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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Investigation for mechanisms underlying cell cycle regulation and metabolism in stem cells

Research Project

Project/Area Number 18H05215
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

中山 敬一  九州大学, 生体防御医学研究所, 主幹教授 (80291508)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 服部 聡子 (高井聡子)  藤田医科大学, 総合医科学研究所, 助教 (00415564)
中山 啓子  東北大学, 医学系研究科, 教授 (60294972)
Project Period (FY) 2018-04-23 – 2023-03-31
Keywords細胞周期
Outline of Annual Research Achievements

われわれは以前、細胞周期の静止状態を維持するp57遺伝子が造血幹細胞や神経幹細胞といった代表的な組織幹細胞に特異的に発現することを発見しており、このp57の発現を指標とすることで、腸管においても新たな幹細胞集団を同定できるのではないかと考えた。われわれの予想通り、造血幹細胞や神経幹細胞の細胞周期停止に重要なp57遺伝子が、腸管上皮においても稀少な細胞集団に特異的に発現していることを発見した。そこでp57の系統追跡マウスを作製し、p57発現細胞の挙動を解析した結果、p57発現細胞は通常の状態では分化細胞の一種として存在しているが、組織がダメージを受けると脱分化して幹細胞となり、腸管の再生に重要な役割を果たすことがわかった。さらに腸管上皮を1細胞RNA-seq法によって解析したところ、再生途上のp57発現細胞では本来成体腸管には発現していないはずの胎児腸管の遺伝子群や胃上皮の遺伝子群が高発現していることがわかり、幹細胞性獲得の過程において通常の成体腸管とはまったく異なった細胞状態を経ていることが明らかとなった。つまり腸管の傷害後再生においては、分化した細胞の遺伝子発現プロファイルをダイナミックに作り変える(=リプログラミングする)ことで脱分化を引き起こし、新たな幹細胞集団を作り出していると考える。われわれは、この時間的(胎児返り)・空間的(胃上皮様変化)なリプログラミングを「時空間的リプログラミング」と名付けた。p57発現細胞はまた、Apc変異マウスで自然発生する腸管腫瘍においてもがん幹細胞として機能しており、かつ腫瘍内でも上記と同様の時空間的リプログラミング現象が起こっていることが判明した。将来的には、このような時空間的リプログラミングのメカニズムを研究することにより、がん幹細胞を根絶する治療法を確立できると期待される。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

既にアリル特異的Hi-Cシステムは開発済であるので、これを用いてp57インプリンティング領域のTADをESCとASCにおいて調べたところ、解像度の点で満足すべき結果が得られなかった。そこでさらに高解像度のTAD解析を行うため、4Cによる解析も同様に行ったところ高解像度のTAD解析に成功し、新たなエンハンサー領域の同定に成功した。またp57陽性細胞がどのような幹細胞機能を有するかについて、腸管と胃において系統追跡実験を施行し、一部は論文として発表した(Higa et al., Nat. Commun. 13: 1500, 2022)。さらに腫瘍化において、p57陽性幹細胞が果たす役割についても明らかにすることができ、現在治療法の開発についても基礎理論の形成ができつつある。このように全体の進捗は順調に進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

1)高解像度4C解析によって同定されたエンハンサー領域を欠損した遺伝子改変マウスを作製し、p57の発現、ゲノムインプリンティング、幹細胞の細胞周期およびその機能、にどのような影響をもたらすかを検討する。
2)胃におけるp57陽性幹細胞の性質を明らかにする。特にこの幹細胞は迷走神経支配を受けている可能性があるため、迷走神経の切断実験を行い、幹細胞性の変化を検討する。
3)その他の細胞周期-代謝系に影響を与える分子群の研究、特にc-Myc-Fbxw7系やp53-CHD8系等もp57/Skp2系と同様に細胞周期と代謝制御の接点に位置することがわれわれの研究から分かっており、それらについてもノックアウトマウスの解析を進める。

  • Research Products

    (17 results)

All 2022 2021 Other

All Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 8 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results) Book (1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Spatiotemporal reprogramming of differentiated cells underlies regeneration and neoplasia in the intestinal epithelium2022

    • Author(s)
      Higa Tsunaki、Okita Yasutaka、Matsumoto Akinobu、Nakayama Shogo、Oka Takeru、Sugahara Osamu、Koga Daisuke、Takeishi Shoichiro、Nakatsumi Hirokazu、Hosen Naoki、Robine Sylvie、Taketo Makoto M.、Sato Toshiro、Nakayama Keiichi I.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Pages: 1500

    • DOI

      10.1038/s41467-022-29165-z

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Kastor and Polluks polypeptides encoded by a single gene locus cooperatively regulate VDAC and spermatogenesis2022

    • Author(s)
      Mise Shintaro、Matsumoto Akinobu、Shimada Keisuke、Hosaka Toshiaki、Takahashi Masatomo、Ichihara Kazuya、Shimizu Hideyuki、Shiraishi Chisa、Saito Daisuke、Suyama Mikita、Yasuda Tomoharu、Ide Toru、Izumi Yoshihiro、Bamba Takeshi、Kimura-Someya Tomomi、Shirouzu Mikako、Miyata Haruhiko、Ikawa Masahito、Nakayama Keiichi I.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Pages: 1071

    • DOI

      10.1038/s41467-022-28677-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Multi-omics-based label-free metabolic flux inference reveals obesity-associated dysregulatory mechanisms in liver glucose metabolism2022

    • Author(s)
      Uematsu Saori、Ohno Satoshi、Tanaka Kaori Y.、Hatano Atsushi、Kokaji Toshiya、Ito Yuki、Kubota Hiroyuki、Hironaka Ken-ichi、Suzuki Yutaka、Matsumoto Masaki、Nakayama Keiichi I.、Hirayama Akiyoshi、Soga Tomoyoshi、Kuroda Shinya
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Pages: 103787~103787

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.103787

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Combinatorial analysis of translation dynamics reveals eIF2 dependence of translation initiation at near-cognate codons2021

    • Author(s)
      Ichihara Kazuya、Matsumoto Akinobu、Nishida Hiroshi、Kito Yuki、Shimizu Hideyuki、Shichino Yuichi、Iwasaki Shintaro、Imami Koshi、Ishihama Yasushi、Nakayama Keiichi I
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 49 Pages: 7298~7317

    • DOI

      10.1093/nar/gkab549

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The autism-associated protein CHD8 is required for cerebellar development and motor function2021

    • Author(s)
      Kawamura Atsuki、Katayama Yuta、Kakegawa Wataru、Ino Daisuke、Nishiyama Masaaki、Yuzaki Michisuke、Nakayama Keiichi I.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 35 Pages: 108932~108932

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.108932

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An extensive and dynamic trans-omic network illustrating prominent regulatory mechanisms in response to insulin in the liver2021

    • Author(s)
      Matsuzaki Fumiko、Uda Shinsuke、Yamauchi Yukiyo、Matsumoto Masaki、Soga Tomoyoshi、Maehara Kazumitsu、Ohkawa Yasuyuki、Nakayama Keiichi I.、Kuroda Shinya、Kubota Hiroyuki
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 36 Pages: 109569~109569

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.109569

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification and characterization of novel proteins associated with CHD42021

    • Author(s)
      Sakaguchi Chihiro、Ichihara Kazuya、Nita Akihiro、Katayama Yuta、Nakayama Keiichi I.
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 27 Pages: 61~71

    • DOI

      10.1111/gtc.12909

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The heavy chain of 4F2 antigen promote prostate cancer progression via SKP-22021

    • Author(s)
      Maimaiti Maihulan、Sakamoto Shinichi、Sugiura Masahiro、Kanesaka Manato、Fujimoto Ayumi、Matsusaka Keisuke、Xu Minhui、Ando Keisuke、Saito Shinpei、Wakai Ken、Imamura Yusuke、Nakayama Keiichi、Kanai Yoshikatsu、Kaneda Atsushi、Ikehara Yuzuru、Ikeda Jun-Ichiro、Anzai Naohiko、Ichikawa Tomohiko
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Pages: 11478

    • DOI

      10.1038/s41598-021-90748-9

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Oxytocin ameliorates impaired social behavior in a Chd8 haploinsufficiency mouse model of autism2021

    • Author(s)
      Cherepanov Stanislav M.、Gerasimenko Maria、Yuhi Teruko、Furuhara Kazumi、Tsuji Chiharu、Yokoyama Shigeru、Nakayama Keiichi I.、Nishiyama Masaaki、Higashida Haruhiro
    • Journal Title

      BMC Neuroscience

      Volume: 22 Pages: 32

    • DOI

      10.1186/s12868-021-00631-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A ubiquitin-like protein encoded by the “noncoding” RNA TINCR promotes keratinocyte proliferation and wound healing2021

    • Author(s)
      Nita Akihiro、Matsumoto Akinobu、Tang Ronghao、Shiraishi Chisa、Ichihara Kazuya、Saito Daisuke、Suyama Mikita、Yasuda Tomoharu、Tsuji Gaku、Furue Masutaka、Katayama Bumpei、Ozawa Toshiyuki、Murata Teruasa、Dainichi Teruki、Kabashima Kenji、Hatano Atsushi、Matsumoto Masaki、Nakayama Keiichi I.
    • Journal Title

      PLOS Genetics

      Volume: 17 Pages: 1009686~1009686

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1009686

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Life sciences in the near future: Towards an era of data-driven sciences with artificial intelligence2022

    • Author(s)
      Nakayama KI, Matsumoto M
    • Organizer
      The 30th Hot Spring Harbor International Symposium: New technologies meet Biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 第二のワールブルグ効果:がんにおけるグルタミン由来窒素代謝の変化2021

    • Author(s)
      中山敬一
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] これからの生命科学研究:オミクスから人工知能まで2021

    • Author(s)
      中山敬一
    • Organizer
      東日本研究医養成プログラム 第11回 「夏のリトリート」
    • Invited
  • [Presentation] がん幹細胞の撲滅による新しいがん治療法2021

    • Author(s)
      中山敬一
    • Organizer
      第一回日本放射線影響学会・若手部会 放射線影響研究会
    • Invited
  • [Book] 実験医学2021年7月号2021

    • Author(s)
      中山敬一
    • Total Pages
      129
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      978-4-7581-2545-1
  • [Remarks] 九州大学生体防御医学研究所分子医科学分野

    • URL

      https://www.bioreg.kyushu-u.ac.jp/saibou/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 相互作用推定方法、相互作用推定装置および相互作用推定プログラム2021

    • Inventor(s)
      中山敬一, 清水秀幸
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人九州大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2021-091667

URL: 

Published: 2022-12-28  

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