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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Development of individual-based tracking of crop damaging animals in order to estimate their behavioral characteristics

Research Project

Project/Area Number 18J00774
Research InstitutionResearch Institute for Humanity and Nature

Principal Investigator

原口 岳  総合地球環境学研究所, 研究部, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2018-04-25 – 2021-03-31
Keywords多元素同位体 / アイソスケープ (同位体地図) / 化合物特異的同位体分析 / DNAメタバーコーディング
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、農作物被害に関与する獣類の糞の分析から、個体毎の生態を解明し、どの個体が、どこで、どれくらい農作物を加害しているのかを可視化する手法を開発するために、ニホンジカ(以下シカ)を研究対象とした手法開発に取り組んだ。そのために、DNAと安定同位体分析を組み合わせたアプローチを用いて、シカの個体の属性・行動圏・食性の3つを明らかにするために研究をおこなった。シカの生態を明らかにするうえで重要な、これら3項目の情報のうち、2019年度はシカの個体の属性と行動圏に関わる研究に取り組んだ。まず、糞試料から、植物由来であることが明らかである「セルロース」を抽出して分析をおこなうため、抽出手法を検討した。初期は抽出・遠心分離・洗浄を繰り返す手法を用いていたが、改良をおこない、固相抽出器具をもちいた方法を開発し、実験の所要時間を短縮した。続いて、食性の指標としての同位体分析と同様に、糞の安定同位体比がエサの同位体組成を反映するかを確かめるために、採餌実験試料からセルロースを抽出し、酸素同位体分析をおこなった。また、個体を識別するために用いるマイクロサテライト領域を分析するうえで必要なDNA抽出について、食性情報を得るためのDNA抽出とプロトコルを、植物DNAの抽出キットを用いた方法で共通化し、所要時間とコストを短縮できることを検証した。得られたDNA抽出物からは、既往研究でニホンジカの個体識別のために開発された4遺伝子座位を増幅し、個体識別のための情報として利用出来ることが確かめられた。以上のように、2019年度におこなった研究により、分析試料から様々な成分を精製して分析に供するための一連のプロトコルを確立した。

Research Progress Status

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

  • Research Products

    (16 results)

All 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results)

  • [Journal Article] Isotopic and molecular data support mixotrophy in Ophioglossum at the sporophytic stage2020

    • Author(s)
      Suetsugu Kenji、Taketomi Shintaro、Tanabe Akifumi S.、Haraguchi Takashi F.、Tayasu Ichiro、Toju Hirokazu
    • Journal Title

      New Phytologist

      Volume: - Pages: nph.16534

    • DOI

      10.1111/nph.16534

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of winter flooding on phosphorus dynamics in rice fields2020

    • Author(s)
      Ishida Takuya、Uehara Yoshitoshi、Ikeya Tohru、Haraguchi Takashi F.、Asano Satoshi、Ogino Yohei、Okuda Noboru
    • Journal Title

      Limnology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1007/s10201-020-00621-3

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Siberian Permafrost Thawing Accelerated at the Bolling/Allerod and Preboreal Warm Periods During the Last Deglaciation2019

    • Author(s)
      Katsuta Nagayoshi、Matsumoto Genki I.、Hase Yoshitaka、Tayasu Ichiro、Haraguchi Takashi F.、Tani Eriko、Shichi Koji、Murakami Takuma、Naito Sayuri、Nakagawa Mayuko、Hasegawa Hitoshi、Kawakami Shin‐ichi
    • Journal Title

      Geophysical Research Letters

      Volume: 46 Pages: 13961~13971

    • DOI

      10.1029/2019GL084726

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Vertical seed dispersal of Japanese crowberry by Japanese black bears and birds: estimation using stable oxygen isotope ratios2020

    • Author(s)
      Takahashi, K., Naoe, S., Saeki, K., Koide, Y., Amari, T., Tsunamoto, Y., Tayasu, I., Haraguchi, T., Takahashi, K.
    • Organizer
      Frugivores & Seed Dispersal Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ホシガラスによるハイマツの標高方向の種子散布:岩手山周辺での事例 (Vertical seed dispersal of Pinus pumila by nutcracker: a case study of Mt Iwate)2020

    • Author(s)
      Tsunamoto, Y., Tayasu, I., Haraguchi, T.F., Naoe, S.
    • Organizer
      日本生態学会
  • [Presentation] 兵庫県千種川流域における硝酸イオンおよび硫酸イオンの季節的動態の比較 (Contrasting seasonal dynamics of nitrate and sulfate in Chikusa River watershed, Hyogo, Japan)2020

    • Author(s)
      藤吉麗, 陀安一郎, 藪崎志穂, 原口岳, 由水千景, 大串健一, 古川文美子, 伊藤真之, 山本雄大, 横山正, 三橋弘宗
    • Organizer
      日本生態学会
  • [Presentation] Inter-annual variation of fecal nitrogen stable isotope values, as an indicator of herbivory by deer at cultivated lands (シカの耕作地における採食指標としての糞窒素安定同位体比の年変動)2020

    • Author(s)
      Haraguchi, T.F., Koda, R., Ishizuka, Y., Tayasu, I.
    • Organizer
      日本生態学会
  • [Presentation] 農作物利用はシカの妊娠率を向上させるのか?窒素安定同位体比による検証 (Can the pregnancy rate of deer increase with rise in crop damage by deer? Evaluation using nitrogen stable isotope values)2020

    • Author(s)
      幸田良介, 原口岳, 石塚譲
    • Organizer
      日本生態学会
  • [Presentation] 照葉樹林におけるイノシシの攪乱が森林の土壌動物群集に与える影響 (Effects of wild boar disturbances on soil animal community in the evergreen forest)2020

    • Author(s)
      長谷川元洋, 豊田鮎, 佐藤重穂, 原口岳
    • Organizer
      日本生態学会
  • [Presentation] Spatial distribution of nitrogen stable isotope ratio in deer feces in an agro-environment, Osaka2019

    • Author(s)
      Haraguchi, T.F., Koda, R., Tayasu, I.
    • Organizer
      日本地球惑星科学連合 (JpGU)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Dynamics of sulfate and nitrate inferred from stable isotope techniques in Chikusa river watershed, Hyogo Prefecture2019

    • Author(s)
      Fujiyoshi, L., Tayasu, I., Yabusaki, S., Haraguchi, T.F., Yoshimizu, C., Ohkushi, K., Furukawa, F., Itoh, M., Yamamoto, Y., Yokoyama, T., Mitsuhashi, H.
    • Organizer
      日本地球惑星科学連合 (JpGU)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 箕面国有林での捕獲強化に伴うシカ生息密度と空間分布の変化~里地でのシカの増加~2019

    • Author(s)
      幸田良介, 石塚譲, 原口岳
    • Organizer
      日本哺乳類学会
  • [Presentation] Contribution of oceanic sulfur to coastal ecosystem using isotope ratio in lichens: formulating distance-decay and applying model selection approach2019

    • Author(s)
      Kamauchi, H., Ohta, T., Ishida, T., Haraguchi, T.F., Tayasu, I.
    • Organizer
      AGU fall meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] カラス科鳥類による標高方向の種子散布はブナとハイマツの温暖化からの避難に役立つか:酸素同位体による評価(Does vertical seed dispersal by corvids help the escape of beech and stone pine from global warming?: evaluation using oxygen isotope)2019

    • Author(s)
      直江将司, 綱本良啓, 原口岳, 陀安一郎
    • Organizer
      同位体環境学シンポジウム
  • [Presentation] 兵庫県千種川流域における硝酸イオンおよび硫酸イオンの季節的動態の比較 (Contrasting dynamics of nitrate and sulfate in Chikusa river watershed, Hyogo, Japan)2019

    • Author(s)
      藤吉麗, 陀安一郎, 藪崎志穂, 原口岳, 由水千景, 大串健一, 古川文美子, 伊藤真之, 山本雄大, 横山正, 三橋弘宗
    • Organizer
      同位体環境学シンポジウム
  • [Presentation] 有田川における両側回遊魚類の遡上が捕食性魚類にもたらす海洋資源補償の可能性 (Does the migration of amphidromous fishes bring compensatory resource to large predators?: a case study in Arida River)2019

    • Author(s)
      田中良輔, 太田民久, 陀安一郎, 原口岳, 宇野裕美, 佐藤拓哉
    • Organizer
      同位体環境学シンポジウム

URL: 

Published: 2021-01-27  

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