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2019 Fiscal Year Annual Research Report

高次生命現象を制御する鋳型非依存的RNA合成酵素の構造と機能

Research Project

Project/Area Number 18H03980
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

富田 耕造  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (00345274)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
KeywordsRNA / 構造解析 / 機能解析 / 蛋白質
Outline of Annual Research Achievements

該当年度は、乳がんにおいて発現が上昇しており、予後不良との関連も示唆されているヒト由来細胞質tRNAHisの5'モノリン酸をメチル化する、tRNAキャッピング酵素(BCDIN3D)の構造決定に成功し、その構造が7SKの5’トリリン酸のγリン酸をメチル化する酵素(MePCE)と似ていることを見出し、構造比較、生化学解析からBCDIN3Dによる RNAメチル化の反応分子メカニズムを明らかにするとともに、基質tRNAの認識モデル提唱した。また、、ヒト由来U6 snRNA内のmRNA5’スプライスサイト認識に関わるアデノシンA43のメチル化酵素(METTL16)のC末領域に存在するVCRの構造に成功し、その構造がU6 snRNA特異的なウリジル化酵素に見られるKA1と相同性が高いことを見出し、生化学的解析を通してVCRとKA1は機能においてもU6交換可能であることを明らかにした。さらに、一連の生化学的解析よりこのVCRがU6 snRNAに結合することによって、U6 snRNAの構造変化が生じ、結果としてメチル化部位を含むRNA構造が活性型になりMETTL16のN末端側のメチル化反応ドメインがA43を効率よくメチル化できることを明らかにした。これ以外に、RNAをターゲットとする新規毒素の構造決定、またRNAとの複合体の構造決定などにも成功している。また、Lin28依存なlet7前駆体のオリゴウリジル化に関わるTUTのN末端側 (LIM)に接合し、Lin28-let7-TUT4の形成を阻害する環状ペプチドのスクリーニングを開始した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

該当年度は、学術論文としてヒト由来細胞質tRNAHis特異的なキャッピング酵素(BCDIN3D)の構造決定に成功し、その反応分子メカニズムを明らかにするとともに、基質tRNAの認識モデルを発表できた。また、、ヒト由来U6 snRNA内のmRNA5’スプライスサイト認識に関わるアデノシンのメチル化酵素(METTL16)のC末領域の構造に成功し、METTL16によるU6 snRNAのメチル化反応の分子メカニズムを明らかにした。さらに、他の酵素に関してはRNAとの複合体の結晶をえており、その構造決定に成功しているため。

Strategy for Future Research Activity

今後、さらに現在得られている結晶の構造解析を進めるとおともに、各種蛋白質とRNAの結晶化を進める。

  • Research Products

    (10 results)

All 2020 2019

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Substrate specificities of Escherichia coli ItaT that acetylates aminoacyl-tRNAs2020

    • Author(s)
      Zhang Chuqiao、Yashiro Yuka、Sakaguchi Yuriko、Suzuki Tsutomu、Tomita Kozo
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 48 Pages: 7532~7544

    • DOI

      10.1093/nar/gkaa487

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanistic insights into m6A modification of U6 snRNA by human METTL162020

    • Author(s)
      Aoyama Tomohiko、Yamashita Seisuke、Tomita Kozo
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 48 Pages: 5157~5168

    • DOI

      10.1093/nar/gkaa227

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In vitro yeast reconstituted translation system reveals function of eIF5A for synthesis of long polypeptide2020

    • Author(s)
      Abe Taisho、Nagai Riku、Shimazaki Shunta、Kondo Shunta、Nishimura Satoshi、Sakaguchi Yuriko、Suzuki Tsutomu、Imataka Hiroaki、Tomita Kozo、Takeuchi-Tomita Nono
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 167 Pages: 451~462

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa022

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of human cytoplasmic tRNAHis-specific 5′-monomethylphosphate capping enzyme2020

    • Author(s)
      Liu Yining、Martinez Anna、Yamashita Seisuke、Tomita Kozo
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 48 Pages: 1572~1582

    • DOI

      10.1093/nar/gkz1216

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Crystal structure of the Lin28-interacting module of human terminal uridylyltransferase that regulates let-7 expression2019

    • Author(s)
      Yamashita Seisuke、Nagaike Takashi、Tomita Kozo
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 1~11

    • DOI

      10.1038/s41467-019-09966-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Crystal Structure of the Enterohemorrhagic Escherichia coli AtaT-AtaR Toxin-Antitoxin Complex2019

    • Author(s)
      Yashiro Yuka、Yamashita Seisuke、Tomita Kozo
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 27 Pages: 476~484.e3

    • DOI

      10.1016/j.str.2018.11.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] アミノアシル転移RNAを標的とするトキシンの活性制御メカニズム2019

    • Author(s)
      八代 悠歌、富田 耕造
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 91 Pages: 810~814

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2019.910810

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Crystal structure of the Lin28-interacting module of human terminal uridylyltransferase that regulates let-7 expression2019

    • Author(s)
      山下征輔、富田 耕造
    • Organizer
      日本RNA学会年会
  • [Presentation] METTL16 の脊椎動物保存領域はU6 snRNA のm6A 修飾を促進する 第21回 日本RNA学会年2019

    • Author(s)
      青山智彦、山下征輔、富田 耕造
    • Organizer
      日本RNA学会年会
  • [Presentation] Crystal Structure of the Enterohemorrhagic Escherichia coli AtaT-AtaR ToxinAntitoxin Complex2019

    • Author(s)
      八代悠歌、富田 耕造
    • Organizer
      日本RNA学会年会

URL: 

Published: 2021-01-27  

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