• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2018 Fiscal Year Annual Research Report

New development in fluorescent immunosensor based on the quench-release principle by protein and peptide engineering

Research Project

Project/Area Number 18H03851
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

上田 宏  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (60232758)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大室 有紀 (松山有紀)  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 助教 (30571088)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywordsバイオセンサー / バイオテクノロジー / 抗体 / 抗原 / 蛍光 / クエンチ / ペプチド / ケミカルバイオロジー
Outline of Annual Research Achievements

1)コイルドコイルペプチドを用いたQ-body構築法の開発 従来,蛍光免疫センサーQ-bodyはそのN末に短いペプチドを介して色素を修飾することにより構築されてきたが,特異的定量的な色素修飾にまつわる問題が避けられなかった。今回,安定性の高いコイルドコイル構造を形成するE4-K4ペアを用いて,抗体H鎖(FabあるいはVHH鎖)N末にE4配列を付加し,末端をTAMRA修飾したK4ペプチドを混合することで,簡便かつ高い応答で抗原を蛍光検出できるQ-bodyを構築できることが判明した。
2)発光エネルギー移動(BRET)に基づくQ-bodyの構築 通常のQ-bodyよりも高い応答を示すBRET Q-bodyについて,抗原依存的なBRET効率向上がその主な原因であることを特定した。さらにその機構の解明を行い,抗原添加による色素の抗体外への移動に伴う,色素と酵素間の距離の減少が主な理由であることが判明した。
3)コイルドコイルペプチドを用いたFRET Q-body構築 従来,二種の異なる色素を二つのN末端に導入したUltra Q-bodyは高い応答を示すが構築が難しい問題があった。今回,上記のK4ペプチドの適当な位置にフルオレセインを導入することで,抗原依存的に二色の蛍光比,さらにはFRET効率が変化するFRET型Q-bodyを簡便に構築できることが判明した。これにより488 nmレーザーを用いたセルソータを選択に使えるようになり,今後のファージ・細胞提示系を用いた高性能Q-bodyスクリーニングへの道が開けた。
4)酵母提示系の立ち上げ 今後の酵母提示系による抗体選択のため,モデル系として単量体ストレプトアビジンの酵母細胞壁への機能的提示を試み,これに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

本年度の研究計画のうち,
(1) 単ドメイン抗体の利用 に関して,ライブラリ構築までには至らなかったが,低分子抗がん剤に対して高感度で高い蛍光応答を示すVHH型Q-bodyの構築に成功した。これ自身が大きな成果であるとともに,これを陽性コントロールとして,以下のライブラリ選択作業を効率的に進めることが可能になった。
(2) 細胞表面提示抗体ライブラリを用いた高効率Q-body選択 に関して,予定通り酵母菌体上で蛍光測定を行う系を構築できた。すなわち蛍光応答の高い抗体クローンにコイルドコイル形成タグを付加し,ペプチドを介した蛍光標識により,直接標識に匹敵する高い抗原応答が得られる系を構築できた。さらに,ペプチドを2色の蛍光色素で標識することで,セルソーターで高い応答で多色解析と選択が可能になるという計画以上の成果を得た。
(3) 発光酵素,他の色素との融合 について,抗原依存的な色素の移動に伴うBRET効率の上昇による,Q-body応答向上に成功した。さらに,発光色素の一部配列を融合した抗体が,抗原依存的な発光活性上昇を示す新規な知見を得た。また,2色標識コイルドコイル形成ペプチドを用いたQ-bodyについても,BRET系と同様に抗原依存的な色素の移動に伴うFRET効率の上昇が起きる事を発見した。これらについて,現在特許出願と学会発表を準備している。

Strategy for Future Research Activity

基本的に当初計画の通りに研究を進めるが,質の高いQ-bodyを効率的に得られる可能性が高まったため,血中や環境中の低分子ホルモンなど,より多様かつ実用的なターゲットを対象に選び選択を進める。

  • Research Products

    (33 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 2 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Int'l Joint Research] A*STAR(シンガポール)

    • Country Name
      SINGAPORE
    • Counterpart Institution
      A*STAR
  • [Int'l Joint Research] Weifang Medical University(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Weifang Medical University
  • [Int'l Joint Research] National Cancer Center/Eutilex Co./Hongik University(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      National Cancer Center/Eutilex Co./Hongik University
  • [Int'l Joint Research] Aarbourg University/Aarhus University(デンマーク)

    • Country Name
      DENMARK
    • Counterpart Institution
      Aarbourg University/Aarhus University
  • [Int'l Joint Research] Louisiana State University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Louisiana State University
  • [Journal Article] Development of a fluvoxamine detection system using a Quenchbody, a novel fluorescent biosensor2019

    • Author(s)
      Sasao Ako、Takaki Michiyo、Jeong Hee-Jin、Yonemitsu Kosei、Ohtsu Yuki、Tsutsumi Hiroshi、Furukawa Shota、Morioka Hiroshi、Ueda Hiroshi、Nishitani Yoko
    • Journal Title

      Drug Testing and Analysis

      Volume: 11 Pages: 601-609

    • DOI

      10.1002/dta.2520

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Green Fluorescent Protein-Based Glucose Indicators Report Glucose Dynamics in Living Cells2019

    • Author(s)
      Mita Marie、Ito Motoki、Harada Kazuki、Sugawara Izumi、Ueda Hiroshi、Tsuboi Takashi、Kitaguchi Tetsuya
    • Journal Title

      Analytical Chemistry

      Volume: 91 Pages: 4821~4830

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.9b00447

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Noncompetitive homogeneous immunodetection of small molecules based on beta-glucuronidase complementation2018

    • Author(s)
      Su Jiulong、Dong Jinhua、Kitaguchi Tetsuya、Ohmuro-Matsuyama Yuki、Ueda Hiroshi
    • Journal Title

      The Analyst

      Volume: 143 Pages: 2096~2101

    • DOI

      10.1039/C8AN00074C

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Rapid detection of the neonicotinoid insecticide imidacloprid using a quenchbody assay2018

    • Author(s)
      Zhao Shitao、Dong Jinhua、Jeong Hee-Jin、Okumura Koichi、Ueda Hiroshi
    • Journal Title

      Analytical and Bioanalytical Chemistry

      Volume: 410 Pages: 4219~4226

    • DOI

      10.1007/s00216-018-1074-y

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Construction of Quenchbodies to detect and image amyloid β oligomers2018

    • Author(s)
      Dong Jinhua、Fujita Richi、Zako Tamotsu、Ueda Hiroshi
    • Journal Title

      Analytical Biochemistry

      Volume: 550 Pages: 61~67

    • DOI

      10.1016/j.ab.2018.04.016

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Evaluation of protein-ligand interactions using the luminescent interaction assay FlimPIA with streptavidin-biotin linkage2018

    • Author(s)
      Ohmuro-Matsuyama Yuki、Yamashita Takahiro、Gomi Keiko、Yamaji Hideki、Ueda Hiroshi
    • Journal Title

      Analytical Biochemistry

      Volume: 563 Pages: 61~66

    • DOI

      10.1016/j.ab.2018.10.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-Step Detection of the Influenza Virus Hemagglutinin Using Bacterially-Produced Quenchbodies2018

    • Author(s)
      Jeong Hee-Jin、Dong Jinhua、Ueda Hiroshi
    • Journal Title

      Sensors

      Volume: 19 Pages: 52~52

    • DOI

      10.3390/s19010052

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A Novel Protein-Protein Interaction Assay Based on the Functional Complementation of Mutant Firefly Luciferases: Split Structure Versus Divided Reaction2018

    • Author(s)
      Ohmuro-Matsuyama Yuki、Ueda Hiroshi
    • Journal Title

      Protein-Protein Interaction Assays

      Volume: 1 Pages: 11-27

    • DOI

      10.5772/intechopen.75644

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Open Sandwich Immunoassay on Graphene Field Effect Transistors2019

    • Author(s)
      Hiroshi Ueda, Kazuhiko Matsumoto
    • Organizer
      Silver Jubilee Assembly of AdvancedMaterials Congress - 2019
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] グラフェンFETにおけるヒト血清中での オープンサンドイッチ免疫測定法による低分子ペプチドの検出2019

    • Author(s)
      金井 康, 大室 有紀, 谷奥 正巳, 牛場 翔太, 小野 尭生, 井上 恒一, 木村 雅彦, 上田 宏, 松本 和彦
    • Organizer
      第66回 応用物理学会学術講演会
  • [Presentation] Creation of simple artificial cell-based biosensor that detects tag-specific antibody2018

    • Author(s)
      Jiulong SU, Cyrus BEH, Tetsuya KITAGUCHI, Yuki OHMURO, Theresa SEAH, Shawn HOON, Hiroshi UEDA
    • Organizer
      酵素工学研究会第80回講演会
  • [Presentation] Creation of simple artificial cell-based biosensor that detects tag-specific antibody2018

    • Author(s)
      Jiulong SU, Cyrus BEH, Tetsuya KITAGUCHI, Yuki OHMURO, Theresa SEAH, Shawn HOON, Hiroshi UEDA
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
  • [Presentation] 蛍光ラベルを要しないクエンチ抗体構築法の開発2018

    • Author(s)
      泉谷篤史, 安田貴信, 大室有紀, 北口哲也, 上田宏
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
  • [Presentation] 高性能な蛍光バイオセンサー構築のための抗体結合プローブの開発2018

    • Author(s)
      上田 宏, 山田 映未, 井上 暁人, 大室 有紀, 北口 哲也
    • Organizer
      2018年度日本生物工学会大会
  • [Presentation] ラクダ科動物由来重鎖抗体を用いた蛍光免疫センサーmini Q-bodyの構築2018

    • Author(s)
      上田 宏, 山田 映未, 井上 暁人, 大室 有紀, 北口 哲也
    • Organizer
      2018年度日本生物工学会大会
  • [Presentation] 均相系測定を可能にする抗原応答性標識抗体の創製2018

    • Author(s)
      上田宏, 大室有紀, 北口哲也
    • Organizer
      日本分析化学会第67年会
  • [Presentation] 自ら光るクエンチ抗体BRET Q-bodyの発光特性2018

    • Author(s)
      高橋 里帆, 大室 有紀, 上田 宏
    • Organizer
      第12回バイオ関連化学シンポジウム
  • [Presentation] クエンチ抗体による環境中低分子の迅速高感度検出2018

    • Author(s)
      上田宏
    • Organizer
      日本進化学会第20回大会
    • Invited
  • [Presentation] Thermostabilization of mutant beta-glucuronidase resulted in increased stability and lower background signal of homogeneous immunoassay2018

    • Author(s)
      Jiulong Su, Yuki Omuro, Hiroshi Ueda
    • Organizer
      15th Japan-China-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Thermostabilization of mutant beta-glucuronidase resulted in increased stability and lower background signal of homogeneous immunoassay2018

    • Author(s)
      Jiulong Su, Yuki Omuro, Hiroshi Ueda
    • Organizer
      第18回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] Novel Protein-Protein Interaction Assay Based on the Functional Complementation of Mutant Firefly Luciferases: Split Structure Versus Divided Reaction2018

    • Author(s)
      Yuki Ohmuro, Hiroshi Ueda
    • Organizer
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Construction of luminescent immunosensors using luciferase-fused Quenchbody2018

    • Author(s)
      Riho Takahashi, Yuki Ohmuro, Hiroshi Ueda
    • Organizer
      20th International Symposium on Bioluminescence and Chemiluminsecence
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mutant firefly luciferase with enhanced oxidative luminescent activity improved the response of protein-protein interaction assay FlimPIA2018

    • Author(s)
      Yuki Ohmuro, Hiroshi Ueda
    • Organizer
      20th International Symposium on Bioluminescence and Chemiluminsecence
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Homogeneous noncompetitive immunological detection of small molecules by ternary luciferase fragment complementation (OS-BLIA)2018

    • Author(s)
      Hiroshi Ueda, Yuki Ohmuro
    • Organizer
      20th International Symposium on Bioluminescence and Chemiluminsecence
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 新規免疫測定法開発におけるBLIの活用例2018

    • Author(s)
      上田宏
    • Organizer
      日本ポール-ForteBio User Meeting 2018
    • Invited
  • [Remarks] 上田・北口研究室

    • URL

      http://www.ueda.res.titech.ac.jp

  • [Patent(Industrial Property Rights)] ホモジニアス免疫測定法に適した酵素変異体2019

    • Inventor(s)
      上田宏,蘇九龍,北口哲也,大室有紀
    • Industrial Property Rights Holder
      上田宏,蘇九龍,北口哲也,大室有紀
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      201921450
  • [Patent(Industrial Property Rights)] バイオセンサー2018

    • Inventor(s)
      上田宏, 蘇九龍, 北口哲也, 大室有紀, 他
    • Industrial Property Rights Holder
      東京工業大学,A*STAR
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2018207624

URL: 

Published: 2021-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi