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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Groval aanalys of the nerve growth using proteomics and superresolution

Research Project

Project/Area Number 18H04013
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

五十嵐 道弘  新潟大学, 医歯学系, 教授 (50193173)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords成長円錐 / リン酸化プロテオミクス / 超解像度顕微鏡 / GAP-43 / MAP1B / JNK
Outline of Annual Research Achievements

成長円錐のリン酸化プロテオミクスデータを解析することで、以下の結果を得て発表した。1) リン酸化プロテオミクスデータで成長円錐の1,200種類のリン酸化タンパク質と、独立したリン酸化部位5,000か所を同定した。これらをバイオインフォマティクスと阻害剤を用いて解析し、主要なリン酸化はMAPK系のJNKでリン酸化されることを証明した。また最も頻度の高いGAP-43分子のpS96について、このリン酸化抗体が成長円錐と伸長・再生軸索を特異的に認識することを証明した。2) 同じくGAP-43のpT172, pS142も同様の性質を持ち、これらのリン酸化はヒトiPS細胞由来の神経細胞や、非ヒト霊長類のマーモセット新生仔脳ニューロンでもげっ歯類の成長軸索と同様に、強く認識された。3) 微小管結合タンパク質MAP1Bでも新規のリン酸化部位2か所(pS25, pS1201)を同定し、そのリン酸化特異抗体が伸長軸索、再生軸索(末梢神経の損傷坐骨神経)を認識することを明らかにした。4) げっ歯類のリン酸化プロテオミクスの結果から、これらのリン酸化部位が線虫、ショウジョウバエといった無脊椎のモデル動物では保存されていないことが分かった。この結果は、脊椎動物のリン酸化は、無脊椎動物のそれとは大きく異なり、また生化学的な神経成長機構も分子レベルで大きく異なっていることを明らかにした。
また超解像度顕微鏡を使って成長円錐のフィロポディアを解析し、3Dレベルでフィロポディアが短い周期で出現と消退を繰り返していることを見出した。これは2次元的なフィロポディアの伸長・消退より極めてスピーディであった。この3Dレベルのフィロポディアの役割を解析し、軸索ガイダンス受容体やアクチン調節タンパク質との関連を明らかにした。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (27 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 4 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results)

  • [Journal Article] JNK1-dependent phosphorylation of GAP-43 Serine 142 is a novel molecular marker for axonal growth.2022

    • Author(s)
      Okada M, Kawagoe Y, Takasugi T, Nozumi M, Ito Y, Fukusumi H, Kanemura Y, Fujii Y, *Igarashi M
    • Journal Title

      Neurochem Res

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1007/s11064-022-03580-6.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase-2 plays a cardioprotective role in heart failure caused by acute pressure overload.2022

    • Author(s)
      Haryono A, Ikeda K, Nugroho D, Ogata T, Tsuji Y, Matoba S, Moriwaki K, Kitagawa H, Igarashi M, Hirata K, Emoto N
    • Journal Title

      J Am Heart Assoc

      Volume: 11 Pages: e023401

    • DOI

      10.1161/JAHA.121.023401.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] PI4P/PS countertransport by ORP10 at ER-endosome membrane contact sites regulates endosome fission2022

    • Author(s)
      Kawasaki A, Sakai A, Nakanishi H, Hasegawa J, Taguchi T, Sasaki J, Arai H, Sasaki T, Igarashi M, Nakatsu F
    • Journal Title

      J Cell Biol

      Volume: 221 Pages: e202103141

    • DOI

      10.1083/jcb.202103141

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Coactosin Promotes F-Actin Protrusion in Growth Cones Under Cofilin-Related Signaling Pathway2021

    • Author(s)
      Hou Xubin、Nozumi Motohiro、Nakamura Harukazu、Igarashi Michihiro、Sugiyama Sayaka
    • Journal Title

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      Volume: 9 Pages: 660349

    • DOI

      10.3389/fcell.2021.660349

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Chondroitin Sulfate <i>N</i> -acetylgalactosaminyltransferase-2 Impacts Foam Cell Formation and Atherosclerosis by Altering Macrophage Glycosaminoglycan Chain2021

    • Author(s)
      Adhikara Imam Manggalya、Yagi Keiko、Mayasari Dyah Samti、Suzuki Yoko、Ikeda Koji、Ryanto Gusty Rizky Teguh、Sasaki Naoto、Rikitake Yoshiyuki、Nadanaka Satomi、Kitagawa Hiroshi、Miyata Okiko、Igarashi Michihiro、Hirata Ken-ichi、Emoto Noriaki
    • Journal Title

      Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology

      Volume: 41 Pages: 1076~1091

    • DOI

      10.1161/ATVBAHA.120.315789

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Distinct effects of chondroitin sulfate on hematopoietic cells and the stromal microenvironment in bone marrow hematopoiesis2021

    • Author(s)
      Katagiri Takayuki、Uemura Shun、Ushiki Takashi、Nakajima-Takagi Yaeko、Oshima Motohiko、Mikami Tadahisa、Kawasaki Asami、Ishiguro Hajime、Tanaka Tomoyuki、Sone Hirohito、Kitagawa Hiroshi、Igarashi Michihiro、Iwama Atsushi、Masuko Masayoshi
    • Journal Title

      Experimental Hematology

      Volume: 96 Pages: 52~62.e5

    • DOI

      10.1016/j.exphem.2021.02.003

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phosphorylation of GAP-43 T172 is a molecular marker of growing axons in a wide range of mammals including primates2021

    • Author(s)
      Okada Masayasu、Kawagoe Yosuke、Sato Yuta、Nozumi Motohiro、Ishikawa Yuya、Tamada Atsushi、Yamazaki Hiroyuki、Sekino Yuko、Kanemura Yonehiro、Shinmyo Yohei、Kawasaki Hiroshi、Kaneko Naoko、Sawamoto Kazunobu、Fujii Yukihiko、Igarashi Michihiro
    • Journal Title

      Molecular Brain

      Volume: 14 Pages: 66

    • DOI

      10.1186/s13041-021-00755-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Chondroitin sulfate <i>N</i>-acetylgalactosyltransferase-1 knockout shows milder phenotype in experimental autoimmune encephalomyelitis than in wild type2020

    • Author(s)
      Inada Rino、Miyamoto Katsuichi、Tanaka Noriko、Moriguchi Kota、Kadomatsu Kenji、Takeuchi Kosei、Igarashi Michihiro、Kusunoki Susumu
    • Journal Title

      Glycobiology

      Volume: 31 Pages: 260~265

    • DOI

      10.1093/glycob/cwaa072

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phosphoproteomic and bioinformatic methods for analyzing signaling in vertebrate axon growth and regeneration2020

    • Author(s)
      Igarashi Michihiro、Kawasaki Asami、Ishikawa Yuya、Honda Atsuko、Okada Masayasu、Okuda Shujiro
    • Journal Title

      Journal of Neuroscience Methods

      Volume: 339 Pages: 108723~108723

    • DOI

      10.1016/j.jneumeth.2020.108723

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Neuronal Signaling Involved in Neuronal Polarization and Growth: Lipid Rafts and Phosphorylation2020

    • Author(s)
      Igarashi Michihiro、Honda Atsuko、Kawasaki Asami、Nozumi Motohiro
    • Journal Title

      Frontiers in Molecular Neuroscience

      Volume: 13 Pages: 150

    • DOI

      10.3389/fnmol.2020.00150

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Isoform-dependent subcellular localization of LMTK1A and LMTK1B and their roles in axon outgrowth and spine formation2020

    • Author(s)
      Wei Ran、Sugiyama Arika、Sato Yuta、Nozumi Motohiro、Nishino Hironori、Takahashi Miyuki、Saito Taro、Ando Kanae、Fukuda Mitsunori、Tomomura Mineko、Igarashi Michihiro、Hisanaga Shin-ichi
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 168 Pages: 23~32

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa019

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microtubule elongation along actin filaments induced by microtubule-associated protein 4 contributes to the formation of cellular protrusions2020

    • Author(s)
      Doki Chihiro、Nishida Kohei、Saito Shoma、Shiga Miyuki、Ogara Hikari、Kuramoto Ayumu、Kuragano Masahiro、Nozumi Motohiro、Igarashi Michihiro、Nakagawa Hiroyuki、Kotani Susumu、Tokuraku Kiyotaka
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 168 Pages: 295~303

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa046

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 蛍光陰影によるオルガネラのライブイメージング2022

    • Author(s)
      野住 素広、五十嵐 道弘、Valentin Nagerl
    • Organizer
      生体運動研究合同会議
  • [Presentation] 神経成長円錐の3次元空間で生じるアクチン再編と形質膜取込み2021

    • Author(s)
      野住 素広、五十嵐 道弘
    • Organizer
      第126回日本解剖学会総会・全国学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 非接着性のフィロポディアは拡散性ガイダンス因子の濃縮に関係する2021

    • Author(s)
      野住 素広、五十嵐 道弘
    • Organizer
      第44回日本神経科学大会
  • [Presentation] 組織透明化による脳の発達と神経再生の解析2021

    • Author(s)
      川越 洋介、岡田 正康、田井中 一貴、五十嵐 道弘
    • Organizer
      第44回日本神経科学大会
  • [Presentation] 霊長類と齧歯類における神経成長マーカーの探索2021

    • Author(s)
      岡田 正康、川越 洋介、金子 奈穂子、山崎 博幸、河崎 洋志、棗田 学、大石 誠、藤井 幸彦、五十嵐 道弘
    • Organizer
      第44回日本神経科学大会
  • [Presentation] 超解像陰影法による複数オルガネラの同時可視化2021

    • Author(s)
      野住 素広、五十嵐 道弘
    • Organizer
      第64回日本神経化学会大会
  • [Presentation] Phosphorylation of GAP-43 T172 is a molecular marker representing the growing axons in a wide range of mammals including primates2021

    • Author(s)
      岡田 正康、河嵜麻実、金子 奈穂子、山崎 博幸、河崎 洋志、金村米博、澤本和延、藤井幸彦、五十嵐 道弘
    • Organizer
      第64回日本神経化学会大会
  • [Presentation] ヒト神経細胞成長マーカーの同定2021

    • Author(s)
      岡田正康、金子奈穂子、山崎博幸、棗田学、大石誠、金村米博、澤本和延、藤井幸彦、五十嵐道弘
    • Organizer
      第80回日本脳神経外科学会総会
    • Invited
  • [Presentation] 神経軸索成長における極長鎖脂肪酸産生酵素GPSN2の生理的役割2021

    • Author(s)
      本多 敦子、野住 素広、五十嵐 道弘
    • Organizer
      第94回日本生化学大会
  • [Presentation] 成長円錐プロテオミクスから発見した新規神経成長・再生マーカー2020

    • Author(s)
      岡田正康、河嵜麻実、玉田篤史、佐藤勇太、北浦弘樹、棗田学、木村展之、金子奈穂子、武内恒成、柿田明美、藤井幸彦、五十嵐道弘
    • Organizer
      第43回日本神経科学大会
    • Invited
  • [Presentation] 神経発生における極長鎖脂肪酸合成酵素GPSN2の生理機能2020

    • Author(s)
      本多敦子、野住素広、内野春希、有田誠、五十嵐道弘
    • Organizer
      第43回日本神経科学大会
  • [Presentation] 組織透明化後免疫染色によるマウス胎児脳の解析2020

    • Author(s)
      深沢洋介、岡田正康、田井中一貴、五十嵐道弘
    • Organizer
      第43回日本神経科学大会
  • [Presentation] 神経発生過程における脂肪酸鎖長伸長酵素GPSN2の生理的役割2020

    • Author(s)
      本多敦子、野住素広、内野春希、有田誠、五十嵐道弘
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
  • [Presentation] Omics studies of axon development and regeneration2020

    • Author(s)
      Michihiro Igarashi
    • Organizer
      Metabolites in neuronal regeneration
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] F-アクチンは神経成長円錐の非接着面における軸索ガイダンス分子の捕捉に関与する2020

    • Author(s)
      野住素広、五十嵐道弘
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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