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2021 Fiscal Year Annual Research Report

高次生命現象を制御する鋳型非依存的RNA合成酵素の構造と機能

Research Project

Project/Area Number 18H03980
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

富田 耕造  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (00345274)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
KeywordsRNA / X線結晶解析 / 修飾酵素 / プロセシング
Outline of Annual Research Achievements

本年度は鋳型非依存的なRNA合成酵素として 1)U6 snRNA特異的なオリゴウリジル化酵素(TUT1)のC末端側のKA1を除いた部分とU6 snRNAの変異体の複合体の構造を決定し、TUT1がU6 snRNAを特異的に認識する分子基盤を明らかにした(論文準備中)。2)オリゴアデニル/グアニリル化酵素 (TENT4A/B)のコア領域の構造を中分解で決定した。今後ヌクレオチドやRNAとの複合体解析を行う予定である。3)結核菌の有するヌクレオチド転移酵素群に属する毒素MenAが細胞内でtRNASerを標的とし、tRNAのCCA末端をオリゴシチジル化することを明らかにした。MenAとCTPの複合体の結晶構造解析からCTPの特異的な認識の分子基盤を明らかにした。今後tRNAとの複合体解析も行う予定である。4)線虫の細胞内SAM濃度の恒常性維持に関わるsams3-5の選択的スプライシングを制御するMETT-10のメチル転移酵素ドメインの構造決定に成功し、METT10によるsams mRNAの3’-スプライシングサイトのメチル化(m6A)の分子機構を明らかにした(論文準備中)5)細菌のパシスターに関与するアミノアシルtRNA(aa-tRNA)をアセチル化するサルモネラ由来の毒素TacTがGly-tRNAを特異的にアセチル化することを見出し、TacTとGly-tRNAGlyの複合体の結晶構造解析に成功し、TacTによるGly-tRNAGly特異的アセチル化の分子基盤を明らかにした(Cell Reports 2021)。6)細菌間の接触性増殖阻害(CDI)に関わり、標的細胞内での翻訳因子によって活性化され特異的なtRNAを切断するCdiA-CTEC869と翻訳因子との複合体の構造解析、生化学的解析から翻訳因子によるCdiA-CTEC869活性化の分子機構を明らかにした(NAR 2022)。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Mechanistic insights into tRNA cleavage by a contact-dependent growth inhibitor protein and translation factors2022

    • Author(s)
      Wang Jing、Yashiro Yuka、Sakaguchi Yuriko、Suzuki Tsutomu、Tomita Kozo
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1093/nar/gkac228

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reversible RNA phosphorylation stabilizes tRNA for cellular thermotolerance2022

    • Author(s)
      Takayuki Ohira, Keiichi Minowa, Kei Sugiyama, Seisuke Yamashita, Yuriko Sakaguchi, Kenjyo Miyauchi, Ryo Noguchi, Akira Kaneko, Izumi Orita, Toshiaki Fukui, Kozo Tomita,Tsutomu Suzuki
    • Journal Title

      Nature

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41586-022-04677-2

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular basis of glycyl-tRNAGly acetylation by TacT from Salmonella Typhimurium2021

    • Author(s)
      Yashiro Yuka、Zhang Chuqiao、Sakaguchi Yuriko、Suzuki Tsutomu、Tomita Kozo
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 37 Pages: 110130~110130

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.110130

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Molecular basis for nucleotide selection by tRNA nucleotidyltransferase toxin from Mycobacterium tuberculosis2022

    • Author(s)
      Jun Liu, Yuka Yashiro, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2021 (20220303-0304 恩納村, 沖縄
  • [Presentation] Mechanistic insights into tRNA cleavage by a contact-dependent growth inhibitor protein and translation factors2022

    • Author(s)
      Jing Wang, Yuka Yashiro, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2021 (20220303-0304 恩納村, 沖縄
  • [Presentation] Mechanistic insight into the m6A modification of RNA by METT-10 from Caenorhabditis elegans2022

    • Author(s)
      Jue Ju, Tomohiko Aoyama, Hidehito Kuroyanagi, Kozo Tomita
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2021 (20220303-0304 恩納村, 沖縄
  • [Presentation] Structural and biochemical study of C. elegans METT-102021

    • Author(s)
      Jue Ju, Tomohiko Aoyama, Hidehito Kuroyanagi, Kozo Tomita
    • Organizer
      第22回日本RNA学会年会 (20210707-0709 鶴岡、山形)
  • [Presentation] Mechanistic analysis of specific tRNA cleavage by the CdiA-CT toxin from enterohemorrhagic Escherichia coli cells2021

    • Author(s)
      Jing Wang, Yuka Yashiro, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita
    • Organizer
      第22回日本RNA学会年会 (20210707-0709 鶴岡、山形)
  • [Presentation] Mechanism of the selective aminoacyl-tRNA acetylation by TacT from Salmonella Typhimurium2021

    • Author(s)
      Yuka Yashiro, Chuqiao Zhang, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita
    • Organizer
      第22回日本RNA学会年会 (20210707-0709 鶴岡、山形)

URL: 

Published: 2022-12-28  

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