      10.1186/s13041-021-00894-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Comprehensive DNA Methylation Analysis of Human Neuroblastoma Cells Treated With Haloperidol and Risperidone2021

    • Author(s)
      Du Jianbin、Nakachi Yutaka、Kiyono Tomoki、Fujii Shinya、Kasai Kiyoto、Bundo Miki、Iwamoto Kazuya
    • Journal Title

      Frontiers in Molecular Neuroscience

      Volume: 14 Pages: 792874

    • DOI

      10.3389/fnmol.2021.792874

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cell type‐specific DNA methylation analysis of the prefrontal cortex of patients with schizophrenia2021

    • Author(s)
      Ueda Junko、Bundo Miki、Nakachi Yutaka、Kasai Kiyoto、Kato Tadafumi、Iwamoto Kazuya
    • Journal Title

      Psychiatry and Clinical Neurosciences

      Volume: 75 Pages: 297~299

    • DOI

      10.1111/PCN.13282

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Inter‐breeder differences in prepulse inhibition deficits of C57BL/6J mice in a maternal immune activation model2021

    • Author(s)
      Kobayashi Yutaro、Inaba Hiroyoshi、Iwakura Yuriko、Namba Hisaaki、Sotoyama Hidekazu、Murata Yui、Iwamoto Kazuya、Nawa Hiroyuki
    • Journal Title

      Neuropsychopharmacology Reports

      Volume: 41 Pages: 416~421

    • DOI

      10.1002/npr2.12178

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Decreased DNA methylation at promoters and gene-specific neuronal hypermethylation in the prefrontal cortex of patients with bipolar disorder2021

    • Author(s)
      Bundo Miki、Ueda Junko、Nakachi Yutaka、Kasai Kiyoto、Kato Tadafumi、Iwamoto Kazuya
    • Journal Title

      Molecular Psychiatry

      Volume: 26 Pages: 3407~3418

    • DOI

      10.1038/s41380-021-01079-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification and functional characterization of the extremely long allele of the serotonin transporter-linked polymorphic region2021

    • Author(s)
      Ikegame Tempei、Hidaka Yosuke、Nakachi Yutaka、Murata Yui、Watanabe Risa、Sugawara Hiroko、Asai Tatsuro、Kiyota Emi、Saito Takeo、Ikeda Masashi、Sasaki Tsukasa、Hashimoto Mamoru、Ishikawa Tomohisa、Takebayashi Minoru、Iwata Nakao、Kakiuchi Chihiro、Kato Tadafumi、Kasai Kiyoto、Bundo Miki、Iwamoto Kazuya
    • Journal Title

      Translational Psychiatry

      Volume: 11 Pages: 119

    • DOI

      10.1038/s41398-021-01242-9

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 脳神経系における体細胞変異と精神疾患2021

    • Author(s)
      岩本和也
    • Organizer
      第66回日本人類遺伝学会大会・第28回日本遺伝子診療学会大会合同開催シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 遺伝環境相互作用の観点からの脳ゲノム変異と精神疾患2021

    • Author(s)
      岩本和也
    • Organizer
      第43回生物学的精神医学会・第51回日本神経精神薬理学会合同年会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] LINE-1と精神神経疾患:転移の分子機構と新規解析技術の開発2021

    • Author(s)
      岩本和也
    • Organizer
      第43回生物学的精神医学会・第51回日本神経精神薬理学会合同年会NP 特別企画シンポジウム
    • Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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