Development of genetic test method utilizing DNA sequence recognition characteristics of TALE.

2020 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 18K04849
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
• Research Institution: University of Toyama
• Principal Investigator: Sakono Masafumi 富山大学, 学術研究部工学系, 准教授 (50391959)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: 遺伝子検査 / TALEN / ゲノム編集

Outline of Final Research Achievements

When TALE was prepared by deliberately introducing a mismatch at a specific position, the difference in one base of DNA was clearly distinguished, and the dissociation constant changed dramatically. TALEN produced by the mismatch method selectively cleaved the target sequence, and did not cleave non-target sequences that differed by one base. This result means that the TALE prepared by the mismatch method has higher sequence specificity and accuracy than the TALE prepared by the conventional method.

Free Research Field

タンパク質工学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ゲノム編集技術は細胞の特定の遺伝子を塩基配列特異的に編集できる技術だが、類似の塩基配列をもつ目的外の遺伝子の編集リスクが存在する。オフターゲット効果の低減は、発がんリスクの低減において極めて重要である。現在の塩基配列分析法において、in vivo遺伝子修正による目的遺伝子以外の遺伝子改変が生じた際の、改変部位の特定は非常に難しいといわれている。オフターゲット変異はゲノムワイドに生じることから、精度の高い全ゲノムシーケンス解析が要求される。したがって、意図しない編集が行われた際の部位特定は現状困難であり、治療の安全性を担保するには、正確性の高い遺伝子編集技術の開発が極めて重要であるといえる。