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2018 Fiscal Year Annual Research Report

台湾産マンネングサ属の平行適応放散をモデルにした網羅的な適応進化プロセスの検証

Research Project

Project/Area Number 18J01069
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

伊東 拓朗  京都大学, 農学研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2018-04-25 – 2021-03-31
Keywords適応放散 / 適応進化 / 平行進化 / 台湾 / 高山 / 系統地理 / ゲノム / CAM
Outline of Annual Research Achievements

ベンケイソウ科マンネングサ属は東アジア地域を一つの多様性の中心に持ち,中でも大陸島台湾の高地環境おいて,劇的に異なる光・水分環境に進出し,種多様化を遂げている.これまでの申請者の研究から,台湾固有のマンネングサ属種は2系統存在し,各系統で異なる光・水分環境に生育する種が急速に進化し,かつ2系統で独立して類似生態シフトと適応形質(葉形態及び光合成特性)を獲得した急速な種多様化(平行適応放散)を遂げていたことが明らかになっている.しかしながらその種分化や適応放散プロセスの解明には至っていないため,本研究では当該種群をモデルとした,網羅的な環境-形態-生理-ゲノムデータに基づく非生物環境への適応放散/進化メカニズムの解明を目的として研究を進めている.
生育環境の評価については,各種について通年で温度,湿度,照度計を設置し環境データを収集しており,各生育環境の評価ができつつある.また新たな適応形質の探索として,化学成分分析や根形態の調査等を行っており,各環境ごとに一定の傾向がみられ,適応形質である可能性がある.そしてゲノム解析について,現在1種についてゲノム解読を進めており,完成次第他種についてリシーケンスを進め,集団動態解析や自然選択を受けた遺伝子座の検出などを試みる予定である.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

各種の生育環境の環境特性が明らかになりつつある.適応形質について,これまで調査してきた葉形態や光合成様式に加え,化学成分もまた環境特異的な成分を有している傾向があり,適応形質である可能性がある.ゲノム解析については台湾産種1種について,ロングリード及びショートリードシーケンスを組み合わせたリファレンスゲノムを構築中である.

Strategy for Future Research Activity

他3種をめどにゲノムリシーケンスを予定しており,各種の集団動態推定等を行う予定である.生育環境の評価については,引き続き環境データの取得を続け,ゲノム,環境,適応形質データを集積することで平行適応放散の進化要因を検証していく予定である.

  • Research Products

    (10 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Academia Sinica(その他の国・地域 台湾)

    • Country Name
      その他の国・地域
    • Counterpart Institution
      Academia Sinica
  • [Int'l Joint Research] Zhejiang University/South China Botanical Garden(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Zhejiang University/South China Botanical Garden
  • [Int'l Joint Research] NIBR(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      NIBR
  • [Journal Article] Evolutionary origin of a periodical mass‐flowering plant2019

    • Author(s)
      Kakishima Satoshi, Liang Yi‐shuo, Ito Takuro, Yang Tsung-Yu Aleck, Lu Pei‐Luen, Okuyama Yudai, Hasebe Mitsuyasu, Murata Jin, Yoshimura Jin
    • Journal Title

      Ecology and Evolution

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      https://doi.org/10.1002/ece3.4881

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Reconsiderations of Distribution and Taxonomic Status of Infraspecific Taxa in Sedum japonicum (Crassulaceae) Based on Morphological and Molecular Data2018

    • Author(s)
      Takuro Ito, Chih-Chieh Yu, Goro Kokubugata
    • Journal Title

      Bulletin of the National Museum of Nature and Science. Series B, Botany

      Volume: 44(2) Pages: 73-83

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] RAD-seq解析により明らかになったハママンネングサ種内における隠蔽系統の存在2019

    • Author(s)
      伊東 拓朗・游 旨价・鍾 國芳・横田 昌嗣・永野 惇・國府方 吾郎
    • Organizer
      日本植物分類学会第18回大会
  • [Presentation] Niche conservatism promotes ecological speciation in the cycad Dioon merolae (Zamiaceae) in Mexico2019

    • Author(s)
      Guterrez-Ortega Jose Said・Salinas-Rodriguez Maria Magdalena・伊東拓朗・ Perez-Farrera Miguel Angel・Vovides Andrew P.・Martinez Jose F.・Molina-Freaner Francisco・ Hernandez-Lopez Antonio・川口利奈・永野惇・綿野泰行・梶田忠・高橋佑磨・村上正志
    • Organizer
      日本植物分類学会第18回大会
  • [Presentation] ハウチワノキにおける核DNAデータを用いた小笠原・琉球への進入追跡2019

    • Author(s)
      國府方吾郎・伊東拓朗・鈴木裕美子・村上哲明・横田昌嗣
    • Organizer
      日本植物分類学会第18回大会
  • [Presentation] マンネングサ属の特異な生き様に着目した植物進化研究2018

    • Author(s)
      伊東 拓朗
    • Organizer
      日本植物分類学会講演会
    • Invited
  • [Presentation] Unique parallel adaptive radiations of genus Sedum (Crassulaceae) in a continental island of Taiwan2018

    • Author(s)
      Takuro ITO・Chih-Chieh YU・Kuo-Fang CHUNG・Goro KOKUBUGATA
    • Organizer
      The 2nd International Academic Conference on the Formation Mechanism of Plant Diversity and Conservation of Endangered Plants in East Asia
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2019-12-27   Modified: 2022-08-19  

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