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2018 Fiscal Year Annual Research Report

テンソルスパース表現による多時相CT画像の時空間特徴抽出と肝腫瘍性病変の診断支援

Research Project

Project/Area Number 18H03267
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

陳 延偉  立命館大学, 情報理工学部, 教授 (60236841)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岩本 祐太郎  立命館大学, 情報理工学部, 助教 (30779054)
韓 先花  山口大学, 大学院創成科学研究科, 准教授 (60469195)
古川 顕  首都大学東京, 人間健康科学研究科, 教授 (80199421)
金崎 周造  滋賀医科大学, 医学部, 非常勤講師 (90464180)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords肝腫瘍性病変 / テンソルスパース表現法 / 深層学習 / 肝臓のセグメンテーション / 診断支援 / 類似症例検索 / 鑑別と分類 / 時空間特徴
Outline of Annual Research Achievements

肝臓がんは、平均5年生存率が30%程度とがん全体の中でも極めて低く、正確な診断に基づく早期発見が求められる。肝臓がんの診断には、多時相CT画像(造影剤を急速注入してから経時的に複数回の撮像を行なって得られたCT画像)がよく用いられる。本研究では、肝腫瘍性病変の計算機支援診断法の確立を目的とし、多時相CT画像から有効な時空間特徴抽出のフレームワークを構築するとともに、肝腫瘍性病変の鑑別と診断の参考となる過去の類似肝腫瘍性病変症例を検索できるシステムを開発する。初年度の2018年度において、以下の研究成果が得られた。
(1)CT画像から高精度で肝臓領域をセグメンテーションする三つの手法(Random WalkとSuper Pixelを組み合わせた手法、深層学習(U-Net)とGANを組み合わせた手法、対話的深層学習法)を開発した。それぞれ国際学術誌CMIG(雑誌発表1), JOIG(雑誌発表2)と国際学会InMed2019(学会発表9, 10)で発表した。
(2)テンソルスパースコーディング法を開発し、多時相CTの時空間特徴を抽出し、肝腫瘍性病変の鑑別法を開発した。また、近年注目されている深層学習法(CNNとLSTMを組み合わせた手法)を用いた肝腫瘍性病変の鑑別法も開発した。それらの成果は、医用画像分野のトップ国際学会MICCAIなどで発表した(学会発表5, 6, 7)。
(3)診断の参考となる過去の類似肝腫瘍性病変症例を検索できるプロットタイプシステムを開発し、その有用性を検証した。その成果は国際学術誌JCARS(雑誌発表3)で掲載された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

(1) 前処理法としての肝臓領域分割について計画通りに実現ができた。また、近年注目されている深層学習法による肝臓領域の分割ほうも開発した。
(2) 当初計画していたテンソルスパース表現法による肝腫瘍性病変の鑑別法を開発しただけではなく、近年注目されている深層学習法による肝腫瘍性病変の鑑別法も開発した。もっとも高い鑑別(分類)精度を実現した。
(3) 国際学術誌に論文3編、国際学会での招待講演4件、一般講演(トップ国際学会MICCAIを含めむ)に論文9編を発表した。
(4)中国の浙江大学(中国のトップ3に入っている大学)と国際連携で研究を進めており、共同で研究成果を発表した。

Strategy for Future Research Activity

(1)現在腫瘍領域について、医師が手動でannotationしているが、今後は自動で腫瘍候補領域を検出し、腫瘍をセグメンテーション手法を開発する。
(2)多時相CTから高精度に時空間特徴を抽出する手法を開発し、鑑別精度を向上させる。
(3)肝臓と腫瘍の検出とセグメンテーション、肝腫瘍性病変の鑑別、類似症例検出する、診断支援システムを開発する。
(4)開発したシステムの有用性を検証する。

  • Research Products

    (18 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 13 results,  Invited: 4 results) Funded Workshop (1 results)

  • [Int'l Joint Research] 浙江大学/東北大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      浙江大学/東北大学
  • [Journal Article] Hybrid Method Combining Superpixel, Random Walk and Active Contour Model for Fast and Accurate Liver Segmentation2018

    • Author(s)
      Ye Yuan, Yen-Wei Chen, Chunhua Dong, Hai Yu and Zhiliang Zhu
    • Journal Title

      Computeried Medical Imaging and Graphics

      Volume: 70 Pages: 119-134

    • DOI

      10.1016/j.compmedimag.2018.08.012

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Automatic Liver Segmentation Using U-Net with Wasserstein GANs2018

    • Author(s)
      Yuki Enokiya, Yutaro Iwamoto, Yen-Wei Chen, and Xian-Hua Han
    • Journal Title

      Journal of Image and Graphics

      Volume: 6 Pages: 152-159

    • DOI

      10.18178/joig.6.2.152-159

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Texture-Specific Bag of Visual Words Model and Spatial Cone Matching-Based Method for the Retrieval of Focal Liver Lesions Using Multiphase Contrast-Enhanced CT Images2018

    • Author(s)
      Yingying Xu, Lanfen Lin, Hongjie Hu, Dan Wang, Wenchao Zhu, Jian Wang, Xian-Hua Han, Yen-Wei Chen
    • Journal Title

      International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery

      Volume: 13 Pages: 151-164

    • DOI

      10.1007/s11548-017-1671-9

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Computational Anatomy and Artificial Intelligence in Medical Imaging2018

    • Author(s)
      Yen-Wei Chen
    • Organizer
      Smart Digital Future 2018 (SDF2018)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Deep Learning for Medical Image Analysis2018

    • Author(s)
      Yen-Wei Chen
    • Organizer
      18th Asia Simulation Conference (AsiaSim2018)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Computational Anatomy and Artificial Intelligence in Medical Imaging2018

    • Author(s)
      Yen-Wei Chen
    • Organizer
      2018 International Conf. on Digital Medicine and Image Processing (DMIP2018)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Medical Image Analysis with Deep Learning2018

    • Author(s)
      Yen-Wei Chen
    • Organizer
      2018 3rd International Conference on Smart Computing and Informatics (SCI2018)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Combining Convolutional and Recurrent Neural Networks for Classification of Focal Liver Lesions in Multi-Phase CT Images2018

    • Author(s)
      Dong Liang, Lanfen Lin, Hongjie Hu, Qiaowei Zhang, Qingqing Chen, Yutaro Iwamoto, Xianhua Han, Yen-Wei Chen
    • Organizer
      21st International Conference On Medical Image Computing & Computer Assisted Intervention (MICCAI2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Focal Liver Lesion Classification Based on Tensor Sparse Representations of Multi-Phase CT Images2018

    • Author(s)
      Jian Wang, Xian-Hua Han, Jiande Sun, Lanfen Lin, Hongjie Hu, Yingying Xu, Qingqing Chen, and Yen-Wei Chen
    • Organizer
      Pacific-Rim Conference on Multimedia (PCM) 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Residual Convolutional Neural Networks with Global and Local Pathways for Classification of Focal Liver Lesions2018

    • Author(s)
      Dong Liang, Lanfen Lin, Hongjie Hu, Qiaowei Zhang, Qingqing Chen, Xianhua Han, Yen-Wei Chen
    • Organizer
      The 15th Pacific Rim International Conference on Artificial Intelligence (PRICAI-2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Classification of Focal Liver Lesions Using Deep Learning with Fine-tuning2018

    • Author(s)
      Weibin Wang, Yutaro Iwamoto, Xianhua Han, Yen-Wei Chen, Qingqing Chen, Dong Liang, Lanfen Lin, Hongjie Hu and Qiaowei Zhang
    • Organizer
      International Conference on Digital Medicine and Image Processing (DMIP2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Interactive Liver Segmentation in CT Volumes Using Fully Convolutional Networks2018

    • Author(s)
      Titinunt Kitrungrotsakul,Yutaro Iwamoto, Xian-Hua Han, Xiong Wei, Lanfen Lin, Hongjie Hu, Huiyan Jiang, Yen-Wei Chen
    • Organizer
      International Conference on Innovation in Medicine and Healthcare (InMed2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Abdominal Organs Segmentation based on Multi-path Fully Convolutional Network and Random Forests2018

    • Author(s)
      Yangzi Yang,Huiyan Jiang, Yen-Wei Chen
    • Organizer
      International Conference on Innovation in Medicine and Healthcare (InMed2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Classification of Pulmonary Emphysema in CT Images Based on Multi-scale Deep Convolutional Neural Networks2018

    • Author(s)
      Liying Peng, Lanfen Lin, Hongjie Hu, Huali Li, Xiaoli Ling, Dan Wang, Xianhua Han, Yen-Wei Chen
    • Organizer
      2018 IEEE International Conference on Image Processing (IEEE ICIP 2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Self-taught Learning with Residual Sparse Autoencoders for HEp-2 Cell Staining Pattern Recognition2018

    • Author(s)
      Xian-Hua Han, Jiande Sun, Lanfen Lin and Yen-Wei Chen
    • Organizer
      9th International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging (MLMI2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Detection of Liver Tumor Candidates in Multi-Phase CT Images Using Multi-Channel and Multi-Scale CNN2018

    • Author(s)
      Yoshihiro Todoroki, Yutaro Iwamoto1, Lanfen Lin, Hongjie Hu, and Yen-Wei Chen
    • Organizer
      The 14th Joint Workshop on Machine Perception and Robotics (MPR2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Funded Workshop] RU-DUT Joint Student Workshop on Advanced ICT2019

URL: 

Published: 2019-12-27  

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